Post-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system

• Project Area: Post-Koch Ecology: The next-era microbial ecology that elucidates the super-terrestrial organism system
• Project/Area Number: 19H05682
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Complex systems
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 野村 暢彦 筑波大学, 生命環境系, 教授 (60292520)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 豊福 雅典 筑波大学, 生命環境系, 准教授 (30644827)
• Project Period (FY): 2019-06-28 – 2024-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥90,740,000 (Direct Cost: ¥69,800,000、Indirect Cost: ¥20,940,000); Fiscal Year 2023: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2022: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2021: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2020: ¥16,770,000 (Direct Cost: ¥12,900,000、Indirect Cost: ¥3,870,000); Fiscal Year 2019: ¥23,660,000 (Direct Cost: ¥18,200,000、Indirect Cost: ¥5,460,000)
• Keywords: 複合微生物 / イメージング解析 / 相互作用 / 遺伝子解析 / 複合微生物系バイオフィルム / 排水処理 / 細菌

Outline of Research at the Start

新規イメージング解析技術を用いることによって、3 次元構造をとる複合微生物系中の任意の微生物細胞を、空間配置そのままで、培養を介さず各微生物細胞に蛍光指紋をタグ付けを行う。そして、これまで分離・培養できなかった難培養性微生物を識別・分離・解析する技術を構築し、複合微生物系を構成するダークマター微生物（難培養性微生物）を分離可能にするポストコッホ微生物分離システムを開発する。

Outline of Annual Research Achievements

現代の微生物研究の手法は、19 世紀に確立されたコッホ型微生物学、即ち、寒天培地を用いて微生物を純粋分離するという旧態依然とした手 法に頼ってきた。しかし、環境のメタゲノム解析によって99%以上に及ぶ未分離・未解明の微生物にアクセスすることは極めて難しいことが分 かってきた。つまり、自然界の大部分の微生物は従来の手法では純粋分離できないのである。超地球生命体を構成する多様な微生物を知るため には、コッホの微生物学の殻を破る新たな「ポストコッホ技術」を確立し、「ポストコッホ機能生態系モル」を創生する必要があるイメージン グ解析技術を用いて複合微生物系を分離せずに各微生物細胞のタグ付けを行う。具体的には、新規イメージング解析技術CRIFを用いることによって、3 次元構造をとる複合微生物系中の任意の微生物細胞を、空間配置そのままで、培養を介さ ず各微生物細胞に蛍光指紋をタグ付けを行う。そして、これまで分離・培養できなかった難培養性微生物を識別・分離・解析する技術を構築し 、複合微生物系を構成するダークマター微生物(難培養性微生物)を分離可能にするポストコッホ微生物分離システムを開発する。
排水処理に用いられる活性汚泥は、複数の微生物が安定して存在する複合微生物系であることが知られている。また、領域全体で解析を進める モデル圃場の土壌と泥状の性状を示す点で類似している。そこで、まず活性汚泥を含む様々な複合微生物系サンプルを用いて、CRIF 解析による各微生物細胞のタグ付け を行う手法をすすめた。排水処理で最も重要な脱窒に関わる細菌をはじめ、大きさ・形のみでは判別不可能な細菌種をCRIFにより、分類つまりタグ付け出来る事が確認出来た。

Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

複合系微生物サンプル由来の各種細菌のタグ付けに新規イメージング解析技術(CRIF)が適用できる事がわかったことは、本新学術プロジェクトの展開また意義づけに大きく貢献するものである。
さらに、新規イメージング解析技術(CRIF)に おいて可視領域以外の励起波長により、当初の予想に反し 、定性評価が飛躍的に向上することが明らかとなった。本知見は、細胞の定性能の精度をさらに向上させるものであり、知的財産になると考えられ、そこについてもさらに解析を進めることとなった。

