核内RNAボディによるクロマチン制御機構の解明

• Project Area: Chromatin potential for gene regulation
• Project/Area Number: 18H05531
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Japanese Foundation for Cancer Research
• Principal Investigator: 斉藤 典子 公益財団法人がん研究会, がん研究所 がん生物部, 部長 (40398235)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 落合 博 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授 (60640753)
• Project Period (FY): 2018-06-29 – 2023-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2022)
• Budget Amount: ¥129,350,000 (Direct Cost: ¥99,500,000、Indirect Cost: ¥29,850,000); Fiscal Year 2022: ¥23,010,000 (Direct Cost: ¥17,700,000、Indirect Cost: ¥5,310,000); Fiscal Year 2021: ¥23,010,000 (Direct Cost: ¥17,700,000、Indirect Cost: ¥5,310,000); Fiscal Year 2020: ¥23,010,000 (Direct Cost: ¥17,700,000、Indirect Cost: ¥5,310,000); Fiscal Year 2019: ¥23,010,000 (Direct Cost: ¥17,700,000、Indirect Cost: ¥5,310,000); Fiscal Year 2018: ¥37,310,000 (Direct Cost: ¥28,700,000、Indirect Cost: ¥8,610,000)
• Keywords: クロマチン / 核内RNAボディ / ノンコーディングRNA / RNAボディ / 遺伝子発現制御 / 核内構造体

Outline of Annual Research Achievements

真核生物の細胞核内に多数存在するRNAボディは、ノンコーディングRNAとタンパク質複合体が凝集して形成されたもので、生体膜に囲まれない構造体である。核内の局所に転写関連因子を蓄積させることにより、近傍クロマチンの転写活性や構造を規定していると考えられる。またRNAボディは、タンパク質-RNA分子が液-液相分離とよばれる物理現象を引き起こした結果の液滴であり、移動度は保たれながら、局所に関連因子が濃縮することで核内反応を効率的にしていると考えられている。RNAボディは、近隣クロマチンの転写のおこりやすさに対するクロマチンポテンシャルを理解する鍵と考えられ、本研究で解明に取り組む。具体的には、RNAボディであるエレノアクラウドと核小体について、その形成機序、転写制御機能、物性、細胞分化における役割の解析を行い、核内RNAボディによるクロマチン制御機構を解明することを目的としている。本年度は主に、ノンコーディングRNAエレノアが相互作用するゲノム部位、タンパク質を同定するための実験系の確立につとめた。また、核小体の形成に関わる因子群の中から特にリボソームタンパク質RPL5に焦点を絞り、細胞生物学的実験に加え、１分子観察、分子動力学を導入して、液-液相分離に関わる機序の解明につとめた。以上のように研究は順調にすすんでいる。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

1．エレノアがクロマチン結合因子であるかを検証するために、生化学的細胞分画、および１分子FISH解析を行い、良好な結果を得た。さらにエレノアRNAに特異的に結合する因子を同定するためにChIRP (Chromatin Isolation by RNA Purification) 法を様々な条件を用いて行っている。エレノアに対するタイリングオリゴDNAをデザインし、また、コントロールとして哺乳類細胞には存在しないLacZ配列に対するオリゴDNAをデザインした。一定の結果を得て、再現性などを検証している。また、RNAとゲノムDNAの相互作用をゲノムワイドに検出できるRADICLE (RNA And DNA Interacting Complexes Ligated and sequenced)-Seq法にも着手している。
2. 核小体の形成に必要な因子としてリボソームタンパク質RPL5を同定し、SNAP-tagを融合した核小体因子を発現する生細胞の一分子追跡、ダイナミクスの定量化、分子動力学を用いたシミュレーションなどに着手して、順調にすすんだ。核小体の液滴としての性質の詳細な理解がすすんだ。
3. 新型コロナウイルス感染拡大とその対応のため、計画代表者の研究所では1ヶ月程度原則自宅での勤務となり研究室で実験をできない期間があった。また、試薬や機器の入手が困難であったり、共同研究者の研究室を訪れることができないなど、研究活動に制約がかかった。しかしそれまでの研究成果を論文として報告することができた。特に研究分担者の落合が筆頭著者を務める論文では、転写バーストの詳細な分子メカニズムを報告した。

Strategy for Future Research Activity

今までの研究成果をさらに展開させる。
1. 引き続きChIRP-SeqとRADICLE-Seqを試みて、エレノアが相互作用するクロマチンをゲノムワイドに同定し、ふたつの方法に共通する結果を抽出したり、再現性を検証する。エレノアノンコーディングRNAの機能メカニズムを明らかにする最も重要な分子基盤を形作る。
２．RPL5が関わる核小体の形成と機能メカニズムを明らかにする。試験管内ではRPL5は核小体タンパク質のNPM1の液相分離を促進することが報告されている。また、RPL5-NPM1（核小体構成因子）、NPM1-rDNA、ｒDNA－RPL5の相互作用も報告されている。これらを有効なパラメーターとして分子動力学的解析を行って、RPL5の細胞内のノックダウンでおきる現象をin silicoで再現することを試みる。最終的には核小体の物理的性質への寄与を調べる。またRPL5のノックダウンでみられるrDNAの核内配置異常を精査する。rRNAの転写、プロセッシングへの影響を調べる。核小体の構造形成・維持に果たす役割がDBA（ダイアモンドブラックファン貧血症）疾患に関わるかも検討する予定である。
