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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物の共生オルガネラ制御におけるPPRシステムの解析

Publicly Offered Research

Project Area"Matryoshka"-type evolution of eukaryotes
Project/Area Number 26117718
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

中村 崇裕  九州大学, (連合)農学研究科(研究院), 准教授 (10464398)

Project Period (FY) 2014-04-01 – 2016-03-31
Keywords共生オルガネラ制御 / PPR / 植物 / 葉緑体 / ミトコンドリア
Outline of Annual Research Achievements

1. PPR変異体の解析  未解析PPR遺伝子(13個)を欠損したシロイヌナズナT-DNA挿入株を公共配布センターから取り寄せ、T-DNA挿入位置を確認した。6系統に関しては、ホモ化個体を得ることができた。残りの7系統に関しては、ホモ化個体を得ることができなかったため、当該PPR遺伝子の欠損により胚発生致死などの重篤な表現型を呈する可能性が考えられた。ホモ化個体が得られた6系統に関しては、標的RNAの成熟阻害などの分子表現型を解析したところ、1系統でRNA編集の欠損が明らかとなった。

2. PPR遺伝子の転写制御領域の同定  本研究で注目するPPRクラスターに含まれるPPR タンパク質遺伝子の5’上流領域に着目し、インフォマティクス解析により、転写制御に関わる領域を推測したところ、大クラスターに共通の保存配列、および小クラスター特異的な保存配列を抽出することができた。一部の保存配列に関しては、作用する潜在的な転写因子を割り出すことができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

変異株の分子表現型の同定が遅延している。

Strategy for Future Research Activity

計画通りに研究を推進する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Quantitative analysis of motifs contributing to the interaction between PLS-subfamily members and their target RNA sequences in plastid RNA editing.2014

    • Author(s)
      Okuda K, Shoki H, Arai M, Shikanai T, Small I, Nakamura T.
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 80 Pages: 870-882

    • DOI

      10.1111/tpj.12687

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pentatricopeptide repeat motifs in the processing enzyme PRORP1 in Arabidopsis thaliana play a crucial role in recognition of nucleotide bases at TψC loop in precursor tRNAs.2014

    • Author(s)
      Imai T, Nakamura T, Maeda T, Nakayama K, Gao X, Nakashima T, Kakuta Y, Kimura M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 450 Pages: 1541-1546

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2014.07.030

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The potential for manipulating RNA with pentatricopeptide repeat proteins2014

    • Author(s)
      Yagi Y, Nakamura T, Small I
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: 78 Pages: 772-782

    • DOI

      10.1111/tpj.12377

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] PPR Motifs and Their Engineering2015

    • Author(s)
      Takahiro Nakamura
    • Organizer
      Gordon Research Conference "Chloroplast Biothenology"
    • Place of Presentation
      Ventura, CA
    • Year and Date
      2015-01-18 – 2015-01-23
    • Invited
  • [Presentation] PPR motifs as a New DNA/RN Binding Modules for Genome Editing2014

    • Author(s)
      Takahiro Nakamura
    • Organizer
      JAACT2014
    • Place of Presentation
      Kitakyushu
    • Year and Date
      2014-11-11 – 2014-11-14
    • Invited
  • [Presentation] PPRタンパク質を用いたゲノム編集技術開発2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      植物ゲノム編集ワークショップ
    • Place of Presentation
      倉敷市
    • Year and Date
      2014-11-04 – 2014-11-04
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集と植物育種における現状2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      日本作物学会九州支部第91回講演会
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      2014-09-20 – 2014-09-21
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集の新しいDNA/RNA結合モジュール、PPRモチーフ2014

    • Author(s)
      中村崇裕
    • Organizer
      動物細胞工学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2014-06-20 – 2014-06-20
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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