リボヌクレオーム解析によるRNA修飾酵素遺伝子の網羅的探索
Project/Area Number |
04J11735
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Applied genomics
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Research Institution | The University of Tokyo |
Research Fellow |
池内 与志穂 東京大学, 大学院工学系研究科, 特別研究員(DC1)
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Project Period (FY) |
2004 – 2006
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2006)
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Budget Amount *help |
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2006: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2005: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2004: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
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Keywords | RNA修飾 / lysidine / ac^4C / tilS / TmcA / 大腸菌 / tRNA / 翻訳 / LC / MS |
Research Abstract |
初年度から継続して行った大腸菌のRNA修飾遺伝子の網羅的な探索により,合計11の遺伝子を同定することに成功した(リスト).今年度は特にTmcAについて詳細な解析を行った.バクテリアにおいてAUAコドンを翻訳するイソロイシンtRNA(tRNAI^<Ile2>)のアンチコドン1字目のシチジンはlysidineという修飾を受けるが,lysidineはtRNA^<Ile2>のコドン認識をAUGからAUAに変え,アミノ酸受容能をメチオニンからイソロイシンに変化させる翻訳に必須な修飾である.昨年度までにlysidine修飾遺伝子tilSを同定し機能解析を行った.一方で,AUGコドンを翻訳するメチオニンtRNA(tRNA^<Met>)のアンチコドン1字目のシチジンはアセチル化され,ac^4Cとなる.tRNA^<Ile2>とtRNA^<Met>の塩基配列は良く似ており,lysidineおよびac^4C修飾酵素がこれらのtRNAをどのように識別するのかを知ることは翻訳システムの成り立ちを理解する上で重要である.すでにlysidine修飾酵素TilSは主にtRNA^<Ile2>のアクセプターステムを認識していることを明らかにしていたが,今年度はac^4C修飾酵素TmcAが主にtRNA^<Met>のアンチコドンステムを認識していることを明らかにした.これらの結果から,lysidine修飾酵素TilSとac^4C修飾酵素TmcAという二つのRNA修飾酵素が二つのtRNAを正確に識別する機構が明らかになり,未だ明らかになっていなかった翻訳システムの基礎的なメカニズムの一部を解明したといえる.
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Report
(3 results)
Research Products
(12 results)
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[Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the tRNA thiolation enzyme MnmA from Escherichia coli complexed with tRNA(Glu).2006
Author(s)
Numata T, Ikeuchi Y, Fukai S, Adachi H, Matsumura H, Takano K, Murakami S, Inoue T, Mori Y, Sasaki T, Suzuki T, Nureki O.
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Journal Title
Acta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun. 62・Pt4
Pages: 368-71
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[Journal Article] Substrate tRNA recognition mechanism of tRNA(m7G46) methyltransferase from Aquifex aeolicus2004
Author(s)
Okamoto, H., Watanabe, K., Ikeuchi, Y., Suzuki, T., Endo, Y., Hori, H.
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Journal Title
J.Biol.Chem. 279
Pages: 49151-49159
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