3．研究分担者の落合との共同研究によりエレノアRNAと、エレノアDNAを生細胞内で同時に観察する方法の確立をひきつづき検討する。

Research Products

• [Int'l Joint Research] ViQi Inc/Memorial Sloan Kettering Cancer Center(米国)
• [Int'l Joint Research] Centenary Institute(オーストラリア)
• [Int'l Joint Research] Yonsei University College of Medicine(韓国)
• [Int'l Joint Research] Mindshare Medical Inc,/Memorial Sloan Kettering Cancer Center(米国)
• [Int'l Joint Research] ICB Institute of Computational Biology(ドイツ)
• [Journal Article] Nuclear microenvironment in cancer: Control through liquid‐liquid phase separation (2020)
  • Author(s): Nozawa Ryu‐Suke、Yamamoto Tatsuro、Takahashi Motoko、Tachiwana Hiroaki、Maruyama Reo、Hirota Toru、Saitoh Noriko
  • Journal Title: Cancer Science Volume: 111 Issue: 9 Pages: 3155-3163
  • DOI: 10.1111/cas.14551
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Genome-wide kinetic properties of transcriptional bursting in mouse embryonic stem cells (2020)
  • Author(s): Ochiai Hiroshi、Hayashi Tetsutaro、Umeda Mana、Yoshimura Mika、Harada Akihito、Shimizu Yukiko、Nakano Kenta、Saitoh Noriko、Liu Zhe、Yamamoto Takashi、Okamura Tadashi、Ohkawa Yasuyuki、Kimura Hiroshi、Nikaido Itoshi
  • Journal Title: Science Advances Volume: 6 Issue: 25
  • DOI: 10.1126/sciadv.aaz6699
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] BRD4 promotes metastatic potential in oral squamous cell carcinoma through the epigenetic regulation of the MMP2 gene (2020)
  • Author(s): Yamamoto Tatsuro、Hirosue Akiyuki、Nakamoto Masafumi、Yoshida Ryoji、Sakata Junki、Matsuoka Yuichiro、Kawahara Kenta、Nagao Yuka、Nagata Masashi、Takahashi Nozomu、Hiraki Akimitsu、Shinohara Masanori、Nakao Mitsuyoshi、Saitoh Noriko、Nakayama Hideki
  • Journal Title: British Journal of Cancer Volume: 123 Issue: 4 Pages: 580-590
  • DOI: 10.1038/s41416-020-0907-6
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Gene regulation by non-coding RNAs in the 3D genome architecture (2020)
  • Author(s): Tachiwana H, Yamamoto T, *Saitoh N
  • Journal Title: Curr Opin Genet Dev Volume: 61 Pages: 69-74
  • DOI: 10.1016/j.gde.2020.03.002
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Single-gene imaging links genome topology, promoter?enhancer communication and transcription control (2020)
  • Author(s): Li Jieru、Hsu Angela、Hua Yujing、Wang Guanshi、Cheng Lingling、Ochiai Hiroshi、Yamamoto Takashi、Pertsinidis Alexandros
  • Journal Title: Nature Structural & Molecular Biology Volume: 27 Issue: 11 Pages: 1032-1040
  • DOI: 10.1038/s41594-020-0493-6
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Insufficiency of ciliary cholesterol in hereditary Zellweger syndrome. (2020)
  • Author(s): Miyamoto T, Hosoba K, Itabashi T, Iwane AH, Akutsu AN, Ochiai H, Saito Y, Yamamoto T, Matsuura S
