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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ヒトカルシトニンのアミロイド線維形成および阻害の分子機構の解明

Publicly Offered Research

Project AreaDynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions
Project/Area Number 26102514
Research InstitutionYokohama National University

Principal Investigator

内藤 晶  横浜国立大学, 工学(系)研究科(研究院), 名誉教授 (80172245)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsカルシトニン / アミロイド線維 / 固体NMR / 電子顕微鏡 / 分子動力学
Outline of Annual Research Achievements

カルシトニンはカルシウム代謝に重要な役割を果たしているペプチドホルモンであり、骨粗鬆症の治療薬としても使用されているが、高濃度中性水溶液中で容易にアミロイド線維を形成して沈殿する性質が知られている。本研究ではヒトカルシトニン(hCT)のアミロイド線維形成過程を解明するため、固体NMR、TEMおよび分子動力学計算の手法を用いて線維形成反応機構の解析、線維の立体構造決定を行い、hCT線維形成の分子機構を明らかにすることを研究の目的とする。
固体NMR信号の測定により、ヒトカルシトニンは2段階自己触媒反応機構でアミロイド線維が形成すること、中央部が線維形成の過程でαーヘリックス構造からβーシート構造に転移することを明らかにした。また、電子顕微鏡でHEPES溶液中での線維形成を観測したところ、線維形成前駆体として球状中間体の存在が明らかになった。さらに、球状中間体から線維が成長する過程を直接観測することに成功した。
次に、13C,15Nで二重標識したヒトカルシトニン線維を用いて、固体NMRにより精密原子間距離測定を行い、これまで明らかになっていない酸性条件で生成するヒトカルシトニンアミロイド線維の精密立体構造決定を行った。この結果、逆平行βーシートと平行βーシートが混在した線維構造をとっていることを示唆する結果が得られた。次に線維形成阻害剤として知られているクルクミンの線維形成阻害機構について固体NMR測定から解析し、核形成段階が阻害されることが判明した。ヒトカルシトニンとクルクミンの系について分子動力学計算を行い、クルクミンとヒトカルシトニンが相互作用を持つことが判明した。この結果は、クルクミンが核形成の段階を阻害する機構であることを指示している。
本研究によりカルシトニンの線維形成機構およびクルクミンによる線維形成阻害の分子機構が明らかになった。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (26 results)

All 2016 2015

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 12 results,  Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Polysilsesquioxanes with mixed self-assembled organic tethers: Alkyl chains and alkanoate-aminopropyl pairs2016

    • Author(s)
      Hideaki Yoshitake, Taiyo Kodate, Teppei Takagi, Izuru Kawamura, Akira Naito
    • Journal Title

      Reactive and Functional Polymers

      Volume: 99 Pages: 9-16

    • DOI

      10.1016/j.reactfunctpolym.2015.12.002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanism for microwave heating of 1-(4'-cyanophenyl)-4-propylcyclohexane characterized by in situ microwave irradiation NMR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Yugo Tasei, Takuya Yamakami, Izuru Kawamura, Teruaki Fujito, Kiminori Ushida, Motoyasu Sato, Akira Naito
    • Journal Title

      J. Magn. Reson

      Volume: 254 Pages: 27-34

    • DOI

      10.1016/j.jmr.2015.02.002

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The microwave heating mechanism of N-(4-methoxybenzyliden)-4-butylaniline in liquid crystalline and isotropic phases as determined using in situ microwave irradiation NMR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Yugo Tasei,, Fumikazu Tanigawa, Izuru Kawamura, Teruaki Fujito, Motoyuki Sato, Akira Naito
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 9082-9089

    • DOI

      10.1039/c5cp00476d

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Characterization of photo-intermediates in the photo-reaction pathways of a bacteriorhodopsin Y185F mutant using in situ photo-irradiation solid-state NMR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Kyosuke Oshima, Aris Shigeta, Yoshiteru Makino, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Satoru Tuzi, Tetsuo Iwasa, Akira Naito
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol. Sci.

