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2014 Fiscal Year Annual Research Report

バクテリアべん毛蛋白質輸送スイッチの分子基盤

Publicly Offered Research

Project AreaStructural basis of cell-signalling complexes mediating signal perception, transduction and responses
Project/Area Number 25121718
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

南野 徹  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (20402993)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords蛋白質 / 細菌 / 電子顕微鏡 / 分子モーター / 生物物理
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、X 線結晶構造解析と極低温電子線トモグラフィー法による構造解析を組み合わせることで、フック完成シグナルに伴う輸送装置の基質認識モード切り替え機構を原子レベルで解明することを目指している。本年度の主な成果は以下に示す。
1.FlhAC(F459A)およびFlhAC(T490M)の結晶構造の精密化を行い、野生型FlhACの構造と比較した結果、野生型FlhAC はsemi-closed 構造をとっていたのに対し、FlhAC(F459A)およびFlhAC(T490M)はOpen構造をとっていることが判明した。さらに、FlhAcとそのN末膜貫通領域とをつなぐリンカーが伸びている向きがsemi-closed 構造とopen構造の間で異なっていることが明らかとなった。
2.比較的安定なFlgN/FlgK/FlhAc/FliJ複合体を単離精製することができた。
3.サルモネラ由来のFlgNの結晶構造から、細菌の間で高く保存されているAsp-92, Asp-95, Ile-103がα3ヘリックスの同一面上に存在していた。そこで、これらのアミノ酸残基をアラニンに置換すると、FlgKに対する結合親和性が顕著に低下した。これら3残基を同時にアラニンに置換すると、FlgKに全く結合できなくなった。このことから、Asp-92, Asp-95, Ile-103がFlgKとの相互作用に直接関与していることが示唆された。さらに、FlgNのα1ヘリックスとα2ヘリックスの間に位置するループ構造がFlgNの輸送シャペロン活性を制御する構造スイッチとして働いていることが明らかとなった。
4.サルモネラからべん毛蛋白質輸送活性を示す反転小胞膜の調製に成功した。クライオ電子線トモグラフィー法によりべん毛基部体MS-Cリング複合体の内部に輸送装置が存在することが確認できた。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Protein export through the bacterial flagellar type III export pathway.2014

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta.

      Volume: 1843 Pages: 1642-1648

    • DOI

      10.1016/j.bbamcr.2013.09.005.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the periplasmic domain of FliP, an integral membrane component of the bacterial flagellar type III protein export apparatus.2014

    • Author(s)
      Fukumura, T.
    • Journal Title

      Acta. Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.

      Volume: F70 Pages: 1215-1218

    • DOI

      10.1107/S2053230X14014678

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assembly dynamics and the roles of FliI ATPase of the bacterial flagellar export apparatus2014

    • Author(s)
      Bai, F.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 4 Pages: 6528

    • DOI

      10.1038/srep06528

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The bacterial flagellar protein export apparatus processively transports flagellar proteins even with extremely infrequent ATP hydrolysis.2014

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 4 Pages: 7579

    • DOI

      10.1038/srep07579

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 細菌べん毛のIII型分泌装置の再構築2015

    • Author(s)
      Terashima, H.
    • Organizer
      第88回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長良川国際会議場(岐阜県)
    • Year and Date
      2015-03-26
    • Invited
  • [Presentation] べん毛蛋白質輸送システムのロバストネスを支える分子機構2015

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Organizer
      2014年度べん毛研究交流会
    • Place of Presentation
      合歓の郷リゾートホテル(三重県)
    • Year and Date
      2015-03-02
  • [Presentation] Identification of a structural switch of FlgN to control its chaperone activity.2015

    • Author(s)
      Kinoshita, M.
    • Organizer
      2014年度べん毛研究交流会
    • Place of Presentation
      合歓の郷リゾートホテル(三重県)
    • Year and Date
      2015-03-02
  • [Presentation] Identification of a structural switch of FlgN to control its chaperone activity.2015

    • Author(s)
      Kinoshita, M.
    • Organizer
      HFSP Japan meeting
    • Place of Presentation
      ルスツリゾート(北海道)
    • Year and Date
      2015-02-24
  • [Presentation] Structural characterization of FliP, a component of the type III flagellar protein export apparatus2015

    • Author(s)
      Fukumura, T.
    • Organizer
      BLAST XIII
    • Place of Presentation
      Hilton Tucson East, Arizona, USA
    • Year and Date
      2015-01-18 – 2015-01-23
  • [Presentation] バクテリアべん毛輸送におけるFliI ATPaseの作用機構2015

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Organizer
      2015年生体運動班会議
    • Place of Presentation
      学習院大学(東京)
    • Year and Date
      2015-01-09
  • [Presentation] べん毛III型輸送シャペロンFlgNの構造とFlhAとの相互作用 (Structure of FlgN, a flagellar type III export chaperone, and its interaction with FlhA, a flagellar type III export gate protein.)2014

    • Author(s)
      Ogawa, Y.
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] 細菌III型分泌装置のin vitro輸送再構成系の構築 (Construction of an in vitro transport assay system for the bacterial type III protein secretion)2014

    • Author(s)
      Terashima, H.
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] In situ structures of Salmonella injectisome and flagellar type III secretion systems by electron cryotomography.2014

    • Author(s)
      Kawamoto, A.
    • Organizer
      2014 International Biophysics Congress
    • Place of Presentation
      Brisbane Convention & Exhibition Centre, Brisbane, Australia
    • Year and Date
      2014-08-04
  • [Presentation] バクテリアべん毛蛋白質輸送ゲート構成因子FliPペリプラズムドメインのX線結晶構造解析.2014

    • Author(s)
      Fukumura, T.
    • Organizer
      第11回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      ホテル大観(岩手県)
    • Year and Date
      2014-06-05 – 2014-06-06
  • [Remarks] 大阪大学大学院生命機能研究科プロトニックナノマシン研究室

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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