  • Journal Title: EMBO Journal Volume: - Issue: 12
  • DOI: 10.15252/embj.2019103499
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] PHi-C: deciphering Hi-C data into polymer dynamics (2020)
  • Author(s): Shinkai Soya、Nakagawa Masaki、Sugawara Takeshi、Togashi Yuichi、Ochiai Hiroshi、Nakato Ryuichiro、Taniguchi Yuichi、Onami Shuichi
  • Journal Title: NAR Genomics and Bioinformatics Volume: 2 Issue: 2
  • DOI: 10.1093/nargab/lqaa020
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Computational analysis of morphological and molecular features in gastric cancer tissues. (2020)
  • Author(s): Yasuda Y, Tokunaga K, Koga T, Goldberg I, Sakamoto C, *Saitoh N, *Nakao M
  • Journal Title: Cancer Med Volume: 9 Issue: 6 Pages: 2223-2234
  • DOI: 10.1002/cam4.2885
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Three Types of Nuclear Envelope Assemblies Associated with Micronuclei. (2020)
  • Author(s): Miyazaki K, Ichikawa Y, Saitoh N, *Saitoh H
  • Journal Title: Cell Bio Volume: 9 Issue: 01 Pages: 14-28
  • DOI: 10.4236/cellbio.2020.91002
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nucleosome destabilization by nuclear non-coding RNAs. (2020)
  • Author(s): †Fujita R, †Yamamoto T, Arimura Y, Fujiwara S, Tachiwana H, Ichikawa Y, Sakata S, Yang L, Maruyama R, Hamada M, Nakao M, *Saitoh N, *Kurumizaka H
  • Journal Title: Commun Biol Volume: 3 Issue: 1 Pages: 60-60
  • DOI: 10.1038/s42003-020-0784-9
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] クロマチン高次構造 (2020)
  • Author(s): 山本達郎、福岡恵、斉藤典子
  • Journal Title: 医学のあゆみ Volume: 272 Pages: 23-29
• [Journal Article] The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis. (2019)
  • Author(s): †Abdalla MOA, †Yamamoto T, Maehara K, Ohkawa Y, Miura H, Hiratani I, Nakayama H, Nakao M, *Saitoh N
  • Journal Title: Nat Commun Volume: 10 Issue: 1 Pages: 3778-3778
  • DOI: 10.1038/s41467-019-11378-4
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Non-coding RNAs and chromatin domains. (2019)
  • Author(s): Yamamoto T, *Saitoh N
  • Journal Title: Curr Opin Cell Biol Volume: 58 Pages: 26-33
  • DOI: 10.1016/j.ceb.2018.12.005
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An asymmetric centromeric nucleosome (2018)
  • Author(s): Ichikawa Yuichi、Saitoh Noriko、Kaufman Paul D
  • Journal Title: eLife Volume: 7
  • DOI: 10.7554/elife.37911
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Endocrine therapy-resistant breast cancer model cells are inhibited by soybean glyceollin I through Eleanor non-coding RNA (2018)
  • Author(s): Yamamoto Tatsuro、Sakamoto Chiyomi、Tachiwana Hiroaki、Kumabe Mitsuru、Matsui Toshiro、Yamashita Tadatoshi、Shinagawa Masatoshi、Ochiai Koji、Saitoh Noriko、Nakao Mitsuyoshi
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 8 Issue: 1 Pages: 15202-15202