      Volume: 14 Pages: 1694-1702

    • DOI

      10.1039/c5pp00154d

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Recent solid-state NMR studies of membrane-bound peptides and proteins2015

    • Author(s)
      Akira Naito, Izuru Kawamura, Namsrai Javkhlantugs
    • Journal Title

      Annu. Rep. NMR Spectrosc.

      Volume: 86 Pages: 333-411

    • DOI

      10.1016/bs.arnmr.2015.06.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structure and orientation of antibiotic peptide alamethicin in phospholipid bilayers as revealed by chemical shift oscillation analysis of solid state nuclear magnetic resonance and molecular dynamics simulation2015

    • Author(s)
      Takashi Nagao, Daisuke Mishima, Namsrai Javkhlantugs, Jun Wang, Daisuke Ishioka, Kiyonobu Yokota, Kazushi Norisada, Izuru Kawamura, Kazuyoshi Ueda, Akira Naito,
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1848 Pages: 2789-2798

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2015.07.019

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Photoreaction pathways of photoreceptor membrane proteins revealed by in-situ photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Solid-state NMR studies for chromophore protein interaction changes in pharanis phoborhodopsin2015

    • Author(s)
      Izuru Kawamura, Ryota Nishikawa, Satoshi Nakatani, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Naoki Kamo, Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Interaction of bombinin H4 containing a D-amino acid residue with lipid membranes as studied by solid-state NMR and MD simulations2015

    • Author(s)
      Yuki Kitahashi, Namsrai Javkhlantugs, Shiho Kaneda, Nyamsambuu Altannavch, Kazuyoshi Ueda, Akira Naito, Izuru Kawamura
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Hydrogen bond alteration of Tyr174 and Tyr199 of phoborhodopsin in the lipid environment as studied by solid-state 13C MAS NMR2015

    • Author(s)
      Ryota Nishikawa, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Yuki Sudo, Naoki Kamo, Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural changes in the photo-reaction pathways of retinal in bacteriorhodopsin studied by in-situ photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Aris Shigeta, Kyosuke Oshima, Ryota Miyasa, Miyako Horigome, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Satoru Tuzi, Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural diversity of amyloid fibril and its intermediate in human calcitonin as studied by solid-state NMR and MD simulation2015

    • Author(s)
      Shuhei Toyoda, Lkhamsuren Ganchimeg, Namsrai Javkhlantugs, Hikari-Itoh-Watanabe, Izuru Kawamura, Kazuyoshi Ueda, Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photo reaction pathways of sensory rhodopsin I as revealed by in-situ photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Yoshiteru Makino, Hiroki Yomoda, Yuya Tomonaga, Teturou Hidaka, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Yuki Sudo, Akira Naito
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Society (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] In situ光照射固体NMRによるD96N-bR変異体の光反応サイクルにおけるM-中間体の解析2015

    • Author(s)
      大谷優人、重田安里寿、槙野義輝、宮佐亮太、川村 出、沖津貴志、和田昭盛、辻暁、内藤 晶
    • Organizer
      第54回NMR討論会
    • Place of Presentation
      千葉工業大学
    • Year and Date
      2015-11-06 – 2015-11-08
  • [Presentation] 13-cis, 15-syn型バクテリオロドプシンの光中間体のin situ光照射固体NMRによる検出2015

    • Author(s)
      重田安里寿、大島恭介、川村 出、沖津貴志、和田昭盛、辻暁、内藤 晶
    • Organizer
      第54回NMR討論会
    • Place of Presentation
      千葉工業大学
    • Year and Date
      2015-11-06 – 2015-11-08
  • [Presentation] In situ光照射固体NMRによる光受容膜タンパク質ppR/pHtrIIの光活性中間体の解析2015

