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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物病原体の感染戦略と細胞外免疫応答

Publicly Offered Research

Project AreaPlant cell wall as information-processing system
Project/Area Number 25114521
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

吉田 聡子  独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 (20450421)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords寄生植物 / 細胞壁 / トランスクリプトーム
Outline of Annual Research Achievements

1.インターフェイスにおける細胞壁成分の解析
異なる宿主非宿主に感染した際のインターフェイス細胞の細胞壁成分の解析をおこなった。細胞壁成分の変化と感染時のトランスクリプトームを比較することにより、宿主への侵入の際におこる細胞外での攻防が細胞壁にどのような影響を与えるかを解析した。
2.病原体感染時の宿主植物および病原体でのインターフェイスとなる細胞での発現解析
レーザーマイクロダイセクションを用いてRNAを抽出し、次世代シークエンサー(HiSEQ2000)等でマルチプレックス法を用いてシークエンスする。ゲノムレファレンス配列にRNA-seqの結果をマップし、統計学的に有意に発現が検出される分泌タンパク質を探索すした。
上記の研究によって同定されたタンパク質の機能を推定するために、局在解析をおこなった。まずこのタンパク質がインターフェイスにおいてどこに発現しているかを確認するため、プロモーター領域を単離した。
特異的発現パターンが解析された場合には、さらにジーンサイレンシングのコンストラクトを作製した。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Transcriptomics exposes the uniqueness of parasitic plants2015

    • Author(s)
      Ichihashi, Y, Mutuku, J.M, Yoshida, S and Shirasu, K.
    • Journal Title

      Briefing in functional genomics

      Volume: 0 Pages: 0

    • DOI

      doi: 10.1093/bfgp/elv001

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 寄生植物ストライガの抵抗性におけるジャスモン酸とサリチル酸シグナル経路の役割2015

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      日本植物病理学会
    • Place of Presentation
      明治大学
    • Year and Date
      2015-03-28 – 2015-03-31
  • [Presentation] 寄生植物と宿主植物の細胞壁をめぐる攻防2015

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16
    • Invited
  • [Presentation] Molecular and genomic analyses of the witchweed Striga2014

    • Author(s)
      Satoko Yoshida
    • Organizer
      筑波大学 Global Science week
    • Place of Presentation
      筑波大学
    • Year and Date
      2014-09-29
    • Invited
  • [Presentation] 寄生植物ストライガ感染時における 細胞壁関連遺伝子の発現変動と細胞壁成分の変化2014

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      細胞壁ネットワーク研究会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-26
  • [Presentation] 寄生植物ストライガの全ゲノム解読2014

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      日本植物学会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] ゲノム・トランスクリプトーム解析からみた植物の寄生2014

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      ゲノム・トランスクリプトーム解析からみた植物の寄生
    • Place of Presentation
      ニセコ
    • Year and Date
      2014-08-07
    • Invited
  • [Presentation] 寄生植物ストライガの感染戦略と宿主植物の応答2014

    • Author(s)
      吉田聡子
    • Organizer
      シンポジウム「寄生・共生インシデント」
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2014-04-28
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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