  • DOI: 10.1038/s41598-018-33227-y
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] リボソームタンパク質RPL5 はリボソームDNAリピートを集合化し、核小体の構造、機能、物性を制御する (2021)
  • Author(s): 松森はるか, 渡邉健司, 中尾光善
  • Organizer: 第38回染色体ワークショップ 第19回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] ER生物学 (2021)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 第18回日本臨床腫瘍学会学術集会
  • Invited
• [Presentation] リボソームタンパク質RPL5 によるリボソームDNA3次元構造と核小体の物性制御 (2021)
  • Author(s): 松森はるか, 渡邉健司, 中尾光善, 斉藤典子
  • Organizer: 第14回日本エピジェネティクス研究会年会
• [Presentation] ER陽性乳がんで高発現している非コードRNA Eleanorsを介した転写活性化 (2020)
  • Author(s): 市川雄一, 斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] ホルモン療法耐性乳がんにおける非コードRNAの機能的意義 (2020)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
  • Invited
• [Presentation] 内分泌療法耐性乳がんモデル細胞におけるGlyceollin Iのエストロゲンレセプター非依存的な細胞増殖抑制機構 (2020)
  • Author(s): 渡邉健司, 山本達郎, 市川雄一, 泉厚志, 落合孝次, 斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] 原発性乳癌のエレノアノンコーディングRNAの発現解析 (2020)
  • Author(s): 福岡恵, 大迫智, 市川雄一, 上野貴之, 齊藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] Eleanor ncRNAs modulate the 3D genome architecture in recurrent breast cancer (2020)
  • Author(s): Yamamoto, T., Ichikawa, Y., Fukuoka, M., Saitoh, N.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Laboratory Meeting: Genome Organization & Nuclear Function
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 再発乳がんにおけるノンコーディングRNAによるクロマチン制御 (2020)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 日本遺伝学会第92回大会
  • Invited
• [Presentation] 乳癌におけるエレノアノンコーディングRNA発現の検討 (2020)
  • Author(s): 福岡恵, 大迫智, 上野貴之
  • Organizer: 第28回日本乳癌学会総会
• [Presentation] Non-coding RNAs in the 3D genome architecture in recurrent breast cancer (2020)
  • Author(s): 斉藤典子, 市川雄一, 福岡恵, 立和名博昭, 山本達郎
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
  • Invited
• [Presentation] 内分泌療法耐性乳がんモデル細胞における Glyceollin I のエスト ロゲンレセプター非依存的な細胞増殖抑制機構 (2020)
  • Author(s): 渡邉健司, 山本達郎, 市川雄一, 泉厚志, 落合孝次, 斉藤典子
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
• [Presentation] 転写制御に機能するヒストンH2A.Z のクロマチン局在機構の解析 (2020)
  • Author(s): 立和名博昭, ダッシェマリコ, 前原一満, 原田哲仁, 大川恭行, 木村宏, 胡桃坂仁志, 斉藤典子
  • Organizer: 第93回日本生化学会大会;
  • Invited
• [Presentation] 乳がんの3次元ゲノム構造に関わる機能性RNA (2020)
  • Author(s): 山本達郎, 市川雄一, 福岡恵, 立和名博昭, 渡邉健司, 斉藤典子
  • Organizer: 第43回日本分子生物学会年会
  • Invited
• [Presentation] ER陽性乳がん細胞における新規RNAクラウドの発見 (2020)
  • Author(s): 市川雄一, 斉藤典子
  • Organizer: 第43回日本分子生物学会年会
• [Presentation] クロマチン潜在能による転写バースト制御 (2020)
  • Author(s): 落合 博
  • Organizer: 第43回日本分子生物学会年会
  • Invited
• [Presentation] 分子の動きを「見る」ためのゲノム編集技術 (2020)
  • Author(s): 落合 博
  • Organizer: 第4回 広島大学先端科学セミナー「“ゲノム編集”で未来社会を拓く」
  • Invited
• [Presentation] ホルモン療法耐性乳がんにおける非コードRNAの機能的意義 (2020)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 第21 回クロマチン代謝制御セミナー、千葉大学
  • Invited
