2015 Fiscal Year Annual Research Report
立体構造に基づくGPCRとリガンドの相互作用の解明
Publicly Offered Research
| Project Area | Chemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity |
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| Project/Area Number |
26102725
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
島村 達郎 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (90391979)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | GPCR / リガンド |
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| Outline of Annual Research Achievements |
GPCRの活性型構造は、agonistを結合させただけでは不安定でることから構造解析は難しく、agonistの結合様式に関する構造情報は限られている。本年度は、昨年度までに作製したagonistの親和性を高める構造認識抗体を結合させ、agonistが結合した状態の受容体の構造解析に成功した。構造解析の結果、結合させたagonistの電子密度は良好で、このagonistの結合様式の詳細が解明できた。また、類似の手法を他の膜蛋白質の構造解析に応用することにも成功した。また、最近になり、X線結晶構造解析に次世代X線源であるX線自由電子レーザーが利用できるようになった。我々は、X線自由電子レーザーを受容体の結晶構造解析に利用するための測定系を立ち上げ、いくつかの受容体の構造解析に成功した。そのうちの一種では、従来の放射光を用いて測定したデータより、リガンド周囲の電子密度が改善され、より詳細なリガンドの結合様式が解明できた。本研究で得られた成果は、他の受容体や膜蛋白質とリガンドの結合様式の詳細を解明するための膜蛋白質構造解析技術基盤の確立にも役立った。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(5 results)
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[Journal Article] Haem-dependent dimerization of PGRMC1/Sigma-2 receptor facilitates cancer proliferation and chemoresistance.2016
Author(s)
Kabe Y, Nakane T, Koike I, Yamamoto T, Sugiura Y, Harada E, Sugase K, Shimamura T, Ohmura M, Muraoka K, Yamamoto A, Uchida T, Iwata S, Yamaguchi Y, Krayukhina E, Noda M, Handa H, Ishimori K, Uchiyama S, Kobayashi T, Suematsu M.
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Journal Title
Nat Commun.
Volume: 7
Pages: 11030
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Native sulfur/chlorine SAD phasing for serial femtosecond crystallography.2015
Author(s)
Nakane T, Song C, Suzuki M, Nango E, Kobayashi J, Masuda T, Inoue S, Mizohata E, Nakatsu T, Tanaka T, Tanaka R, Shimamura T, Tono K, Joti Y, Kameshima T, Hatsui T, Yabashi M, Nureki O, Iwata S, Sugahara M.
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Journal Title
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.
Volume: 71
Pages: 2519-25
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Structure and mechanism of the mammalian fructose transporter GLUT5.2015
Author(s)
Nomura N, Verdon G, Kang HJ, Shimamura T, Nomura Y, Sonoda Y, Hussien SA, Qureshi AA, Coincon M, Sato Y, Abe H, Nakada-Nakura Y, Hino T, Arakawa T, Kusano-Arai O, Iwanari H, Murata T, Kobayashi T, Hamakubo T, Kasahara M, Iwata S, Drew D.
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Journal Title
Nature
Volume: 526
Pages: 397-401
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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