2013 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム複製プログラム制御におけるゲノムアダプテーションの分子機構
Publicly Offered Research
| Project Area | Systematic study of chromosome adaptation |
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| Project/Area Number |
25125724
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| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
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Principal Investigator |
正井 久雄 公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医科学研究分野, 基盤技術研究センター長 (40229349)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 複製プログラム / 複製起点 / 複製タイミング / Cdc7キナーゼ / 染色体ドメイン / グルコース |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Rif1の染色体結合部位をChIP-Seqで解析するために免疫沈降可能な新規抗体を作製した。この抗体はChIPに使用可能であることが明らかになったので、マウスES細胞を用いて、まずRif1欠損により遺伝子発現が大きく変動する遺伝子領域の近傍にRif1が結合するかどうかをChIP-qPCRにより検討した。Rif1の染色体結合部位をChIP-Seqで解析するために免疫沈降可能な新規抗体を作製した。この抗体はChIPに使用可能であることが明らかになったので、マウスES細胞を用いて、まずRif1欠損により遺伝子発現が大きく変動する遺伝子領域の近傍にRif1が結合するかどうかをChIP-qPCRにより検討した。さらに、ChIP-Seqも行った。ゲノム全域にわたり、結合部位が観察されたが、これらが真の結合部位をrepresentしているかどうかのvalidationを現在行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ChIP seq による Rif結合部位の解析は、抗体や、シグナルに問題がありやや予定よりおくれてしまった。
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| Strategy for Future Research Activity |
ようやくよい抗体も得られたので、ヒト細胞およびマウスES細胞でゲノムワイドのRif1結合部位を決定し、その配列の特異性を明らかにする。
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| Remarks |
研究成果の一部については 東京都医学総合研究所 ゲノム医科学研究分野 ゲノム動態プロジェクトのホームページ（http://www.igakuken.or.jp/genome/） において紹介しております。
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Research Products
(16 results)
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[Journal Article] ATR-Chk1-APC/CCdh1-dependent stabilization of Cdc7-ASK(Dbf4) kinase complex is required for DNA damage bypass under replication stress.2013
Author(s)
Yamada, M., Watanabe, K., Mistrik, M., Mailand, N., Lee, M-H., Masai, H., Lukas, J. and *Bartek, B.
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Journal Title
Genes and Development
Volume: 288
Pages: 2459-72
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] The Human Tim/Tipin Complex Directly Interacts with DNA Polymerase {epsilon} and Stimulates its Synthetic Activity.2013
Author(s)
Aria, V., De Felice, M., Di Perna, R., Uno, S., Masai, H., Syvaoja, J.E., van Loon, B., Hubscher, U. and *Pisani, F.M.
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Journal Title
J. Biol. Chem.
Volume: 288
Pages: 12742-12752
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Analysis of epigenetic stability and conversions in Saccharomyces cerevisiae reveals a novel role of CAF-I in position-effect variegation2013
Author(s)
Jeffery, D.C., Wyse, B.A., Rehman, M.A., Brown, G.W., You, Z., Oshidari, R., Masai, H. and *Yankulov, K.Y.
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Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 41
Pages: 8475-8488
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Role of multifunctional transcription factor TFII-I and putative tumour suppressor DBC1 in cell cycle and DNA double strand damage repair.2013
Author(s)
Tanikawa, M., Wada-Hiraike, O., Yoshizawa-Sugata, N., Shirane A, Hirano M, Hiraike H, Miyamoto, Y., Sone, K., Ikeda, Y., Kashiyama, T., Oda K, Kawana K, Katakura Y, Yano T, Masai, H., Roy AL, Osuga, Y. and *Fujii, T.
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Journal Title
Br. J. Cancer.
Volume: 109
Pages: 3042-3048
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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