• [Presentation] ER陽性乳がんで高発現している非コードRNA Eleanorsを介した転写活性化 (2020)
  • Author(s): 市川雄一、斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] 内分泌療法耐性乳がんモデル細胞におけるGlyceollin Iのエストロゲンレセプター非依存的な細胞増殖抑制機構 (2020)
  • Author(s): 渡邉健司、山本達郎、市川雄一、泉厚志、落合孝次、斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] 原発性乳癌のエレノアノンコーディングRNAの発現解析 (2020)
  • Author(s): 福岡恵、大迫智、市川雄一、上野貴之、斉藤典子
  • Organizer: 第20回関東ホルモンと癌研究会
• [Presentation] 乳がん再発におけるノンコーディングRNAと核内構造体の役割 (2019)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 横浜市立大学セミナー
  • Invited
• [Presentation] Non-coding RNAs delineate the 3D genome architecture in endocrine-therapy resistant breast cancer (2019)
  • Author(s): Saitoh N
  • Organizer: Riken IMS Cancer Immunology Seminar Series
  • Invited
• [Presentation] 乳がん再発に関わる細胞核内長鎖ノンコーディングRNAとゲノム立体構造 (2019)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 第21 回クロマチン代謝制御セミナー、
  • Invited
• [Presentation] 核小体の構造、機能、物性に関わる60Sリボソームタンパク質 (2019)
  • Author(s): 松森はるか、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第19会日本タンパク質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会、神戸
  • Invited
• [Presentation] Non-coding RNAs that define the active chromatin domain in endocrine therapy resistant breast cancer cells. International Symposium for Female Researchers in Chromatin Biology 2019. Riken CDB, Kobe (2019)
  • Author(s): Yamamoto T, Ichikawa Y, Ohkawa Y, Hiratani I, Nakao M, Saitoh N
  • Organizer: International Symposium for Female Researchers in Chromatin Biology 2019
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] クロマチン高次構造によるヒストンの取り込み制御機構 (2019)
  • Author(s): 立和名博昭、ダッシェマリコ、前原一満、原田哲仁、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志、斉藤典子
  • Organizer: 第92回日本生化学会大会
  • Invited
• [Presentation] Analyzing H2A.Z functions in cancer progression (2019)
  • Author(s): Tachiwana H, Ueda K, Kurumizaka H, Saitoh N
  • Organizer: 第78回日本癌学会学術総会
• [Presentation] 高次クロマチン構造依存的なヒストン取り込み機構 (2019)
  • Author(s): 立和名博昭、ダッシェマリコ、前原一満、原田哲仁、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志、斉藤典子
  • Organizer: 第42回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Eleanor RNAクラウドを介した転写活性化機構 (2019)
  • Author(s): 市川雄一、斉藤典子
  • Organizer: RNAフロンティアミーティング2019
• [Presentation] ER陽性乳がん細胞におけるEleanor RNAクラウドを介した転写活性化機構 (2019)
  • Author(s): 市川雄一、斉藤典子
  • Organizer: 第42回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Eleanor 非コードRNAは乳がんの増殖と細胞死のバランスに関わる遠距離クロマチン相互作用を制御する (2019)
  • Author(s): 山本達郎、Abdalla Mohamed Osama、前原一満、野上順平、大川恭行、三浦尚、Rawin Poonperm、平谷伊智朗、中山秀樹、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第42回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Analysis of histone incorporation at the DNA sequence-level using permeabilized cells and reconstituted histone complexes. (2019)
  • Author(s): Tachiwana H, Dacher M, Harada A, Maehara K, Ohkawa Y, Kimura H, Kurumizaka H, Saitoh N.
