2014 Fiscal Year Annual Research Report
B細胞系列への運命決定を制御する転写ネットワークの解明
Publicly Offered Research
| Project Area | Molecular mechanisms of cell fate determination in the cells that undergo stepwise differentiation to multiple pathways |
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| Project/Area Number |
25118732
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| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
伊川 友活 独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60450392)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | B細胞分化 / 運命決定 / 転写因子 / エピジェネティクス / リンパ球 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
B細胞を含むすべての血液・免疫細胞は造血幹細胞から作られる。その過程で多能性の造血幹細胞は徐々に分化能が限定されていき、最終的にB細胞にしかなれない前駆細胞に運命決定される。E2A、EBF1、PAX5など様々な転写因子がB細胞への運命決定に関わっているが、詳細は明らかでない。特にこれらの転写因子同士がどのようなネットワークを形成し、B細胞への運命決定を制御しているのか不明である。申請者らは最近このB細胞への運命決定に必要な転写ネットワークを調べる新しい分化誘導系を開発した。
そこで本研究では、培養細胞の遺伝子発現を網羅的に解析し転写因子間ネットワークのモデルを構築することを目的とした。本年度は研究計画に基づき、多能前駆細胞株（iLS細胞）からB細胞系列へ分化誘導後の経時サンプルを用いて網羅的な遺伝子発現解析（RNA-seq）およびエピジェネティック解析（ChIP-seq）を行った。さらにこのデータを元にバイオインフォマティクス解析を行った。
RNA-seq解析から転写因子の発現パターンによっていくつかのクラスターに分けられることが明らかとなった。培養0.5~1時間で誘導される転写因子（Nfil3, Nr4aなど)、培養2～4時間で誘導される転写因子（Tead1, Sox9など）、更にその後に誘導される転写因子（Ebf1, Pax5など）が存在することが明らかとなった。すなわち、Ebf1やPax5などB細胞特異的転写因子が発現する以前に、転写因子群が一過的かつダイナミックに次々と誘導されることが明らかとなった。これらのいわば転写カスケードがB細胞への運命決定を制御していると考えられる。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Gene regulation. Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells2015
Author(s)
Arner E, Daub CO, Vitting-Seerup K, Andersson R, Lilje B, Drablos F, Lennartsson A, Ronnerblad M, Hrydziuszko O, Vitezic M, Freeman TC, Alhendi AM, Arner P, Axton R, Baillie JK, Beckhouse A, Bodega B, Briggs J, Brombacher F, Davis M, Detmar M, Ehrlund A, Endoh M, Eslami A, Fagiolini M, et al.
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Journal Title
Science
Volume: 347
Pages: 1010-1014
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] The transcription repressors Bach2 and Bach1 promote B cell development by repressing the myeloid program2014
Author(s)
Itoh-Nakadai A, Hikota R, Muto A, Kometani K, Watanabe-Matsui M, Sato Y, Kobayashi M, Nakamura A, Miura Y, Yano Y, Tashiro S, Sun J, Ikawa T, Ochiai K, Kurosaki T, Igarashi K.
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Journal Title
Nat Immunol
Volume: 12
Pages: 1171-1180
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 controls humoral immunity by modulating B-cell receptor signal strength2014
Author(s)
Hojyo S, Miyai T, Fujishiro H, Kawamura M, Yasuda T, Hijikata A, Bin BH, Irie T, Tanaka J, Atsumi T, Murakami M, Nakayama M, Ohara O, Himeno S, Yoshida H, Koseki H, Ikawa T, Mishima K, Fukada T.
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A.
Volume: 111
Pages: 11786-11791
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 facilitates antiapoptotic signaling during early B-cell development2014
Author(s)
Miyai T, Hojyo S, Ikawa T, Kawamura M, Irie T, Ogura H, Hijikata A, Bin BH, Yasuda T, Kitamura H, Nakayama M, Ohara O, Yoshida H, Koseki H, Mishima K, Fukada T.
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci U S A.
Volume: 111
Pages: 11780-11785
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] The epigenetic regulator Uhrf1 facilitates the proliferation and maturation of colonic regulatory T cells2014
Author(s)
Obata Y, Furusawa Y, Endo TA, Sharif J, Takahashi D, Atarashi K, Nakayama M, Onawa S, Fujimura Y, Takahashi M, Ikawa T, Otsubo T, Kawamura YI, Dohi T, Tajima S, Masumoto H, Ohara O, Honda K, Hori S, Ohno H, Koseki H, Hase K.
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Journal Title
Nat Immunol.
Volume: 6
Pages: 571-579
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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