Strategy for Future Research Activity

新規イメージング解析技術(CRIF)は、自家蛍光シグネチャーに基づいて細胞の増殖状態や生育条件を高感度に判別できること、細胞の生理状態によって自家蛍光シグネチャーが変化することが明らかになってきた。本新学術プロジェクトの展開において、複合微生物系における微生物間相互作用をCRIFを用いて、非破壊・未処理でその細胞間の相互作用を理解することが最終目的になる。そこで、微生物間相互作用の中でもクオラムセンシング （Quorum sensing、QS） に着目する。QSは細胞密度の変動に応答して個々の細胞がシグナルを生産・受容し、QSが活性化すると遺伝子発現が変化する。細胞の生理状態を反映する自家蛍光シグネチャーをCRIFを用いることで、非破壊・未処理で細胞集団のQSの活性を予測・診断することができると期待される。QSの活性化は病原性発現などにも関係してることから、今後新たな研究手法の一つとしてだけでなく、環境中の細菌診断のみならず医療方面などでの細菌制御技術への応用も見込める。

Research Products

• [Journal Article] Sakamoto S, Nobu MK, Mayumi D, Tamazawa S, Kusada H, Yonebayashi H, Iwama H, Ikarashi M, Wakayama T, Maeda H, Sakata S, Tamura T, Nomura N, (2021)
  • Author(s): Sakamoto S, Nobu MK, Mayumi D, Tamazawa S, Kusada H, Yonebayashi H, Iwama H, Ikarashi M, Wakayama T, Maeda H, Sakata S, Tamura T, Nomura N,
  • Journal Title: Syst. Appl. Microbiol. Volume: 44 Issue: 1 Pages: 126154-126154
  • DOI: 10.1016/j.syapm.2020.126154
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Mycolic acid-containing bacteria trigger distinct types of membrane vesicles through different routes (2021)
  • Author(s): Nagakubo Toshiki、Tahara Yuhei O.、Miyata Makoto、Nomura Nobuhiko、Toyofuku Masanori
  • Journal Title: iScience Volume: 24 Issue: 1 Pages: 102015-102015
  • DOI: 10.1016/j.isci.2020.102015
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Diversity of physical properties of bacterial extracellular membrane vesicles revealed through atomic force microscopy phase imaging (2020)
  • Author(s): Kikuchi Yousuke、Obana Nozomu、Toyofuku Masanori、Kodera Noriyuki、Soma Takamitsu、Ando Toshio、Fukumori Yoshihiro、Nomura Nobuhiko、Taoka Azuma
  • Journal Title: Nanoscale Volume: 12 Issue: 14 Pages: 7950-7959
  • DOI: 10.1039/c9nr10850e
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Involvement of membrane vesicles in long‐chain‐ AHL delivery in Paracoccus species (2020)
  • Author(s): Morinaga Kana、Nagakubo Toshiki、Nomura Nobuhiko、Toyofuku Masanori
  • Journal Title: Environmental Microbiology Reports Volume: 12 Issue: 3 Pages: 355-360
  • DOI: 10.1111/1758-2229.12843
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Biofilm Formation by <i>Streptococcus mutans</i> is Enhanced by Indole via the Quorum Sensing Pathway (2020)
  • Author(s): Inaba Tomohiro、Obana Nozomu、Habe Hiroshi、Nomura Nobuhiko
  • Journal Title: Microbes and Environments Volume: 35 Issue: 2 Pages: n/a
  • DOI: 10.1264/jsme2.ME19164
  • NAID: 130007837477
  • ISSN: 1342-6311, 1347-4405
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Reconstruction of Single-Cell Innate Fluorescence Signature by Confocal Microscopy (2020)
  • Author(s): Tomohiro Hirayama, Kyosuke Takabe, Tatsunori Kiyokawa, Nobuhiko Nomura, Yutaka Yawata
  • Journal Title: Journal of Visualised Experiments Volume: 159 Issue: 159
  • DOI: 10.3791/61120
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Synergy between Sophorolipid Biosurfactant and SDS Increases the Efficiency of P. aeruginosa Biofilm Disruption (2020)
  • Author(s): Nguyen BVG, Nagakubo T, Toyofuku M, Nomura N, Utada AS
  • Journal Title: Langmuir Volume: 36 Issue: 23 Pages: 6411-6420
  • DOI: 10.1021/acs.langmuir.0c00643
  • NAID: 120007132630
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Temperature-regulated heterogeneous extracellular matrix gene expression defines biofilm morphology in Clostridium perfringens (2020)