  • Organizer: EMBO Workshop: Chromatin and Epigenetics
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Eleanor ncRNAs activate the chromatin domain and the long-range chromatin interaction in endocrine-therapy resistant breast cancer. (2019)
  • Author(s): Yamamoto T, Abdalla, MOA, Ohkawa Y, Hiratani I, Nakao M, Saitoh N
  • Organizer: Gordon Research Seminar on Genome Architecture in Cell Fate and Disease
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Eleanor RNAクラウドを介した転写活性化 (2019)
  • Author(s): 市川雄一、斉藤典子
  • Organizer: 第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] 乳がん細胞におけるGlyceollin Iのエストロゲンレセプター非依存的な増殖抑制機構の解析,第42回日本分子生物学会年会 (2019)
  • Author(s): 渡邉健司、山本達郎、市川雄一、泉厚志、落合孝次、斉藤典子
  • Organizer: 第78回日本癌学会学術総会
• [Presentation] 乳がん細胞におけるGlyceollin Iのエストロゲンレセプター非依存的な増殖抑制機構の解析 (2019)
  • Author(s): 渡邉健司、山本達郎、市川雄一、泉厚志、落合孝次、斉藤典子
  • Organizer: 第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] 乳がん細胞のエレノアクロマチンドメインは非コードRNAとクロマチン相互作用により制御される (2019)
  • Author(s): 山本達郎、中山秀樹、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第78回日本癌学会学術総会
• [Presentation] Eleanor 非コード RNA を介したクロマチン相互作用は治療耐性乳がんの増殖と細胞死 に関わる (2019)
  • Author(s): 山本達郎、Abdalla Mohamed Osama、前原一満、大川恭行、三浦尚、平谷伊智朗、中尾光善、斉藤典子
  • Organizer: 第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] ER陽性乳癌におけるEleanor 非コードRNAの臨床的意義の解明 (2019)
  • Author(s): 福岡恵、上野貴之、市川雄一、山本達郎、斉藤典子
  • Organizer: 第42回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 原発性乳癌におけるエレノアノンコーディングRNAの臨床的意義の解明 (2019)
  • Author(s): 福岡恵、大迫智、市川雄一、上野貴之、斉藤典子
  • Organizer: 第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] セントロメア特異的なヌクレオソームに含まれるコアヒストンが8量体を形成する意義 (2019)
  • Author(s): 市川雄一
  • Organizer: 生命機能研究科セミナー、大阪大学
  • Invited
• [Presentation] ncRNA によるクロマチンの制御 (2019)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 研究会・染色体研究の最前線2019
  • Invited
• [Presentation] クロマチンの機能を特徴づけるヒストンバリアントの取り込み機構 (2019)
  • Author(s): 立和名博昭
  • Organizer: 第36回染色体ワークショップ、第17回核ダイナミクス研究会
• [Presentation] ER陽性乳がんの治療抵抗性獲得に関与するノンコーディングRNA Eleanorの機能解析 (2019)
  • Author(s): 市川雄一
  • Organizer: 第36回 染色体ワークショップ 、第17回 核ダイナミクス研究会
• [Presentation] 転写バーストに由来する遺伝子発現量多様性 (2019)
  • Author(s): 落合博
  • Organizer: 第36回 染色体ワークショップ・第17回 核ダイナミクス研究会
• [Presentation] Eleanors define the active ESR1 chromatin domain in endocrine therapy-resistant breast cancer cells (2019)
  • Author(s): Saitoh, N.
  • Organizer: Keystone Symposia. Long Noncoding RNAs
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Nuclear non-coding RNAs Eleanors, define the active ESR1 chromatin domain in breast cancer cells. (2018)
  • Author(s): Saitoh, N.
  • Organizer: Cold Spring Harbor Conferences Asia, RNA Biology.
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Saitoh, N. Chromatin regulation by nuclear non-coding RNA in breast cancer cells. (2018)
  • Author(s): Saitoh, N.
