| Project/Area Number |
05265208
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
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Principal Investigator |
石川 冬木 東京工業大学, 生命理工学部, 助教授 (30184493)
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| Project Period (FY) |
1993
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 1993)
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| Budget Amount *help |
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 1993: ¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
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| Keywords | hnRNP / RNA結合蛋白質 / RNA結合ドメイン / cDNA |
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| Research Abstract |
本年度において、我々はhnRNP DのcDNAをクローニングし、その一次構造を決定すると共に、アミノ酸配列から予想されるhnRNP Eの一次構造と比較を行った。その結果、以下のことが明らかになった。
1.hnRNP DのcDNAは、既に肝炎ウイルスのエンハンサーに結合する蛋白質のcDNAとして報告されたものと一致する。ただし、この報告されたcDNAは、全長のうち、5'端約500塩基欠失しており、また、一塩基の配列の読み間違えのがあるために、予想されたアミノ酸配列のフレームが異なっている。
2.我々のクローニングしたhnRNP DのcDNAは約1.8kbの長さを持つ。予想されるアミノ酸配列には二つのRBDが存在する。また、アミノ端にはU1 snRNP 70kD蛋白質やtransformer蛋白質にも見られる塩基性アミノ酸の多い領域が見られた。カルボキシル端にはRGGboxが3個存在する。このように、本蛋白質は、RBDの他に、少なくとも二つのドメインを有している可能性がある。
3.hnRNP Eのアミノ酸配列は、既に報告されているtype A/B hnRNP proteinと完全に一致しているため、この二つは同じ遺伝子産物である可能性が高い。報告されているtype A/B hnRNP蛋白質ののcDNAと上記の我々のhnRNP D cDNAと比較すると、全長にわたって、50%以上のホモロジーがあり、互いによく似ている。また、type A/B cDNAから予想されるアミノ酸配列によれば、これもhnRNP Dと同じように、二つのRBDとRGG motifからなり、構成にも類似性があった。現在、この蛋白質のcDNAをクローニング中である。
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