2014 Fiscal Year Annual Research Report

非コードRNAとがんゲノム解読との統合的解析による新たながんゲノム像の描出

Publicly Offered Research

Project Area	Integrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention
Project/Area Number	25134720
Research Institution	National Cancer Center Japan
Principal Investigator	柴田龍弘独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (90311414)
Project Period (FY)	2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords	第3世代シークエンサー / 非コードRNA / がんゲノム
Outline of Annual Research Achievements	第3並びに第2世代シークエンス技術融合について検討を進め、第２世代からのshort sequence dataを用いたエラー修正について情報解析パイプラインを確立した。またAgilent sureselectを母体としたlincRNA濃縮技術の開発を行なった。計画研究A02-4並びに公募研究A01-11-25と密接な連携の下で、全ゲノム変異情報からのlincRNAを含めたnon-coding領域変異検出のための解析パイプラインを構築し、recurrentな変異を同定し、検証できた。更に同一検体における全ゲノムバイサルファイトシークエンスデータとの比較によって、lincRNA発現状態、ゲノム変異頻度、染色体構造異常部位におけるメチル化状態を詳細に比較することができた。
Research Progress Status	26年度が最終年度であるため、記入しない。
Strategy for Future Research Activity	26年度が最終年度であるため、記入しない。