Genome modality in interphase genome structure

Planned

Project Area	Genome modality: understanding physical properties of the genome
Project/Area Number	20H05937
Research Category	Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
Allocation Type	Single-year Grants
Review Section	Transformative Research Areas, Section (III)
Research Institution	Nagoya University
Principal Investigator	西山朋子名古屋大学, 理学研究科, 准教授 (90615535)
Project Period (FY)	2020-11-19 – 2025-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help	¥156,000,000 (Direct Cost: ¥120,000,000、Indirect Cost: ¥36,000,000) Fiscal Year 2021: ¥27,560,000 (Direct Cost: ¥21,200,000、Indirect Cost: ¥6,360,000) Fiscal Year 2020: ¥41,080,000 (Direct Cost: ¥31,600,000、Indirect Cost: ¥9,480,000)
Keywords	クロマチン高次構造 / SMC / 間期クロマチン構造 / コヒーシン
Outline of Research at the Start	本研究では、長大なDNAが微小核内に収納されるしくみを解明するため、DNAループ形成に着目する。DNAループ形成を司ると考えられているのがSMCタンパク質複合体であるが、そのDNAループ形成機構は未だに明らかになっていない。本研究では、SMCタンパク質複合体の一つであるコヒーシンが間期核内でDNAをコンパクトに束ねてメゾスケールゲノム構を作りあげる仕組みを解明する。特にDNAの物性変化に着目し、剛直なdsDNAをループ状に変化させるメカニズムを明らかにする。さらに、この仕組みとコヒーシン病変異との関連性を検証することで、メゾスケールから疾患につながるゲノムモダリティ制御を明らかにする。