2014 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノム複製プログラム制御におけるゲノムアダプテーションの分子機構
Publicly Offered Research
| Project Area | Systematic study of chromosome adaptation |
|---|
| Project/Area Number |
25125724
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science |
|---|
Principal Investigator |
正井 久雄 公益財団法人東京都医学総合研究所, ゲノム医科学研究分野, 基盤技術研究センター長 (40229349)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
|
| Keywords | 複製プログラム / 複製起点 / 複製タイミング / Cdc7キナーゼ / チェックポイント / DNA損傷 / 栄養条件 / Rif1 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
１ 出芽酵母を用いてDSB導入によりその近傍のdormant ori (休眠複製起点)が活性化されるメカニズムを検討する。1) DSB導入前と後でRif1およびKu複合体の結合部位は変動していなかった。しかし、DSB導入部位の近傍に強いRif1結合部位を同定した。2) ChIP-Seqにより、出芽酵母ゲノム全体におけるRif1の結合部位を決定した。
２ ゲノムワイドの複製プログラム制御に及ぼす因子の解析 1) cohesion, condensing, CTCFなどのknockdown が複製タイミングに及ぼす影響を調べた。しかし、顕著の影響は観察されなかった。同じ条件下でRif1KDは複製タイミングをゲノムワイドに大きく変化させる。
３ チェックポイントによる局所的複製プログラム制御機構 1)Mrc1はチェックポイント依存的と非依存的の二つの独立の経路で複製タイミングを制御することが明らかとなった。 2) チェックポイント非依存的な複製開始抑制経路はMrc1上のHBSドメインに依存する。ここにはHsk1キナーゼが結合し、Mrc1をリン酸化することによりそのconformationを変化させ、活性型に変化させる。HSBが欠損すると、Mrc1は常に活性化型になるためにHsk1をバイパスできると考えられる。
４ Rif1の染色体結合部位をChIP-Seqで解析するために免疫沈降可能な新規抗体を作製した。この抗体はChIPに使用可能であることが明らかになったので、マウスES細胞を用いて、まずRif1欠損により遺伝子発現が大きく変動する遺伝子領域の近傍にRif1が結合するかどうかをChIP-qPCRにより検討した。
|
| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Remarks |
研究成果の一部については 東京都医学総合研究所 ゲノム医科学研究分野 ゲノム動態プロジェクトのホームページ（http://www.igakuken.or.jp/genome/） において紹介しております。
|
Research Products
(14 results)
-
[Journal Article] CDC28 phosphorylates Cac1p and regulates the association of Chromatin Assembly Factor I with chromatin.2015
Author(s)
Jeffery, D., Kakusho, N., You, Z., Gharib, M., Wyse, B., Drury, E., Weinreich, M., Thibault, P. Verreault, A., Masai, H. and Yankulov, K.
-
Journal Title
Cell Cycle
Volume: 14
Pages: 74-85
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
-
[Journal Article] NCOA4 Transcriptional Coactivator Inhibits Activation of DNA Replication Origins.2014
Author(s)
Bellelli, R., Castellone, M.D., Guida, T., Limongello, R., Dathan, N.A., Merolla, F., Cirafici, A.M., Affuso, A., Masai, H., Costanzo, V., Grieco, D., Fusco, A., Santoro, M., and Carlomagno, F.
-
Journal Title
Mol. Cell
Volume: 55
Pages: 123-137
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
