2013 Fiscal Year Annual Research Report
トップダウンリン酸化プロテオミクスを指向したアフィニティー磁気ビーズの創出
Publicly Offered Research
| Project Area | Regulation of signal transduction by post-translational modifications and its pathogenic dysregulation |
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| Project/Area Number |
25117718
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
木下 英司 広島大学, 医歯薬保健学研究院, 准教授 (80304418)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | フォスタグ / リン酸化 / プロテオーム / 翻訳後修飾 / マグネットビーズ |
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| Research Abstract |
これまでに申請者は，リン酸基を特異的に捕捉する亜鉛錯体（フォスタグ）をクロマト担体であるアガロースビーズに固定化させた分離剤を開発している。しかしながらこの分離剤は，迅速性と簡便性の点で課題を残していた。本研究では，迅速性や簡便性において特に優れたマグネット技術とフォスタグ技術を融合させることで従来の課題を解決する。当該年度では，市販の磁気ビーズを導入した新規誘導体の合成とその機能性の検証を試みた。以下に研究の成果を列記する。
１）最適な合成法の検証，固定化させるフォスタグ量の最適化検証：一級アミノ基を１つ持つフォスタグ誘導体にGE社製のMag Sepharoseを導入した。このMag Sepharoseは，カルボキシル基末端が活性化したNHS基をもつので，アミド結合を介して効率よくフォスタグを固定化させることができた。残存するNHS活性化基は，トリスヒドロキシメチルアミノメタンと反応させることで取り除いた。その後，酢酸亜鉛を加え，フォスタグ配位子に亜鉛イオンを配位させることでフォスタグ磁気ビーズを得た。この磁気ビーズのフォスタグ固定化量は8 μmol/ ml-beads で，フェニルリン酸による結合部位は4 μmol/ml-beadsであった。
２）低分子量リン酸化生体分子の分離精製：上記の新規誘導体を利用することで，様々な生体分子(ペプチド,アミノ酸,核酸など)が分離精製できるか検討した。その結果，この磁気ビーズは酸性条件で不安定なリン酸化生体分子にも用いることができるとわかった。
３）リン酸化ペプチドの分離：タンパク質のトリプシン消化物の中からリン酸化ペプチドのみを分離精製できるか調べた。その結果，フォスタグ磁気ビーズは消化されたペプチド混合物中から，特異的なリン酸化ペプチドのみを高い回収率で分取できることがわかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の予定通り，当該年度において，リン酸基を特異的に認識する機能性分子，フォスタグを固定化させた新規のフォスタグ磁気ビーズを開発することができた。この磁気ビーズを利用して当初の計画通りに検討を行った結果，次の様な特徴を示すことを明らかにすることができた。１）低分子量のリン酸化生体分子を選択的に分離精製できる，２）リン酸化生体分子の回収率が高い,３）すべての操作を中性条件下で行うことができる,４）操作時間が短い (12分以内), ５）少なくとも１５回の再利用ができる，６）少なくとも６ヶ月の保存が可能である。
このように，当該年度で開発することができた新規のフォスタグ磁気ビーズを用いたリン酸化生体分子の分離精製法が，今後のリン酸化プロテオミクス，メタボロミクス研究の発展に大きく貢献することが期待できたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は，このフォスタグ磁気ビーズを利用することで，細胞内において様々なリン酸化状態で混在するリン酸化タンパク質群を，それらの分子量情報を失わずに分取・濃縮するための簡便・高効率，かつ，高精度なアッセイ法を確立する。これを達成することで「トップダウンリン酸化プロテオミクス」を指向した分析技術を創出しする。高効率，かつ，高精度に分離，検出された疾患関連タンパク質群の情報が，創薬やオーダーメード等の先進的医療に寄与することを証明していきたい。
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Research Products
(29 results)
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[Journal Article] Profiling of protein thiophosphorylation by Phos-tag affinity electrophoresis: evaluation of adenosine 5′-O-(3-thiotriphosphate) as a phosphoryl donor in protein kinase reactions2014
Author(s)
Eiji Kinoshita, Kinoshita-Kikuta, E., Shiba, A., Edahiro, K., Inoue, Y., Yamamoto, K., Yoshida, M., and Koike, T.
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Journal Title
Proteomics
Volume: 14
Pages: 668-679
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] A Phos-tag-based magnetic-bead method for rapid and selective separation of phosphorylated biomolecules.2013
Author(s)
Tsunehiro, M., Meki, Y., Matsuoka, K., Kinoshita-Kikuta, E., Eiji Kinoshita, and Koike, T.
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Journal Title
J. Chromatogr. B. Analyt. Technol. Biomed. Life. Sci.
Volume: 925
Pages: 86-94
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Excystment-dependent alteration of protein expression in terrestrial ciliate Colpoda cucullus.2013
Author(s)
Sogame, Y., Kojima, K., Takeshita, T., Eiji Kinoshita, Funadani, R., and Matsuoka, T.
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Journal Title
Microbes Environ.
Volume: 28
Pages: 388-390
Peer Reviewed
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[Journal Article] Increase in Lipophilicity of Enalaprilat by Complexation with Copper(II) or Zinc(II) Ions.2013
Author(s)
Fujioka, H., Hieda, Y., Kuramoto, Y, Konishi, K., Kinoshita-Kikuta, E., Eiji Kinoshita, and Koike T.
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Journal Title
Yakugaku Zasshi
Volume: 33
Pages: 1135-1141
Peer Reviewed
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