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ラン藻のゲノム情報に基づいた生理機能の解析

Research Project

Project/Area Number 00J60306
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field 植物生理
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

岡本 忍  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2000 – 2002
Project Status Completed (Fiscal Year 2002)
Budget Amount *help
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2001: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsAnabaena / フィトクロム / DNA microarray / Synechocystis / GAF / PilT
Research Abstract

ラン藻のゲノム情報に基づく生理機能の網羅的解析と包括的な理解を目指して研究を行っている。
1.Anabaena sp. PCC7120の情報伝達系を司るcAMPは、外界の光によって、その量が調節されている。光を最初に受け取るセンサーとしては光受容タンパク質フィトクロムが候補として考えられた。フィトクロムの候補タンパク質をA.7120ゲノム配列から抽出して、各々の破壊株を作製した。作製した破壊株を用いて光質、光量によるcAMPレベルの変化による外界への応答性の表現系を解析した。その結果、all2699破壊株においてcAMPの光応答性が失われることが明らかになった。この遺伝子をAphC(Anabaena phytochrome C)と名付けた。
2.環境条件に応答して発現の調節される遺伝子群の動態を網羅的にとらえる手段の一つとしてAnabaena sp. PCC7120のDNA microarrayを作製した。何度かの改良を重ねて約2400個のスポットにゲノム全体の遺伝子を97%カバーするMicroarrayを完成した。このMicroarrayを用いて、AphC破壊株と野生株で遠赤色光照射化での遺伝子の発現量を比較することによりAphCの制御下にある遺伝子をスクリーニングしている。
3.Synechocystis sp. PCC6803は単細胞性のラン藻で運動能を有し、光波長依存的な走性を示す。この運動メカニズムは一世紀以上の研究があるにもかかわらず不明であった。S. 6803のゲノム配列から運動への関与が予測される遺伝子を破壊した。そのなかでsll0161(pilT1)の遺伝子を破壊すると運動能が失われることを見いだした。この知見からS. 6803はpili線毛といわれる、繊維状構造を使って運動することが明らかになった。PilT1はATPase活性があることを大腸菌を用いた組み換えタンパク質で証明した。さらにこの遺伝子は形質転換能にも必要であることを見いだした。

Report

(1 results)
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All Other

All Publications (5 results)

  • [Publications] Masayuki Ohmori: "Characterization of genes encoding multi-domain proteins in the genome of the filamentous nitrogen-fixing cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120"DNA Res.. 8. 271-284 (2001)

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  • [Publications] Okamoto S.: "AphC, a New Photoreceptor for Far-red light controls cellular cAMP cascade in Anabaena sp. PCC 7120"Plant Cell Physiol.. S230. 43 (2002)

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  • [Publications] Yoshimura H.: "A cAMP receptor protein, SYCRP1, is responsible for the cell motility of Synechocystis sp. PCC 6803"Plant Cell Physiol.. 43. 460-463 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Masayuki Ohmori: "Regulation of cAMP-mediated Phtosignaling by a Phytochrome in the Cyanobacterium Anabaena cylindrica"Photochem Photobiol.. 75. 675-679 (2002)

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  • [Publications] Okamoto S: "The Cyanobacterial PilT Protein Responsible for Cell Motility and Transformation Hydrolyzes ATP"Plant Cell Physiol.. 43. 1127-1136 (2002)

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      2002 Annual Research Report

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Published: 2001-04-01   Modified: 2024-03-26  

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