  • Author(s): Obana N, Nakamura K, Nomura N.
  • Journal Title: NPJ Biofilms Microbiomes Volume: 6 Issue: 1 Pages: 29-29
  • DOI: 10.1038/s41522-020-00139-7
  • NAID: 120007147871
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Potential Risk of Spreading Resistance Genes within Extracellular-DNA-Dependent Biofilms of Streptococcus mutans in Response to Cell Envelope Stress Induced by Sub-MICs of Bacitracin (2020)
  • Author(s): Nagasawa Ryo、Sato Tsutomu、Nomura Nobuhiko、Nakamura Tomoyo、Senpuku Hidenobu
  • Journal Title: Applied and Environmental Microbiology Volume: 86 Issue: 16
  • DOI: 10.1128/aem.00770-20
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Fungal mycelia and bacterial thiamine establish a mutualistic growth mechanism. (2020)
  • Author(s): Abeysinghe G, Kuchira M, Kudo G, Masuo S, Ninomiya A, Takahashi K, Utada AS, Hagiwara D, Nomura N, Takaya N, Obana N, Takeshita N.
  • Journal Title: Life Sci Alliance Volume: 3 Issue: 12 Pages: e202000878-e202000878
  • DOI: 10.26508/lsa.202000878
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Competence-stimulating peptide-dependent localized cell death and extracellular DNA production in Streptococcus mutans biofilms (2020)
  • Author(s): Nagasawa R, Yamamoto T, Utada AS, Nomura N, Obana N
  • Journal Title: Applied and Environmental Microbiology Volume: 86 Issue: 23 Pages: 1-17
  • DOI: 10.1128/aem.02080-20
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Point Mutations Lead to Increased Levels of c-di-GMP and Phenotypic Changes to the Colony Biofilm Morphology in <i>Alcanivorax borkumensis</i> SK2 (2019)
  • Author(s): Prasad, M., Obana, N., Sakai, K., Nagakubo, T., Miyazaki, S., Toyofuku, M., Fattaccioli, J., Nomura, N. and Utada A. S.
  • Journal Title: Microbes and Environments Volume: 34 Issue: 1 Pages: 104-107
  • DOI: 10.1264/jsme2.ME18151
  • NAID: 130007627746
  • ISSN: 1342-6311, 1347-4405
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Intra- and Interspecies Variability of Single-Cell Innate Fluorescence Signature of Microbial Cell (2019)
  • Author(s): Yawata Yutaka、Kiyokawa Tatsunori、Kawamura Yuhki、Hirayama Tomohiro、Takabe Kyosuke、Nomura Nobuhiko
  • Journal Title: Applied and Environmental Microbiology Volume: 85 Issue: 18 Pages: 1-10
  • DOI: 10.1128/aem.00608-19
  • NAID: 120007133099
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Polyfunctional nanofibril appendages mediate attachment, filamentation, and filament adaptability in Leptothrix cholodnii (2019)
  • Author(s): Kunoh T, Morinaga K, Sugimoto S, Miyazaki S, Toyofuku M, Iwasaki K, Nomura N, Utada AS
  • Journal Title: ACS Nano Volume: 14 Issue: 5 Pages: 5288-5297
  • DOI: 10.1021/acsnano.9b04663
  • NAID: 120007132616
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Presentation] 界面活性剤の相乗効果を利用した革新的バイオフィルム制御の開発 (2021)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 電子情報通信学会システムナノ技術に関する特別研究専門委員会主催 第1回研究会「科学技術イノベーションを創成する先進システムナノ技術」
  • Invited
• [Presentation] 膜小胞を介した細菌間コミュニケーションの研究 (2021)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 日本微生物連盟 野本賞受賞講演
  • Invited
• [Presentation] 凝集から考える微生物生態 (2021)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 2020年度界面動電現象研究会
  • Invited
• [Presentation] 集団微生物学としてのバイオフィルム研究 (2021)
