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2015 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質MPIaseと標的タンパク質との相互作用

Publicly Offered Research

Project AreaChemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity
Project/Area Number 26102703
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywordsタンパク質膜挿入 / タンパク質膜透過 / MPIase / SecYEG / YidC
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質の膜挿入は根本的な部分ではすべての生物において保存されている。大腸菌においては、シグナル認識粒子SRPやタンパク質膜透過チャンネルSecYEGに依存して膜挿入が進行する経路と、これらに依存しないで進行する経路が存在する。YidC は、ミトコンドリアや葉緑体にもホモログが存在し、タンパク質膜挿入に重要な役割を果たす。YidCの結晶構造が報告され、その構造に基づきYidCの作用機構が提唱されているが、その機能については今なお不明な点が多い。申請者はタンパク質膜挿入の再構成系を確立し、膜挿入に必須の糖脂質MPIase(Membrane Protein Integrase)を発見した。さらに、この再構成系を用いてYidC機能を解析したところ、基質膜タンパク質の量が少ないときはMPIaseのみに依存して膜挿入するが、基質膜タンパク質量がMPIaseやYidCよりも多いときはYidCにより膜挿入効率が数倍上昇することを示した。この結果は、MPIaseとYidCが直接相互作用することを示している。YidCに強く依存する膜タンパク質とあまり依存しない膜タンパク質が報告されている。これらの膜タンパク質の膜挿入に関して再構成系で調べたところ、いずれの場合も膜挿入にはMPIaseが必須でありことが判明した。これらの結果は、まず膜タンパク質はMPIaseと相互作用して膜挿入反応が進行し、その後YidCに基質が受け渡されて膜挿入が完了することを強く示唆している。YidCの依存性が弱い膜タンパク質に関しては、MPIaseだけで膜挿入が十分に進行し、YidC機能が必要ないことが明らかとなった。YidCによる膜挿入促進は、SRP/SecYEGに依存する場合もしない場合も同様に観察された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (20 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Ohio State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Ohio State University
  • [Journal Article] Relationship between glycolipozyme MPIase and components comprising the protein transport machinery2015

    • Author(s)
      Endo, Y., Nishiyama, K.
    • Journal Title

      Med. Res. Arch.

      Volume: 2 Pages: 1-24

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] “糖脂質酵素(Glycolipozyme)”MPIaseの構造と作用機作2015

    • Author(s)
      西山賢一、島本啓子
    • Journal Title

      酵素工学

      Volume: 74 Pages: 14-18

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 糖脂質酵素MPIase に依存するタンパク質膜挿入反応は YidC により促進される2016

    • Author(s)
      志水優子、佐々木優、Ross Dalbey、西山賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27 – 2016-03-30
  • [Presentation] タンパク質膜挿入反応に関与する糖脂質酵素MPIaseの構造と機能2016

    • Author(s)
      西山 賢一
    • Organizer
      第1回デザイン生命工学研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-08
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIaseのin vivoにおける機能解析2016

    • Author(s)
      沢里 克宏、佐藤 諒、西山 賢一
    • Organizer
      第1回デザイン生命工学研究会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-08 – 2016-03-08
  • [Presentation] MPIase (membrane protein integrase), a glycolipozyme involved in protein integration into and protein translocation across the cytoplasmic membrane of E. coli2015

    • Author(s)
      Ken-ichi Nishiyama, Michael Moser, Shoichi Kusumoto, Keiko Shimamoto
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of biosynthetic enzymes for MPIase, a glycolipozyme essential for membrane protein integration2015

    • Author(s)
      Ryo Sato, Keiko Shimamoto, Toshiyuki Yamaguchi, Michael Moser, Ken-ichi Nishiyam
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Glycolipozyme MPIase functions as membrane protein integrase in vivo2015

    • Author(s)
      Katsuhiro Sawasato, Michael Moser, Ryo Sato, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reconstitution of glycolipozyme MPIase-dependent protein integration into membrane2015

    • Author(s)
      Masaru Sasaki, Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of an MPIase homologue in plants that catalyses membrane protein integration2015

    • Author(s)
      Yuta Endo, Toshiyuki Yamaguchi, Hideaki Matsubayashi, Yutetsu Kuruma, Takuya Ueda, Keiko Shimamoto, Ken-ichi Nishiyama
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center (Honolulu, Hawaii)
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に関与する糖脂質酵素MPIaseの植物ホモログの精製2015

    • Author(s)
      遠藤 佑太、松林 英明、山口 敏幸、車 ゆうてつ、上田 卓也、島本 啓子、西山賢一
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質酵素MPIaseのin vivoにおける機能解析2015

    • Author(s)
      沢里 克宏、Michael Moser、佐藤 諒、田村 康、遠藤 斗志也、西山 賢一
    • Organizer
      第38回分子生物学会年会・第88回生化学会大会合同大会BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須の糖脂質酵素MPIase の生合成因子の同定2015

    • Author(s)
      佐藤 諒、澤里 克宏、山口 敏幸、Moser Michael、島本 啓子、西山 賢一
    • Organizer
      第10回 無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      理化学研究所(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2015-10-13 – 2015-10-14
  • [Presentation] 人工細胞開発のための機能的膜タンパク質試験管内合成システムの構築2015

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      「動的・多要素な生体分子ネットワークを理解するためのの基盤構築」研究発表会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県・福岡市)
    • Year and Date
      2015-10-05 – 2015-10-06
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に関与する糖脂質MPIaseと標的タンパク質との相互作用2015

    • Author(s)
      佐々木優、Michael Moser、Maria Huber、西山賢一
    • Organizer
      「天然物ケミカルバイオロジー~分子標的と活性制御~」 第8回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-06-08 – 2015-06-09
  • [Presentation] タンパク質膜挿入に必須な糖脂質酵素MPIaseの生合成経路の解明2015

    • Author(s)
      佐藤 諒、山口 敏幸、Moser Michael、島本 啓子、西山 賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県・大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Presentation] 再構成によるタンパク質膜挿入における必須因子の決定2015

    • Author(s)
      佐々木優、松林英明、車ゆうてつ、上田卓也、西山賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県・大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Presentation] 大腸菌タンパク質膜挿入因子MPIaseのin vivo における役割2015

    • Author(s)
      沢里克宏、Michael Moser、佐藤諒、田村康、遠藤斗志也、西山賢一
    • Organizer
      第12回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      琵琶湖グランド ホテル・京近江(滋賀県・大津市)
    • Year and Date
      2015-06-04 – 2015-06-05
  • [Remarks] 西山研究室 研究内容

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/research.html

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-28  

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