2013 Fiscal Year Annual Research Report
天然ラージ・リボザイムを用いたシグナル多重増幅・並列処理RNAデバイスの創成
Publicly Offered Research
Project Area | Development of Molecular Robots equipped with sensors and intelligence |
Project/Area Number |
25104518
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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Research Institution | University of Toyama |
Principal Investigator |
井川 善也 富山大学, 大学院理工学研究部(理学), 教授 (70281087)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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Keywords | リボザイム / RNA / ナノデバイス / RNAデバイス / 自己増幅 |
Research Abstract |
本研究では、高度な機能を有するグループIリボザイム(GI-Rz)のRNAデバイスにおける新たな分子パーツとしての展開を開拓する。GI-Rzを申請者らが開拓した「RNAモジュール工学」により改変し、RNAデバイス・コンポーネントの基幹部分の構築を行う。具体的な課題として、課題[1] 入力刺激に応答して作動するスプライシングGI-Rzアクチベータの構築、課題[2] オートクリン(自己シグナル増幅)型スプライシングGI-Rzの構築、課題[3] 転写誘導スプライシングGI-Rzの構築を並行して実施した。 H25年度は、課題[1]について、P5アクチベータの機能とHH-Rzの機能に必要な塩基配列を勘案しつつ、「マスクされたOFF状態(図-左)」と「切断された活性ON構造」の双方を満足するRNA配列の候補のデザインを完了した。課題[2]について、RNAアクチベータをエキソン配列としてGI-Rzを挿入するには、イントロン/エキソン機能とアクチベータ/リボザイム機能の双方を維持できる配列デザインと挿入部位を三カ所選定し、生化学解析を行い、最もリボザイムのスプライシング効率の高い部位を同定し、オートクリン反応の予備実験を行ったが、現在のところ有為な自己増幅には至っていない。課題[3]については、本課題では転写プロモータ活性とスプライシング活性を両立可能な配列改変の候補デザインを選定し、必要なDNA/RNAキメラ型核酸の化学合成を行った。今後はイントロンと連結し、反応活性な全長配列を構築する。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
主たる達成度の遅延の原因は研究計画によるものではなく、研究代表者が年度途中で所属大学を移籍したことにより研究従事者・設備も含め研究活動の中断が生じたためである。幸いH25年度内に全設備と学生の移設が完了し、研究活動を再開できた。
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Strategy for Future Research Activity |
富山大学への移籍に伴い、研究設備の移設は完了したため研究継続に支障はない。ただし研究室の人員が大幅に交代したため転任に伴う中断を挽回する実験ペースが確保できるかは、やや不安がある。中期的展望に立ち、闇雲にペースアップを図ることは避け、着実に研究成果をあげる事を優先しつつ、当初目標の出来る限りの達成を目指したい。
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