Origin and formation of Yaponesians based on genome sequences

• Project Area: Deciphering Origin and Establishment of Japonesians mainly based on genome sequence data
• Project/Area Number: 18H05505
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Complex systems
• Research Institution: National Institute of Genetics
• Principal Investigator: 斎藤 成也 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 特任教授 (30192587)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 藤尾 慎一郎 国立歴史民俗博物館, 大学共同利用機関等の部局等, 教授 (30190010) ; 木部 暢子 大学共同利用機関法人人間文化研究機構国立国語研究所, 言語変異研究領域, 教授 (30192016) ; 篠田 謙一 独立行政法人国立科学博物館, その他部局等, 研究調整役 (30131923) ; 遠藤 光暁 青山学院大学, 経済学部, 教授 (30176804) ; 鈴木 仁 北海道大学, 地球環境科学研究院, 教授 (40179239) ; 長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究科, 准教授 (70416270)
• Project Period (FY): 2018-06-29 – 2023-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥98,280,000 (Direct Cost: ¥75,600,000、Indirect Cost: ¥22,680,000); Fiscal Year 2022: ¥19,240,000 (Direct Cost: ¥14,800,000、Indirect Cost: ¥4,440,000); Fiscal Year 2021: ¥19,240,000 (Direct Cost: ¥14,800,000、Indirect Cost: ¥4,440,000); Fiscal Year 2020: ¥19,240,000 (Direct Cost: ¥14,800,000、Indirect Cost: ¥4,440,000); Fiscal Year 2019: ¥19,240,000 (Direct Cost: ¥14,800,000、Indirect Cost: ¥4,440,000); Fiscal Year 2018: ¥21,320,000 (Direct Cost: ¥16,400,000、Indirect Cost: ¥4,920,000)
• Keywords: ヤポネシア人 / ゲノム / 文理融合研究 / 人類学 / ヤポネシア / 現代人ゲノム / 古代人ゲノム / 考古学 / 言語学

Outline of Annual Research Achievements

リースしているサーバー(すさのを)および国立遺伝学研究所のスーパーコンピュータを用いて、現代人ゲノムの解析環境をととのえた。2019年度に購入したサーバー2台(うみさちとやまさち)を用いて、古代人や公開されている現代人ゲノムや動植物ゲノムデータの格納をおこない、それらデータの解析環境を整えた。季刊誌Yaponesianの2021年はる号、なつ号、あき号、2022年ふゆ号を編集刊行した。新学術領域研究ヤポネシアゲノムのウェブサイトを運営した。2021年6月12-13日に、オンラインにて総括班会議と全体会議を開催した。2021年11月28日に、国際日本文化研究センターと共催で「埴原和郎の二重構造モデル論文発表３０周年記念公開シンポジウム」をハイブリッド方式で開催した。2022年2月12-13日に、オンラインにて全体会議と総括班会議をハイブリッド方式で開催した。2022年3月15-17日に、 「第3回くにうみミーティング」(若手研究者育成の一環)を開催した。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新型コロナイウルスの蔓延により、若干計画を変更したが、オンラインを用いて活発な活動をおこなった。

Strategy for Future Research Activity

新型コロナイウルスの蔓延がつづくことが予想されるので、オンラインを用いた活動を多数取り入れる。

Research Products

• [Journal Article] 日本列島人の起源に文理融合研究でせまる (2018)
  • Author(s): 斎藤成也
  • Journal Title: 実験医学 Volume: 36 Pages: 2788-2788
• [Journal Article] Detection of de novo single nucleotide variants in offspring of atomic-bomb survivors close to the hypocenter by whole-genome sequencing. (2018)
  • Author(s): Horai M, Mishima H, Hayashida C, Kinoshita A, Nakane Y, Matsuo T, Tsuruda K, Yanagihara K, Sato S, Imanishi D, Imaizumi Y, Hata T, Miyazaki Y, Yoshiura KI.
  • Journal Title: J Hum Genet. Volume: 63 Issue: 3 Pages: 357-363
  • DOI: 10.1038/s10038-017-0392-9
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 一般シンポジウム12＜新学術領域「ヤポネシアゲノム」始動！＞ (2018)
  • Author(s): 斎藤成也ほか
  • Organizer: 日本人類学会第72回大会
• [Presentation] 公開シンポジウム２<DNAからみたヒトの進化> (2018)
  • Author(s): 斎藤成也ほか
  • Organizer: 日本人類学会第72回大会
• [Presentation] 現代出雲人と出雲神話をつなげるゲノムDNA研究 (2018)
  • Author(s): 斎藤成也
  • Organizer: 日本DNA多型学会第27回学術集会公開シンポジウム
• [Remarks] ヤポネシアゲノム
  • URL: http://yaponesian.org/index.html