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タンパク質修飾酵素PAD4の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 05J03483
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionKyoto University (2006)
Yokohama City University (2005)

Principal Investigator

有田 恭平  京都大学, 工学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2005 – 2006
Project Status Completed (Fiscal Year 2006)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2006: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2005: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords構造生物学 / シトルリン / 脱イミノ化 / カルシウムイオン / 慢性関節リウマチ / ヒストン修飾 / PAD4 / シトルリン化
Research Abstract

タンパク質の翻訳後修飾は細胞内の様々な機能の制御を行っている重要な生体内現象である。その中でも近年、Peptidylarginine deiminase 4 (PAD4)によるタンパク質のシトルリン化に注目が集まっている。PAD4はCa^<2+>依存的にタンパク質中のアルギニン残基を脱イミノ化して、シトルリン残基を産出する反応を触媒するタンパク質修飾酵素である。PAD4はヒストン修飾による遺伝子発現の制御、および慢性関節リウマチの発症との関連が示唆されており、近年その生理機能に注目が集まっている。これまでに、Ca^<2+>によるPAD4の新規の活性制御機構を明らかにし、さらにヒストンN末端の領域のペプチドとの複合体結晶構造解析から詳細な基質認識機構の解明をおこなった。
本年度は、RAの新規薬剤設計における構造学的基盤を構築するために、PAD4とその活性阻害剤であるN-α-benzoyl-N5-(2-fluoro-1-iminoethyl)-L-ornithine amide (F3-amidine)との複合体結晶構造解析を行った。PAD4はRAの原因遺伝子であり、その活性阻害剤がRAの根本的な治療薬になると考えられている。共同研究者であるUniversity of South CarolinaのPaul Thompson氏から供与されたF3-amidineを用いてPAD4との複合体構造解析に成功し、F3-amidineが不可逆的にPAD4の活性残基であるCys645に結合し求核攻撃を阻害するという、PAD4の活性阻害機構を明らかにした。その成果は『Biochemistry』誌に掲載された。本研究により、今後この阻害剤をプローブとしたPAD4の細胞生物学的な研究の発展、およびより高選択、高活性なRAの新規薬剤開発の発展が見込まれる。

Report

(2 results)
  • 2006 Annual Research Report
  • 2005 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2007 2006 2005

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] Structural and Biochemical Characterization of a Cyanobacterium Circadian Clock-modifier Protein2007

    • Author(s)
      Arita K., Hashimoto H., Igari K., Akaboshi M., Kutsuna S., Sato M., Shimizu T.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 282

      Pages: 1128-1135

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Inhibitors and inactivators of protein arginine deiminase 4 : functional and structural characterization.2006

    • Author(s)
      Luo Y., Arita K., Bhatia M., Knuckley B., Lee Y.H., Stallcup M.R., Sato M., Thompson
    • Journal Title

      Biochemistry 45

      Pages: 11727-11736

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] ヒストン修飾酵素Peptidylarginine deiminase 4 (PAD4)の活性化とヒストン認識2006

    • Author(s)
      有田恭平, 清水敏之, 橋本博, 佐藤衛
    • Journal Title

      Photon Factory News 24

      Pages: 16-22

    • Related Report
      2006 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural basis for histone N-terminal recognition by human peptidylarginine deiminase 42006

    • Author(s)
      Arita, _K., Shimizu, T., Hashimoto, H., Hidaka, Y., Yamada.M., Sato, M
    • Journal Title

      Proceeding of the National Academy of Sciences of the USA, 103

      Pages: 5291-5291

    • Related Report
      2005 Annual Research Report
  • [Journal Article] カルシウム結合によって活性されるヒストン修飾酵素PAD4の構造科学的基盤2005

    • Author(s)
      有田 恭平, 佐藤 衛
    • Journal Title

      日本結晶学会誌 47

      Pages: 268-268

    • Related Report
      2005 Annual Research Report

URL: 

Published: 2005-04-01   Modified: 2024-03-26  

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