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Large-scale neural activity recordings and a holistic understanding of the brain

Planned Research

Project AreaHolism in neuroscience: Large-scale recording and simulation
Project/Area Number 21H05135
Research Category

Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Transformative Research Areas, Section (III)
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

平 理一郎  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 准教授 (80712299)

Project Period (FY) 2021-08-23 – 2024-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥35,490,000 (Direct Cost: ¥27,300,000、Indirect Cost: ¥8,190,000)
Fiscal Year 2023: ¥10,920,000 (Direct Cost: ¥8,400,000、Indirect Cost: ¥2,520,000)
Fiscal Year 2022: ¥10,920,000 (Direct Cost: ¥8,400,000、Indirect Cost: ¥2,520,000)
Fiscal Year 2021: ¥13,650,000 (Direct Cost: ¥10,500,000、Indirect Cost: ¥3,150,000)
Keywords全体性 / 大規模計測 / 2光子顕微鏡
Outline of Research at the Start

本研究は、大脳皮質・基底核・小脳・視床における高次機能を司る領域をターゲットとし、同時かつ多重に神経活動を計測し、高次領野間の連携機構を精査することで、脳の「全体性」の実体を解明する。そのために、世界最大視野の2光子顕微鏡を用いた10万細胞同時カルシウムイメージングを中心に、スキャン光遺伝学刺激、多点ファイバーフォトメトリ―法、高密度電極Neuropixelsを齧歯類の脳に対して合理的に併用し、様々な認知行動課題中の神経活動を多領域から大規模かつ慢性的に計測する。得られた大規模データを大規模シミュレーションの拘束条件とすることで、脳全体のダイナミクスを再現することを試みる。

Outline of Annual Research Achievements

本年度は主に新規の顕微鏡の立ち上げを進めると同時に、NeuropixelsプローブとScan optogeneticsシステムを用いた大脳皮質、小脳、大脳基底核、上丘間の機能的結合の同定の実験、ファイバーフォトメトリ実験を進めた。新規の顕微鏡立ち上げにおいては、世界最大視野を有する2光子顕微鏡(Diesel2p;Yu, Stirman, Yu, Hira, Smith 2021)を再設計したものを京セラSOC社と開発し、導入した。現在のところパーツの60%程度が組みあがっている。カルシウムイメージングが可能なマウスの作成にまで行かなかったため、この顕微鏡を用いた動物実験は完了していない。NeuropixelsとScan optogeneticsシステムの実験系においては、大脳皮質にChR2が発現したラットを用い、大脳皮質の10mm x 10mmの領域を32 x 32に分割した一点一点を1秒間に10点程度のスピードで青色レーザー光刺激した。刺激に応答する細胞活動を、小脳、大脳基底核、上丘において記録することに成功した。特に小脳においては、小脳核、苔状線維、プルキンエ細胞からの応答が、マップおよびPSTH(遅延時間)において明確に区別された。大脳基底核においては主にSNrをターゲットとしており、上丘においては外側部分をターゲットとしている。加えてファイバーフォトメトリを用いて大脳基底核のカルシウムイメージングとドーパミン記録に成功したが、赤色のカルシウムイメージングには成功していないためこれらを同時に測定することが次の課題である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

顕微鏡の構築については、京セラSOC社の製造工程が予定通り6カ月で完了している。これに光学部品を付け加えるところは22年度前半で行う予定である。NeuropixelsとScan optogeneticsシステムは予定通り進捗した。特に小脳においては既に大規模なデータを得ている。ファイバーフォトメトリについても覚醒動物を用いた実験が順調に進捗しており、今後は多重化のステップに移る事ができると考えらえる。世界的な半導体不足によるスキャナーの納品の遅延などがあるが、それらについても現在のところは対応できている。コロナウイルスの問題もあり動物の搬入に時間がかかったことでカルシウムイメージングまではできなかったが、実験系の実証としては問題なく進んでいると考えらえる。

Strategy for Future Research Activity

広視野2光子顕微鏡を立ち上げるとともに、カルシウム感受性タンパクGCaMPを発現したマウスの飼育を行い、頭部固定具手術を行って、in vivoカルシウムイメージングを行う。10万細胞程度の記録を行う。それと同時にファーバーフォトメトリによるドーパミンやノルアドレナリンの活動記録を行う。これと並行してNeuropixelsとScan optogeneticsシステムを使った実験を進める。後者に関しては既にデータが得られているため、A03,04班と連携して大規模シミュレーションに統合していく。

Report

(1 results)
  • 2021 Annual Research Report

Research Products

(6 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Diesel2p mesoscope with dual independent scan engines for flexible capture of dynamics in distributed neural circuitry2021

    • Author(s)
      Yu Che-Hang、Stirman Jeffrey N.、Yu Yiyi、Hira Riichiro、Smith Spencer L.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 6639-6639

    • DOI

      10.1038/s41467-021-26736-4

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] A neuronal basis underlying reward prediction based on hidden task rules2022

    • Author(s)
      Yoshizawa. T., Miyamura Y., Ochi Y., Hira R., Funahashi M., Sakai Y., Cui Y., Isomura Y
    • Organizer
      日本神経科学学会 Neuro 2022
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] High-throughput mapping of multi-synaptic functional pathways from the cerebrum to the cerebellar nucleus studied by Neuropixels and scan-optogenetics2022

    • Author(s)
      Yoshida Y., Aoki S., Isomura Y., Hira R
    • Organizer
      日本神経科学学会 Neuro 2022
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] In-house manufacture of an inexpensive large field-of-view two-photon microscope2021

    • Author(s)
      Hira R., Yamauchi Y., Isomura Y
    • Organizer
      第99回日本生理学会大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 広視野2光子イメージングによる頭頂連合野と周辺領域の相関構造解析2021

    • Author(s)
      平 理一郎
    • Organizer
      レーザ顕微鏡研究会第46回講演会・シンポジウム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 大規模神経活動記録と全体性の神経科学2021

    • Author(s)
      平 理一郎
    • Organizer
      神経回路学会シンポジウムⅡ
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

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Published: 2021-10-22   Modified: 2023-07-19  

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