    • Author(s)
      槙野義輝、友永雄也、日高哲郎、川村 出、沖津貴志、和田昭盛、須藤雄気、加茂直樹、内藤 晶
    • Organizer
      第54回NMR討論会
    • Place of Presentation
      千葉工業大学
    • Year and Date
      2015-11-06 – 2015-11-08
  • [Presentation] 固体NMRによるヒトカルシトニンのアミロイド線維中間体から線維への構造変化の解析2015

    • Author(s)
      豊田修平、Lkhamsuren Ganchimeg, Namsrai Javkhlantugs, 渡邉(伊藤)ひかり、川村 出、上田一義、内藤 晶
    • Organizer
      第54回NMR討論会
    • Place of Presentation
      千葉工業大学
    • Year and Date
      2015-11-06 – 2015-11-08
  • [Presentation] 31P MNRを用いたペプチドホルモングルカゴンによるDMPC脂質二分子膜の形態変化と線維形成過程の解析2015

    • Author(s)
      羽矢和未、菊池章江、川村 出、内藤 晶
    • Organizer
      第54回NMR討論会
    • Place of Presentation
      千葉工業大学
    • Year and Date
      2015-11-06 – 2015-11-08
  • [Presentation] In situ光照射固体NMRによるバクテリオロドプシンY185F変異体の光反応経路の解明2015

    • Author(s)
      大島恭介、重田安里寿、槙野義輝、川村 出、沖津貴志、和田昭盛、辻暁、岩佐達郎、内藤 晶
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] The microwave heating mechanism of MBBA as studied by microwave irradiation NMR spectroscopy2015

    • Author(s)
      Akira Naito, Yugo Tasei, Teruaki Fujito, Izuru Kawamura
    • Organizer
      The 19th International Society of Magnetic Resonance Conference
    • Place of Presentation
      Shanhai, China
    • Year and Date
      2015-08-16 – 2015-08-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 13C solid-state NMR study of hydrogen bonding alteration of Tyr174 and Tyr199 on phoborhodopsin in the lipid environment2015

    • Author(s)
      Izuru Kawamura, Ryota Nishikawa, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Yuki Sudo, Naoki Kamo, Akira Naito
    • Organizer
      19th International Society of Magnetic Resonance Conference
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2015-08-16 – 2015-08-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Color-discriminating retinal configuration change of sensory rhodopsin as revealed by in situ photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Yoshiteru Makino, Hiroki Yomoda, Yuya Tomonaga, Tetsurou Hidaka, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Yuki Sudo, Akira Naito
    • Organizer
      19th International Society of Magnetic Resonance Conference
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2015-08-16 – 2015-08-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural changes in the photo-excited process of bacteriorhodopsion by photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Aris Shigeta, Kyosuke Oshima, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Satoru Tuzi, Akira Naito
    • Organizer
      19th International Society of Magnetic Resonance Conference
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2015-08-16 – 2015-08-21
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Determination of photo-intermediates and photo-reaction pathways of photoreceptor membrane proteins by in-situ photo-irradiation solid-state NMR2015

    • Author(s)
      Akira Naito, Yoshiteru Makino, Hiroki Yomoda, Yuya Tomonaga, Tetsurou Hidaka, Izuru Kawamura, Yuki Sudo, Akimori, Wada, Takashi Okitsu, Naoki Kamo
    • Organizer
      The 6th Asia-Pacific NMR Symposium
    • Place of Presentation
      Hong Kong, China
    • Year and Date
      2015-08-13 – 2015-08-15
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 固体NMRによる抗菌ペプチドの生体膜結合構造と膜相互作用解析2015

    • Author(s)
      内藤 晶
    • Organizer
      第15回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      あわぎんホール、徳島市
    • Year and Date
      2015-06-24 – 2015-06-26
    • Invited
  • [Book] 光と生命の事典 第5章 光による生命現象の計測 第176節 NMR分光法2016

    • Author(s)
      内藤 晶
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      朝倉書店

URL: 

Published: 2017-01-06  

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