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アプタマーを利用したインフルエンザウイルスのジエノタイピング

Research Project

Project/Area Number 04F04534
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

PENMETCHA K.R.Kumar  独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 主任研究員

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) SUBASH CHANDRA BOSE Gopimath  独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2004 – 2005
Project Status Completed (Fiscal Year 2005)
Budget Amount *help
¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsアプタマー / インフルエンザ / ジェノタイピング / RNA / Hemagglutinin / 膜融合 / 阻害
Research Abstract

様々な種類の標的分子に対するアプタマーは、良く知られる抗原抗体反応と同様に優れた結合特異性と親和性を示す。このアプタマーを病原体やウイルスの株を識別するジェノタイピングに利用するために、我々はA型ヒトインフルエンザウイルスH3N2の近縁株を用い、それぞれに特異的に結合し識別するアプタマーの単離を目的にインビトロセレクションを行った。単離されたアプタマーP30-10-16は標的分子A/Panama/2007/1999(H3N2)のウイルス表面タンパク質であるHemagglutinin(HA)に特異的に結合し、同じ亜型間の別株のインフルエンザウイルスには結合しなかった。またこのアプタマーはHAに対して抗HAモノクローナル抗体の15倍以上もの親和性を持ち、HAを介したウイルスの膜融合を効果的に阻害することも確認された。
さらに我々はインフルエンザウイルスB/Johannesburg/05/1999に対して親和性のあるRNAアプタマーの単離にも成功した。このアプタマーは5mMのMgCl_2イオン存在下でB型インフルエンザウイルスのHAに効率よく結合し、膜融合阻害能も保持していた。
これらの研究成果はアプタマーによるウイルスのジェノタイピングの基本概念とその利用価値を強く支持するものとなった。

Report

(1 results)
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2006 2005 2004

All Journal Article (6 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] An efficient RNA aptamer against human influenza B virus hemagglutinin.2006

    • Author(s)
      Subash C.B.Gopinath et al.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry (In press)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] A potent anti-coagulant RNA aptamer inhibits blood coagulation by specifically blocking the extrinsic clotting pathway.2006

    • Author(s)
      Subash C.B.Gopinath et al.
    • Journal Title

      Thrombosis and Haemostasis (In press)

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] An RNA aptamer that distinguishes between closely related human influenza viruses and inhibits hemagglutinin-mediated membrane fusion.2006

    • Author(s)
      Subash C.B.Gopinath et al.
    • Journal Title

      Journal of General Virology 87

      Pages: 479-487

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Selection of RNA-aptamer against human influenza B virus.2005

    • Author(s)
      Subash C.B.Gopinath et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.Symp.series 49

      Pages: 85-86

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Human vault-associated non-coding RNAs bind to mitoxantrone, a chemotherapeutic compound.2005

    • Author(s)
      Subash C.B.Gopinath et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 33

      Pages: 4874-4881

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Identification of important chemical groups or the hut mRNA for HutP interactions that regulates the hut operon in Bacillus subtilis2004

    • Author(s)
      T.Kumarevel et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 32

      Pages: 3904-3912

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] インフルエンザウイルスの検出方法2004

    • Inventor(s)
      ペンメッチャ・クマール, スバシュ・チャンドラ・ボウズ・ゴピナト, 御園 智子, 川崎 一則
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人産業技術総合研究所
    • Industrial Property Number
      2004-293679
    • Filing Date
      2004-10-06
    • Acquisition Date
      2005-05-26
    • Related Report
      2005 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2024-03-26  

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