  • Author(s): 野村暢彦，豊福雅典，尾花望
  • Organizer: 第94回日本細菌学会総会 シンポジウム集団微生物学と細菌バイオフィルム研究の前線
  • Invited
• [Presentation] Streptococcus mutansバイオフィルム形成における細胞死と細胞外DNA産生 (2021)
  • Author(s): 永沢亮，Andrew S. Utada，野村暢彦，尾花望
  • Organizer: 第94回日本細菌学会総会 シンポジウム集団微生物学と細菌バイオフィルム研究の前線
  • Invited
• [Presentation] Streptococcus mutansバイオフィルム形成における細胞死と細胞外DNA産生 (2021)
  • Author(s): 永沢 亮、Andrew S. Utada、野村暢彦、尾花 望
  • Organizer: 第94回日本細菌学会総会
  • Invited
• [Presentation] メンブレンベシクル形成機構の多様性と普遍性 (2021)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 日本農芸化学会2021年度仙台大会
  • Invited
• [Presentation] Bacterial Trafficking of Biomolecules Through Membrane Vesicles (2021)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: Annual meeting of electrokinetic society Japan
  • Invited
• [Presentation] 膜小胞を介した細菌間コミュニケーションの研究 (2020)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 日本微生物連盟 野本賞受賞講演
  • Invited
• [Presentation] 凝集から考える微生物生態 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 2020年度界面動電現象研究会
  • Invited
• [Presentation] 細胞が放つ細胞外膜粒子（メンブレンべシクル(MV)) (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: JST CREST「細胞外微粒子に起因する生命現象の解明とその制御に向けた基盤技術の創出」
  • Invited
• [Presentation] 微生物の個・集団・共生が支える持続可能な社会 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: micsシンポジウム
  • Invited
• [Presentation] MV形成機構におけるパラダイムシフトとその応用 (2020)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 第93回日本細菌学会総会
  • Invited
• [Presentation] 微生物が放出する多様なベシクル (2020)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 高分子と水・分離に関する研究会および2019年度界面動電現象研究会
  • Invited
• [Presentation] Bacterial membrane vesicle formation through cell death (2020)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 日本農芸化学会2020年度大会
  • Invited
• [Presentation] 多様性を基盤にした微生物研究の最前線 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 日本農芸化学会2020年度大会
  • Invited
• [Presentation] Extracellular DNA production within the biofilm formed by Streptococcus mutans (2020)
  • Author(s): Ryo Nagasawa, Nozomu Obana, Andrew S. Utada, Nobuhiko Nomura
  • Organizer: BACELL 2020
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Quorum sensing controlling heterogeneity and biofilm morphology (2020)
  • Author(s): Yoshihiko Tabushi, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura
  • Organizer: BACELL 2020
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Quorum sensing regulated membrane vesicle production in Streptococcus mutans (2020)
  • Author(s): Chika Yamamoto, Ryo Nagasawa, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura, Masanori Toyofuku
  • Organizer: BACELL 2020
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Interplay between biofilm formationand sporulation in Paenibacillus polymyxa (2020)
  • Author(s): Yuta Hasegawa, Hiroko Kato, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura
  • Organizer: BACELL 2020
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Phase variation-derived functional differentiation in biofilm of Lactobacillus plantarum (2020)
  • Author(s): Kaori Shibusawa, Yuka Ehashi, Kimihiro Abe, Nozomu Obana, Nobuhiko Nomura
  • Organizer: BACELL 2020
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] ポストコロナ戦略シリーズ3 「微生物の「会話」から読み解く集団の制御とコロナに負けない健康生活」 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: バイオインダストリー協会 ポストコロナ戦略シリーズ
  • Invited
