2014 Fiscal Year Annual Research Report
数理的統計的解析による難治性癌幹細胞システムの解明と創薬応用
Publicly Offered Research
| Project Area | Integrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention |
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| Project/Area Number |
25134711
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
石井 秀始 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任教授(常勤) (10280736)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 癌 / トランスレーショナルリサーチ / 発現制御 / 薬学 / バイオテクノロジー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
前年度に引き続き、数理的統計的解析の手法を活用して難治性消化器癌幹細胞システムの多様性を解明し、出口戦略として創薬outputを導出に向けて研究した。本研究では難治性消化器癌幹細胞（膵癌・転移性大腸癌）を対象にして、最新の生体ｲﾒｰｼﾞﾝｸﾞ技術で「多様性」細胞を捕捉した材料を用いて、抗癌剤暴露後に残存する寡少細胞群の個々細胞ﾚﾍﾞﾙの時系列遺伝子発現情報を最先端ｼｰｸｴﾝｽ技術で取得しﾋﾄｹﾞﾉﾑ情報を参照してｽｰﾊﾟｰｺﾝﾋﾟｭｰﾀｰを用いた数理的・情報科学的方法論を適用した。【生物研究】（１）細胞間多様性：癌幹細胞を生体ｲﾒｰｼﾞﾝｸﾞ（GFP-Degron)により細胞を1細胞ﾚﾍﾞﾙまで分離、高性能力取装置(AriaII,阪大）で収集。(2)細胞内多様性:多中発現量遺伝子は次世代ｼｰｸｴﾝｽにより、また小発現量遺伝子はHiCEP法(polyA+）により、mRNAおよび非コードRNAを解析。(３)時系列データ（細胞実験）【数理解析】(1)癌幹細胞細胞間多様性、(2)細胞内多様性(3)サブネットワークを抽出。【POC(proof-of-concept)確認】(１)臨床データ。(２)試験管内実験。これらを基にして癌幹細胞に特徴的なオートミックス解析を行い、エピゲノムと転写、転写と代謝を結びつけて数理的統計的なエビデンスに基づく創薬の創出に向けて基盤を構築した。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Ultra-sensitive liquid biopsy of circulating extracellular vesicles using ExoScreen.2014
Author(s)
Yoshioka, Y., Kosaka, N., Konishi, Y., Ohta, H., Okamoto, H., Sonoda, H., Nonaka, R., Yamamoto, H., Ishii, H., Mori, M., Furuta, K., Nakajima, T., Hayashi, H., Sugisaki, H., Higashimoto, H., Kato, T., Takeshita, F., Ochiya, T.
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Journal Title
Nat. Commun.
Volume: 7
Pages: 3591
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] LZTS1 downregulation confers paclitaxel resistance and is associated with worse prognosis in breast cancer.2014
Author(s)
Lovat, F., Ishii, H., Schiappacassi, M., Fassan, M., Barbareschi, M., Galligioni, E., Gasparini, P., Baldassarre, G., Croce, CM., Vecchione, A.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 5
Pages: 970-977
Peer Reviewed
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[Journal Article] CD10 as a novel marker of therapeutic resistance and cancer stem cells in head and neck squamous cell carcinoma.2014
Author(s)
Fukusumi, T., Ishii, H., Konno, M., Yasui, T., Nakahara, S., Takenaka, Y., Yamamoto, Y., Nishikawa, S., Kano, Y., Ogawa, H., Hasegawa, S., Hamabe, A., Haraguchi, N., Doki, Y., Mori, M., Inohara, H.
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Journal Title
Br. J. Cancer
Volume: 111
Pages: 506-514
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] MicroRNA-1246 expression associated with CCNG2-mediated chemoresistance and stemness in pancreatic cancer.2014
Author(s)
Hasegawa, S., Eguchi, H., Nagano, H., Konno, M., Tomimaru, Y., Wada, H., Hama, N., Kawamoto, K., Kobayashi, S., Nishida, N., Koseki, J., Nishimura, T., Gotoh, N., Ohno, S., Yabuta, N., Nojima, H., Mori, M., Doki, Y., Ishii, H.
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Journal Title
B.r J. Cancer
Volume: 111
Pages: 1572-1580
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Combined evaluation of hexokinase 2 and phosphorylated pyruvate dehydrogenase-E1α in invasive front lesions of colorectal tumors predicts cancer metabolism and patient prognosis.2014
Author(s)
Hamabe, A., Hirofumi, Y., Konno, M., Uemura, M., Nishimura, J., Hata, T., Takemasa, I., Mizushima, T., Nishida, N., Kawamoto, K., Koseki, J., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 105
Pages: 1100-1108
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Role of pyruvate kinase M2 in transcriptional regulation leading to epithelial-mesenchymal transition.2014
Author(s)
Hamabe, A., Konno, M.,Tanuma, N., Shima, H., Tsunekuni, K., Kawamoto, K., Nishida, N., Koseki, J.,Mimori, K., Gotho, N., Yamamoto, H., Doki, Y., Mori, M., Ishii, H.
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Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.
Volume: 111
Pages: 15526-15531
DOI
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