2014 Fiscal Year Annual Research Report
ヘテロだらけ現象の解析
Publicly Offered Research
| Project Area | Correlative gene system: establishing next-generation genetics |
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| Project/Area Number |
26113703
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
藤原 徹 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80242163)
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| Project Period (FY) |
2014-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | T-DNA / シロイヌナズナ / ヘテロ接合体 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
hdk変異株のマッピングを進めた。まず、ゲノム配列解析を行った。次世代シークエンサーによって得られたデータを対照配列と比較し、ゲノムに300カ所程度のSNPが存在することを見いだした。さらにFASTシステムを用いてhdk表現型を判定するシステムを用いて、hdkが分離するF2集団からhfk個体を選び出しbulkで抽出したDNAを用いて、MutMap法により原因遺伝子の存在する領域を推定した。またこのマッピングの過程で、hdkを示すF2で共通してヘテロとなっている領域が染色体５番以外にも見いだされた。hdkとなる染色体の領域は昨年までに明らかにしていた染色体5番以外にも存在している可能性が考えられる。
hdk現象の細胞生物学的観察のために異なる蛍光タンパク質を配偶子で発現する形質転換系統を独立に6系統作出した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
変異株の原因遺伝子マッピングは、その表現型解析の難しさと変異の少なさから、予想よりも進展は遅れている。
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| Strategy for Future Research Activity |
マッピングについては、F2個体数を増やす等してマッピングを行っていく。また、hdk現象の細胞生物学的観察のために異なる蛍光タンパク質を配偶子で発現する形質転換系統については、現象の観察を進めて行く。
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