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2014 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質MPIaseと標的タンパク質との相互作用

Publicly Offered Research

Project AreaChemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity
Project/Area Number 26102703
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsタンパク質膜挿入 / タンパク質膜透過 / MPIase / SecYEG / YidC
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質の膜挿入や分泌タンパク質の膜透過は、根本的な部分ではすべての生物において保存されている。タンパク質膜透過チャンネルSecYEG はタンパク質膜挿入、膜透過のどちらにおいても中心的役割を果たす。YidC は、ミトコンドリアや葉緑体にもホモログが存在し、タンパク質膜挿入に重要な役割を果たすが、その機能については今なお議論が分かれている。タンパク質膜挿入、膜透過の分子機構を明らかにするため、申請者はそれらの再構成系を確立し、膜挿入に必須の糖脂質MPIase(Membrane Protein Integrase)を発見した、MPIase はSecYEG と相互作用しSecYEG の二量体構造に影響を与えることを明らかにした。本年度はYidCとMPIaseの相互作用に着目して研究を進めた。その結果、基質膜タンパク質の量が少ないときはMPIaseのみに依存して膜挿入するが、基質膜タンパク質量がMPIaseやYidCよりも多いときはYidCにより膜挿入効率が数倍上昇した。これらの結果は、まず膜タンパク質はMPIaseと相互作用して膜挿入反応が進行し、その後YidCに基質が受け渡されて膜挿入が完了することを強く示唆している。この現象は、枯草菌由来のYidCでも大腸菌由来のYidCでも観察された。さらに、YidCの膜内部に存在する比較的親水的な空洞内に変異が生じたとき、YidCによる促進効果が無効となることも判明した。YidCによる膜挿入促進は、SecYEGに依存する反応でも観察された。このことは、MPIase―YidC複合体はSecYEG複合体とも直接相互作用して膜挿入反応を触媒している可能性がある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

MPIaseからYidCへと流れる膜挿入機構を提唱することができ、これまで議論の分かれていたYidCの役割に決着をつける結果が得られたため「おおむね順調に進展している」とした。

Strategy for Future Research Activity

MPIaseとYidC、MPIaseとSecYEGという、タンパク質膜挿入・膜透過に重要な相互作用の詳細は、現在のところ大部分が不明なままである。これら相互作用の詳細について解析を進める。

  • Research Products

    (17 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (12 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structural basis of Sec-independent membrane protein insertion by YidC2014

    • Author(s)
      Kumazaki, K., Chiba, S., Takemoto, M., Furukawa, A., Nishiyama, K., Sugano, Y., Mori, T., Dohmae, N., Hirata, K., Nakada-Nakura, Y. Maturana, A.D., Tanaka, Y., Mori, H., Sugita, Y., Arisaka, F., Ito, K., Ishitani, R., Tsukazaki, T. and Nureki, O.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 509 Pages: 516-520

    • DOI

      doi:10.1038/nature13167

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Glycolipozyme membrane protein integrase (MPIase): recent data2014

    • Author(s)
      Nishiyama, K. and Shimamoto, K.
    • Journal Title

      BioMol Concepts

      Volume: 5 Pages: 429-438

    • DOI

      doi: 10.1515/bmc-2014-0030

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] タンパク質膜挿入の鍵を握るグライコリポザイム~タンパク質でない酵素?~2014

    • Author(s)
      島本啓子、西山賢一
    • Journal Title

      実験医学増刊「代謝」

      Volume: 32 Pages: 115-122

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 膜タンパク質膜挿入の鍵を握る糖脂質酵素MPIase2014

    • Author(s)
      島本啓子、西山賢一
    • Journal Title

      生命化学研究レター

      Volume: 44 Pages: 9-14

    • Open Access
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素(Glycolipozyme)MPIaseの構造と機能2015

    • Author(s)
      西山 賢一、前田 将秀、Moser Michael、楠本 正一、徳田 元、島本 啓子
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会 大会シンポジウム「天然物ケミカルバイオロジー研究の新展開」
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-29
    • Invited
  • [Presentation] 糖脂質酵素MPIaseと タンパク質膜透過チャネル SecYEGに依存したタンパク質膜挿入反応の再構成2015

    • Author(s)
      佐々木優、永野孝典、Michael Moser、松林英明、車兪澈、上田卓也、西山 賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-28
  • [Presentation] Reconstitution of preprotein translocation across and membrane protein integration into the cytoplasmic membrane of E. coli2014

    • Author(s)
      Nishiyama, K.
    • Organizer
      「細胞を創る」研究会 7.0
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都文京区)
    • Year and Date
      2014-11-13
    • Invited
  • [Presentation] Interaction between MPIase, a glycolipid involved in membrane protein integration and preprotein translocation, and its target proteins2014

    • Author(s)
      Nishiyama, K.
    • Organizer
      The 3rd International Symposium on Chemical Biology of Natural Products: Target ID and Regulation of Bioactivity
    • Place of Presentation
      Life Science Center, Senri Osaka (Toyonaka,Osaka)
    • Year and Date
      2014-10-28
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIase とYidC との機能的相互作用2014

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      第9回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2014-10-09
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIase の植物ホモログの探索2014

    • Author(s)
      遠藤佑太、松林英明、車兪澈、上田卓也、西山 賢一
    • Organizer
      第9回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2014-10-08
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素(Glycolipozyme)MPIaseの構造と機能2014

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      文部科学省特別経費「分子構築イノベーション」フロンティア化学教育研究センター(FCC)講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-09-24
    • Invited
  • [Presentation] Functional interaction between glycolipozyme MPIase and the YidC protein in protein integration into membranes2014

    • Author(s)
      Nishiyama, K.
    • Organizer
      The Gordon Research Conference on Bacterial Cell Surfaces
    • Place of Presentation
      Mount Snow (West Dover, VT, USA)
    • Year and Date
      2014-06-23 – 2014-06-26
  • [Presentation] タンパク質膜透過・膜挿入に関わる糖脂質酵素MPIaseとYidCとの機能的相互作用2014

    • Author(s)
      Michael Moser、Maria Huber、西山 賢一
    • Organizer
      第11回 21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      ホテル大観(岩手県盛岡市)
    • Year and Date
      2014-06-05 – 2014-06-06
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質MPIaseと標的タンパク質との相互作用2014

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー~分子標的と活性制御~」第6回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2014-05-28
  • [Presentation] 人工細胞開発のための機能的膜タンパク質試験管内合成システムの構築2014

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      文部科学省科学研究費補助金「新学術領域研究」動的・多要素な生体分子ネットワークを理解するための合成生物学の基盤構築 第五回 領域全体会議
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-05-20
  • [Presentation] タンパク質膜透過・膜挿入に関与する糖脂質酵素(glycolipozyme)MPIaseの構造と機能2014

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      第258回生物科学セミナー
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2014-04-24
    • Invited
  • [Remarks] 西山研究室ホームページ

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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