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高効率な"ON-OFF"応答性電気化学的SNPs検出法の開発

Research Project

Project/Area Number 06J01817
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

池田 怜男奈  University of Toyama, 大学院・薬学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2006 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2006: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
KeywordsSNP検出 / 一塩基多型 / DNA / 電気化学 / 有機化学 / フェロセン / SNPタイピング
Research Abstract

テーラーメード医療の実現に同けて、迅速、正確かつ安価な一塩基多型(SNPs)の検出法が望まれている。そこで、検出装置が安価かつチップ化・アレイ化の容易な電気化学的手法によるSNPs検出法の開発を行った。
これまでに、電気化学活性なフェロセンをπ-共役系を介して、DNAに連結した電気化学活性DNAプローブを用いたSNPs検出法め開発に成功した。さらに、研究初期に開発した電気化学DNAプローブ改良し、より合成の容易な新規電気化学活性DNAプローブの開発に成功した。
次に、開発したSNP検出法を用いSNPタイピングを行う手法の構築を目指した。SNPタイピングとはゲノムDNAの遺伝子型を判別すること指す。テーラーメード医療を実現するには、SNPタイピングを行える事が重要案件となる。そこで、従来開発した電気化学活性DNAプローブとは応答電位の異なる新規DNAプローブの開発に着手した。応答電位の異なるDNAプローブと従来型のDNAプローブとを組み合わせることで、精度良くSNPタイピングを行えると見込めるためである。
そこで、従来型DNAプローブのフェロセン部位をペンタメチルフェロセンに置換した新規DNAプローブの開発を行った。さらに、合成した新規DNAプローブのSNP検出能を評価した。結果、新規DNAプローブにおいても、従来型と同様のSNP検出能力を有することがわかった。さらに従来型と新規DNAプローブを双方用いることで容易にSNPタイピングできることが分かった。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • 2006 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] In Situ,Digital-Like,and Reagentless Discrimination of Label-Free SNPs of 90-mer Length with Easily Synthesized Electrochemical DNA Probes2007

    • Author(s)
      Ikeda, R.;Akaishi, A.;Chiba, J.;Inouye, M.
    • Journal Title

      Chem Bio Chem 8

      Pages: 2219-2222

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of Mismatched Duplexes by Synchronizing Pulse Potential Frequency with Dynamics of Ferrocene/Isoquinoline Conjugate-Connected DNA Probes Immobilized onto Electrodes

    • Author(s)
      Ikeda, R. ; Kobayashi, S. ; Chiba, J. ; Inouye, M.
    • Journal Title

      Chem. -Eur. J., (in press)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electrochemical Genotyping Using Two Ferrocene/Isoquinoline-Connected DNA Probes with Different Redox Potentials on a Single Electrode

    • Author(s)
      Ikeda, R. ; Kitagawa, S. ; Chiba, J. ; Inouye, M.
    • Journal Title

      Chem. -Eur. J. (submitted)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 異なる応答電位を持つDNAプローブのパルス電位周波数の同調に基づくSNPタイピング法2009

    • Author(s)
      池田怜男奈, 千葉順哉, 井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      千葉
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 電極固定DNAプローブ分子のダイナミクスとパルス電位周波数の同調に基づくSNPs検出2009

    • Author(s)
      小林沙希絵, 池田怜男奈, 千葉順哉, 井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      千葉
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 一本鎖で金電極に固定した電気化学活性DNAにおける電荷移動機構2008

    • Author(s)
      池田怜男奈, 千葉順哉, 井上将彦
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 電気化学活性フェロセン修飾DNAにおける電荷移動機構2008

    • Author(s)
      小林沙希絵, 池田怜男奈, 千葉順哉, 井上将彦
    • Organizer
      平成20年度有機合成化学北陸セミナー
    • Place of Presentation
      福井
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 金電極上に固定したフェロセン修飾オリゴヌクレオチドにおける電荷移動機構の検証2008

    • Author(s)
      池田 怜男奈・千葉 順哉・井上 将彦
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 異なる応答電位を有する2種の電気化学プローブを用いるバイアレル性SNPs遺伝子型判定法の開発2008

    • Author(s)
      北川 哲・池田 怜男奈・千葉 順哉・井上 将彦
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Electrochemical Detection of Single-Base Mismatches in DNA with Ferrocene-π-Conlugated DNA Probes2007

    • Author(s)
      池田 怜男奈・千葉 順哉・北川 哲・赤石 あゆみ・井上 将彦
    • Organizer
      International Conference on Molecular Machines and Sensors
    • Place of Presentation
      上海
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Mismatch Detection Based on Hole Transport with Easily Available,Ferrocene-π-Coniuaated DNA Probes2007

    • Author(s)
      千葉 順哉・池田 怜男奈・上野 浅香・渡辺 博・井上 将彦
    • Organizer
      International Conference on Molecular Machines and Sensors
    • Place of Presentation
      上海
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] イソキノリンを導入したフェロセン修飾DNAプローブによる電気化学的SNPs検出および遺伝子型判定2007

    • Author(s)
      赤石 あゆみ・池田 怜男奈・千葉 順哉・井上 将彦
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] デジタル的な2電位応答を利用したSNPsタイピング法の開発2007

    • Author(s)
      北川 哲・池田 怜男奈・千葉 順哉・井上 将彦
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2006-04-01   Modified: 2024-03-26  

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