• [Presentation] 細菌集団における細胞不均一性と多様性 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 日本生物工学会 生物工学Webシンポジウム2020
  • Invited
• [Presentation] 教育講演3 21世紀の重要な微生物研究課題「バイオフィルムの理解と制御」 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 第68回日本化学療法学会総会
  • Invited
• [Presentation] 細菌における多様なMV形成機構 (2020)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 第93回日本生化学会大会
  • Invited
• [Presentation] Salicylic Acid and Jasmonic Acid Pathways are Activated in Spatially Different Domains Around the Infection Site During Effector-Triggered Immunity in Arabidopsis thaliana (2020)
  • Author(s): Shigeyuki Betsuyaku, Shinpei Katou, Yumiko Takebayashi, Hitoshi Sakakibara,
  • Organizer: 大阪年会サテライトシンポジウム・学会賞受賞講演
  • Invited
• [Presentation] 新奇細菌コミュニケーションシステムの発見と地球生態系における細菌の位置づけ (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 2020年度山口大学中高温微生物研究センター 環境微生物部門シンポジウム
  • Invited
• [Presentation] デバイスを用いた微生物の動きの見える化技術を未病の見える化に応用できるのか (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 日本学術振興会 食と未病マーカー委員会
  • Invited
• [Presentation] Tip-enhanced Raman spectroscopy of single bacterial membrane vesicles (2019)
  • Author(s): Takahashi K, Yasuda M, Toyofuku M, Shigeto S.
  • Organizer: 10th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Cell-to-Cell Communication Converts by Insertion Sequences in P. aeruginosa (2019)
  • Author(s): Suzawa Y, Toya M, Obana N, Kogure K, Nomura N, Toyofuku M.
  • Organizer: Pseudomonas 2019
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Environmental stress-induced membrane vesicle formation in Bacillus subtilis (2019)
  • Author(s): Abe K, Obana N, Toyofuku M, Nomura N.
  • Organizer: 20th International Conference on Bacilli and Gram-Positive Bacteria
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Phage-like bacteriocin PBSX is produced heterogeneously by Bacillus subtilis (2019)
  • Author(s): Yamamoto T, Toyofuku M, Nomura N.
  • Organizer: 20th International Conference on Bacilli and Gram-Positive Bacteria
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 生体内小分子はどのように細胞間を移動しているのだろうか？～微生物間コミュニケーションの新たな展開～ (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 微生物ウィーク2019 生体内小分子の検出と生物間コミュニケーション
  • Invited
• [Presentation] 微生物も群れて会話する (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 関東非線形非平衡バイオソフトマターセミナー
  • Invited
• [Presentation] How do bacteria “really” communicate? (2019)
  • Author(s): Toyofuku M
  • Organizer: Marine Biotechnology Conference 2019
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] Polymicrobial distribution of bacteria controlled using core-shell microcapsules (2019)
  • Author(s): Takahashi K, Toyofuku M, Ogawa K, Nomura N, Utada AS.
  • Organizer: Eurobiofilms2019
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 細菌が構築するバイオフィルムのイメージング (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 第162回日本獣医学会学術集会 微生物学分科会「微生物研究のイメージング戦略」
  • Invited
• [Presentation] Biofilmｓ and membrane vesicles (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: ASBA Asian association of synthetic biology
  • Int'l Joint Research / Invited
• [Presentation] 集団微生物制御への展開そしてポストERATOを見据えて (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: JST ERATO深津共生進化機構プロジェクト キックオフシンポジウム
  • Invited
• [Presentation] 細菌のメンブレンベシクル形成機構と機能 (2019)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 愛媛微生物学ネットワーク（NAME）
  • Invited
