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イネ亜種間交雑における生殖的隔離障壁因子の単離及び機能解析

Research Project

Project/Area Number 07J06821
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Breeding science
Research InstitutionThe Graduate University for Advanced Studies

Principal Investigator

水多 陽子  The Graduate University for Advanced Studies, 生命科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2007 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2009: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords生殖的隔離 / 雑種不稔 / 花粉 / ゲノム障壁 / 重複遺伝子 / 種分化 / 雑種 / 分離歪み
Research Abstract

両候補遺伝子の相補性検定が終了し、日本晴とカサラス間で雑種花粉の不発芽を引き起こしている遺伝子は第1染色体上のDOPPELGANGER(DPL)1,第6染色体上のDPL2と名付けた機能未知の新規遺伝子であることが証明された。DPL1とDPL2は被子植物で高度に保存された重複遺伝子であり、遺伝子構造とRNA・タンパク質の発現解析からはカサラスアリルのDPL1遺伝子と日本晴アリルのDPL2遺伝子は機能欠損型であることが分かった。また、相補性検定の結果からはカサラスアリルのDPL2遺伝子と日本晴アリルのDPL1遺伝子は機能型であることが明らかとなった。リアルタイムRT-PCRとin situ hybridizationの結果から、機能的なDPLのmRNAは二核期の花粉内に蓄積されており、花粉発芽に対し何らかの重要な役割を持っていることを示唆している。また、ゲノム解析が終了した四種の被子植物(ヤマカモジグサ、ソルガム、トウモロコシ)とのシンテニーを元にDPLと名付けた原因遺伝子周辺のゲノム配列を比較することで、DPL遺伝子の重複はイネとヤマカモジグサが分岐した後に起きたことが分かった。
本研究は種分化を隔離遺伝子の進化と隔離機構の成立という観点から種や属を超えて検証できた数少ない例である。発現解析からもこの遺伝子は花粉伝達に重要な新規遺伝子であることが示されており、今後DPLの機能を解明することはイネだけでなく、被子植物の生殖過程について有用な知見をもたらすことが予想される。現在、これまでの結果をまとめ、論文を投稿中である。

Report

(3 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2010 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (20 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Various spatiotemporal expression profiles of anther-expressed genes in rice2008

    • Author(s)
      Hobo, T.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 49

      Pages: 1417-1428

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] Separated transcriptomes of male gametophyte and tapetum in rice : validity of a laser microdissection (LM) microarray2008

    • Author(s)
      Suwabe, K.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 49

      Pages: 1407-1416

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping of a pair of reproductive barrier loci observed in a cross between Nipponbare and Kasalath2007

    • Author(s)
      Y. Mizuta
    • Journal Title

      Rice Genetics Newsletter 23

      Pages: 33-35

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER(DPL)1とDPL2の解析2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2010-03-27
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER(DPL)1およびDPL2遺伝子の解析2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学
    • Year and Date
      2010-03-20
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of a pair of genes, DOPPELGANGER(DPL)1 and DPL2 responsible for reproductive isolation between two rice subspecies2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction : from pollination to fertilization
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂
    • Year and Date
      2010-03-11
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER1(DPL1)とDPL2の単離・解析2009

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-12-12
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ全生殖過程における遺伝子発現解析を用いた多様な因子の補足2009

    • Author(s)
      藤田雅丈
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-12-12
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Genetic and genomic analysis of factors consisting of reproductive barriers in rice2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-12-12
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Genome evolution and reproductive in rice2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      6th International Rice Genetics symposium
    • Place of Presentation
      Manila, Philippine
    • Year and Date
      2009-11-17
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] F_2集団を使った配偶体または接合体内の2遺伝子座間の相互作用による生殖的隔離の検出2009

    • Author(s)
      春島嘉章
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2009-09-26
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ亜種間交雑において生殖的隔離を引き起こす相互作用遺伝子座DOPPELGANGER1と2の単離・解析2009

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学
    • Year and Date
      2009-09-17
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  • [Presentation] 野生イネ種間、種内変異とゲノム機能分化2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学
    • Year and Date
      2009-09-17
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で分離の歪みを示すゲノム領域の検出2009

    • Author(s)
      久保貴彦
    • Organizer
      日本育種学会115回講演会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場, 筑波
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ生殖隔離機構の解析から見えてくるもの2008

    • Author(s)
      久保貴彦
    • Organizer
      国立遺伝学研究所研究会「高等植物の生殖過程を制御する因子の多様性と生殖隔離」
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所, 三島
    • Year and Date
      2008-11-05
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離障壁となる重複遺伝子の解析2008

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本育種学会114回講演会
    • Place of Presentation
      滋賀県立大学, 彦根
    • Year and Date
      2008-10-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Affymetrixマイクロアレイプローブ再定義とイネ生殖過程の遺伝子発現解析2008

    • Author(s)
      藤田 雅丈
    • Organizer
      日本育種学会第113回講演会
    • Place of Presentation
      明治大学
    • Year and Date
      2008-03-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Positional Cloning of a Pair of Interactive Genes Causing Reproductive Barrier in the Hybrid Pollen of Rice2008

    • Author(s)
      Mizuta, Y.
    • Organizer
      XX International congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Detection of pairs of interactive reproductive barriers in rice2008

    • Author(s)
      Harushima, Y.
    • Organizer
      XX International congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ雑種花粉で作用する生殖的隔離障壁遺伝子のポジショナルクローニング2007

    • Author(s)
      水多 陽子
    • Organizer
      第112回育種学会
    • Place of Presentation
      山形大学
    • Year and Date
      2007-09-23
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  • [Presentation] イネF2集団における生殖的隔離障壁の相互作用の検出2007

    • Author(s)
      春島 嘉章
    • Organizer
      日本遺伝学会第79回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2007-09-21
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ雑種花粉で相互作用する2遺伝子座に起因する生殖的隔離2007

    • Author(s)
      水多 陽子
    • Organizer
      日本遺伝学会第79回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2007-09-20
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] イネの生殖過程を通じた遺伝子発現プロファイリング2007

    • Author(s)
      藤田 雅丈
    • Organizer
      日本遺伝子学会第79回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2007-09-20
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/PlantGen/japanese/research/index.html

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      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://achieve.nig.ac.jp/index.jsp

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/PlantGen/japanese/research/index.html

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2024-03-26  

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