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DNAマイクロアレイを用いたソバ由来のアレロケミカルの研究

Research Project

Project/Area Number 05F05643
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Crop science/Weed science
Research InstitutionNational Institute for Agro-Environmental Sciences

Principal Investigator

藤井 義晴  National Institute for Agro-Environmental Sciences, 生物多様性研究領域, 上席研究員

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) GOLISZ Anna. Margorzada.  独立行政法人農業環境技術研究所, 生物多様性研究領域, 外国人特別研究員
LOLISZ A.M.  独立行政法人農業環境技術研究所, 生物多様性研究領域, 外国人特別研究員
GOLISZ Anna Malgorzata  独立行政法人農業環境技術研究所, 生物環境安全部, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2005 – 2007
Project Status Completed (Fiscal Year 2007)
Budget Amount *help
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥200,000 (Direct Cost: ¥200,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsアレロパシー / DNAマイクロアレイ / ルチン / シロイヌナズナ / ストレス耐性遺伝子 / カテコール化合物 / 細胞間情報伝達機構 / アレロカミカル / ソバ / 遺伝子 / 生物検定
Research Abstract

これまでの研究の結果、ソバのアレロケミカルとして6種の成分を分離したが、今回、全活性法でもっとも寄与率の高い成分を調べた結果、ルチンが最も寄与が高く、没食子酸がこれに次いで重要であることが判明した。ルチンは最も強い全活性を、没食子酸は最も強い比活性を示す化合物である。そこで、この2種のソバ由来のアレロパシー物質の影響をマイクロアレイで分析した。
シロイヌナズナを用いて、DNAマイクロアレイを行い、ソバのアレロケミカルが遺伝子発現に及ぼす影響を調べた。シロイヌナズナをアグリポットあるいは3段重ねプラントボックスを用いて開花期まで栽培し、ソバのアレロケミカルを投与した後、mRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ法によって、影響を受ける遺伝子の解析を行った。マイクロアレイは、Affymetrix GeneChips Arabidopsis ATH1 Genome Arrayを用い、24,000の遺伝子を対象に検索した。カテコール化合物の比較として、L-ドーパとその関連化合物を投与し比較検定した。上記の化合物に暴露時間を変化させて変動する遺伝子を調べた結果、6時間の暴露で、没食子酸では168の遺伝子が、ルチンでは55の遺伝子が、それぞれ高発現したことがわかった。しかし、両者に共通して高発現となったのは、14遺伝子のみであった。
本研究により、ソバに含まれるアレロケミカルによるストレスに反応して誘導される重要な遺伝子のいくつかが明らかになった。誘導された遺伝子の中で代表的なものは、「代謝」、「細胞レスキュー・細胞防御および毒性」、「細胞間情報伝達機構」および「転写」などであった。

Report

(3 results)
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2008 2007 2006 2005

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Microarray expression profiling of Arabidopsis thaliana L. in response to allelochemicals identified in buckwheat2008

    • Author(s)
      Anna Golisz
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany (掲載確定)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific and total activities of the allelochemicals identified in buckwheat.2007

    • Author(s)
      Anna Golisz
    • Journal Title

      Weed biology and Management 7

      Pages: 164-171

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Screening of allelopathy by bioassay and evaluation of allelochemicals in the field using the concept of total activity.2007

    • Author(s)
      Yoshihru Fujii
    • Journal Title

      Proceedings of the 21st Asian Pacific Weed Science Society Conference 21

      Pages: 680-694

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of allelochemicals from buckwheat of selected allelochemicals identified in buckwheat2007

    • Author(s)
      Anna Golisz, Syuntaro Hiradate, Mami Sugano, Yoshiharu Fujii
    • Journal Title

      2007年度日本植物生理学会年会要旨集 48

      Pages: 333-333

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] total activity of selected allelochemicals identified in buckwheat2007

    • Author(s)
      Anna Golisz, Gawronski S W, Syuntaro Hiradate, Yoshiharu Fujii
    • Journal Title

      雑草研究 50

      Pages: 188-189

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Microarray. analysis of Arabidopsis plants in response to an allelochemical L-DOPA2006

    • Author(s)
      Anna Golisz, Mami Sugano, Akihiro Furubayasi, Syutaro Hiradate, Yoshiharu Fujii
    • Journal Title

      Proc. XV FESB Congress Federation of European Societies of Plant Biology 15

      Pages: 169-169

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Total activity of selected allelochemicals identified in buckwheat2006

    • Author(s)
      Anna Golisz, Stanislaw W.Gawronski, Syuantaro Hiradate, Yoshiharu Fujii
    • Journal Title

      雑草研究 51

      Pages: 188-189

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] Allelopathic potential of polish cultivars of buckwheat2005

    • Author(s)
      Anna Golisz, Yoshiharu Fujii, Helena Gawronska, Stanislaw W.Gawronski
    • Journal Title

      Proc.The 20^<th> Asian-Pacific Weed Science Society Conference 20

      Pages: 43-43

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物の全生涯に影響をおよぼすアレロパシー活性を検定するライフサイクルアセスメント法の開発2007

    • Author(s)
      藤井義晴
    • Organizer
      日本雑草学会第46回講演会
    • Place of Presentation
      沖縄県男女共同参画センター・てぃるる
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2005-04-01   Modified: 2024-03-26  

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