• [Presentation] 「一細胞～集団における生体機能の可視化の最前線 (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 花王株式会社 講演
  • Invited
• [Presentation] サステイナブルな社会へ向けた微生物の役割と可能性 (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 住友重機械工業 基調講演
  • Invited
• [Presentation] 微生物がつくる膜粒子(MV) ~MVの形成機構と機能~ (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 日本油化学会オレオマテリアル部会 第三回オレオマテリアル交流会
  • Invited
• [Presentation] 食・健康・環境にかかわる微生物の制御を目指して ~微生物も群れて会話する~ (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 広島醗酵会・日本技術士会
  • Invited
• [Presentation] Leptothrix nanofibril appendages mediate attachment, filamentation, and filament adaptability (2019)
  • Author(s): Kunoh T, Morinaga K, Sugimoto S, Toyofuku M, Nomura N, Utada AS.
  • Organizer: The 31st Annual Meeting of the Thai Society for Biotechnology and International Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] Control of Polyhydroxyalkanoate production by Quorum Sensing (2019)
  • Author(s): Nakashima R, Norinaga K, Yasuda M, Nomura N, Toyofuku M
  • Organizer: The 31st Annual Meeting of the Thai Society for Biotechnology and International Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] DNA transfer via membrane vesicles in Bacillus subtilis (2019)
  • Author(s): Soma T, Yamamoto T, Obana N, Nomura N, Toyofuku M
  • Organizer: The 31st Annual Meeting of the Thai Society for Biotechnology and International Conference
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 細菌の生き様を捉える (2019)
  • Author(s): 豊福雅典
  • Organizer: 生化学若い研究者の会
  • Invited
• [Presentation] 課題創造学 (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 筑波大学STEAMリーダーシッププログラム講座
  • Invited
• [Presentation] 健康・食・環境に関わる微生物制御技術の新展開～微生物集団の全貌解明と制御に向けて～ (2019)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Organizer: 第36回JBDAバイオベンチャーフォーラム
  • Invited
• [Book] バイオサーファクタントによるバイオフィルム除去および形成抑制 (2021)
  • Author(s): 高橋晃平、久能 樹、野村暢彦、Andrew S. Utada
  • Total Pages: 4
  • Publisher: バイオサイエンスとインダストリー 79(2)
• [Book] 醸造の事典 2-40バイオフィルムと醸造 (2021)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Total Pages: 2
  • Publisher: 朝倉書店
• [Book] Cracking Open Bacterial Membrane Vesicles (2020)
  • Author(s): Nagakubo T, Nomura N, Toyofuku M
  • Total Pages: 9
  • Publisher: Frontiers in Microbiology?10
• [Book] Peculiarities of biofilm formation by Paracoccus denitrificans and associated factors (2020)
  • Author(s): Morinaga K, Yoshida K, Takahashi K, Nomura N, Toyofuku M
  • Total Pages: 7
  • Publisher: Applied Microbiology and Biotechnology, 104(6)
• [Book] Biofilms: Hot spots of horizontal gene transfer (HGT) in aquatic environments, with a focus on a new HGT mechanism (2020)
  • Author(s): Abe K, Nomura N, Suzuki S
  • Total Pages: 12
  • Publisher: FEMS Microbiology Ecology
• [Book] 特集 ERATO野村集団微生物制御プロジェクトについて～細菌の集団形成と社会性の創発～（前編） 「特集によせて」 (2020)
  • Author(s): 野村暢彦
  • Total Pages: 4
  • Publisher: 生物工学会誌 98(6)
• [Book] Leptothrix属細菌の分泌ナノ繊維を介した生存戦略 (2020)
  • Author(s): 久能 樹、山本達也、Andrew S. Utada、野村暢彦
  • Total Pages: 4
  • Publisher: バイオサイエンスとインダストリー 78(4)
• [Book] 第18 回日本油化学会オレオサイエンス賞受賞に寄せて －「見る」ことで明らかとなったベシクルの新奇形成機構－ (2019)
  • Author(s): 山本達也、野村暢彦、豊福雅典
  • Total Pages: 10
  • Publisher: オレオサイエンス Vol.19, No8
• [Book] Bacterial communication through membrane vesicles (2019)
  • Author(s): Toyofuku M.
  • Total Pages: 6
  • Publisher: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 83(9)