  • Organizer: HiHA 国際ワークショップ ?染色体動態、分配と機能の理解に向かって
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 乳がんの高次クロマチンドメインに関わるノンコーディングRNA. (2018)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
  • Invited
• [Presentation] 乳がんに関わるノンコーディングRNAと細胞核内ゲノム構造. (2018)
  • Author(s): 斉藤典子
  • Organizer: 千葉大学 第16回クロマチン代謝制御セミナー
  • Invited
• [Presentation] ヒストンH2Aファミリーのダイナミクス (2018)
  • Author(s): 立和名博昭
  • Organizer: 蛋白研セミナー：細胞核とクロマチン構造が操る高次生命現象
  • Invited
• [Presentation] クロマチンの高次構造とヒストンダイナミクスの解析 (2018)
  • Author(s): 立和名 博昭
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 乳がんの治療抵抗性獲得に関わるlncRNA Eleanor の機能解析 (2018)
  • Author(s): 酒田祐佳
  • Organizer: 第６回X 染色体研究会
• [Presentation] ゲノム構造再編成における動的核変形の役割 (2018)
  • Author(s): 落合博
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
• [Presentation] 細胞多様性決定要因の網羅解析技術の開発 (2018)
  • Author(s): 落合博
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
• [Presentation] マウス胚性幹細胞における遺伝子発現量多様性の制御機構の包括的解析 (2018)
  • Author(s): 落合博
  • Organizer: 第91回日本生化学会大会
• [Presentation] Nuclear non-coding RNAs Eleanors, define the active ESR1 chromatin domain in breast cancer cells (2018)
  • Author(s): Saitoh, N.
  • Organizer: The 77th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
• [Presentation] Analysis of histone dynamics using permeabilized cells and reconstituted histone complexes (2018)
  • Author(s): Hiroaki Tachiwana
  • Organizer: The 77th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
• [Presentation] ER陽性乳がんで高発現しているノンコーディングRNAエレノアの機能解析 (2018)
  • Author(s): 市川雄一
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
• [Presentation] Eleanor非コードRNAは、乳癌の脆弱性に関連するクロマチン構造に影響を及ぼす (2018)
  • Author(s): 山本達郎
  • Organizer: 第77回日本癌学会学術総会
• [Presentation] Eleanor非コードRNAは、乳がんの増殖・細胞死に関わるクロマチン構造を制御する (2018)
  • Author(s): 山本達郎
  • Organizer: 第41回日本分子生物学会年会
• [Book] 月刊「細胞」52(9) 非ゲノム情報の複製機構 (2020)
  • Author(s): 市川雄一、斉藤典子
  • Publisher: ニューサイエンス社
• [Book] 月刊「細胞」52（6）遺伝子制御の基盤となる細胞核・クロマチン構造 (2020)
  • Author(s): 市川雄一、山本達郎、斉藤典子
  • Publisher: ニューサイエンス社 月刊「細胞」
• [Book] 医学のあゆみ 第272巻・第1号, (2020)
  • Author(s): 山本達郎、福岡恵、斉藤典子
  • Publisher: 医歯薬出版株式会社,
• [Book] 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール (大川恭行，宮成悠介／編) (2020)
  • Author(s): 大石 裕晃、落合 博
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール (大川恭行，宮成悠介／編) (2020)
  • Author(s): 落合 博
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 月刊「細胞」 (2019)
  • Author(s): 落合博
  • Total Pages: 76
  • Publisher: 北隆館
• [Book] 「実験医学」増刊 第36巻第17号、平野達也・胡桃坂仁志 編 「染色体の新常識」 (2018)
  • Author(s): 野澤竜介、斉藤典子
  • Publisher: 羊土社
• [Remarks] 公益財団法人がん研究会がん研究所がん生物部
  • URL: https://www.jfcr.or.jp/laboratory/department/cancer_biology/www/default.htm
• [Remarks] 広島大学 大学院 統合生命科学研究科 分子遺伝学研究室 落合グループ
  • URL: https://home.hiroshima-u.ac.jp/ochiai/
• [Remarks] 公益財団法人がん研究会がん生物部
  • URL: https://www.jfcr.or.jp/laboratory/department/cancer_biology/www/default.htm
• [Remarks] がん研究所がん生物部
  • URL: http://202.242.5.28/laboratory/department/cancer_biology/www/index.html
• [Remarks] がん研究所
  • URL: https://www.jfcr.or.jp/laboratory/department/cancer_biology/index.html
• [Patent(Industrial Property Rights)] グリセオリンＩの作用機序とその利用 (2018)
  • Inventor(s): 山本達郎、立和名博昭、斉藤典子、井出剛、落合孝次
  • Industrial Property Rights Holder: 山本達郎、立和名博昭、斉藤典子、井出剛、落合孝次
  • Industrial Property Rights Type: 特許
  • Filing Date: 2018