Rab GTPase Sec4pと、そのエフェクターによる開口放出制御の構造基盤
Project/Area Number |
07J09655
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Structural biochemistry
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Research Institution | The University of Tokyo (2009) Tokyo Institute of Technology (2007-2008) |
Principal Investigator |
佐藤 裕介 The University of Tokyo, 放射光連携研究機構, 助教
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Project Period (FY) |
2007 – 2009
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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Budget Amount *help |
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2009: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
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Keywords | X線結晶構造解析 / ユビキチン / 小胞輸送 / 低分子量GTPase / シグナル伝達 / グアニンヌクレオチド交換因子 |
Research Abstract |
Sec4pとそのエフェクターに関する研究については複合体の結晶を得ることができず進捗がなかった。一方、平行して昨年度実施したRAP80及びTAB2・TAB3によるK63結合型ポリUb鎖特異的認識機構についての研究は、結晶構造からそのメカニズムを明らかとし成果は学術誌に掲載された。 ユビキチン(Ub)は76残基からなるタンパク質で、標的タンパク質のリジン残基とイソペプチド結合を介して結合することでタンパク質の機能を制御する。また、結合したUbのリジン残基にさらにUbが付加して形成されるポリUb鎖によって標的タンパク質の機能を制御することも多く、この場合どのリジン残基を用いてポリUb鎖を形成するかでその役割は異なってくる。細胞内で最も多く存在しているのはK48結合型のポリUb鎖でプロテアソームによる分解シグナルとして働く。一方、K63結合型ポリUb鎖はプロテアソーム系ではなく、タンパク質合成、受容体の分解、DNAの修復、免疫や炎症に関わる細胞内シグナル伝達といった様々な生命現象に関与する。例えば、K63結合型ポリUb鎖はDNA二重鎖切断が生じた部位に形成され修復シグナルとして働き、RAP80はK63結合型ポリUb鎖を認識し、様々な修復酵素をDNA損傷部位へと集める働きを持つ。また、TNFαなどのサイトカインの刺激によりK63結合型ポリUb鎖が形成され、TAB2・TAB3がK63結合型ポリUb鎖を特異的に認識することで最終的にNF-κBシグナルが活性化される。我々はRAP80及びTAB2・TAB3のK63結合型Ub二量体の複合体の結晶構造をそれぞれ決定し、Lys63結合型ポリUb鎖の特異的認識メカニズムを明らかにした。この成果はどちらも「The EMBO Journal」に掲載された。
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Report
(3 results)
Research Products
(24 results)
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[Journal Article]2010
Author(s)
深井周也、佐藤裕介
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Journal Title
日本結晶学会誌、Vol.52(日本結晶学会)
Pages: 20-24
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[Journal Article]2009
Author(s)
佐藤裕介、深井周也
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Journal Title
生体の科学、第60巻、第6号(医学書院)
Pages: 593-598
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[Journal Article]2009
Author(s)
深井周也, 佐藤裕介, 吉川梓
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Journal Title
実験医学, vol. 27No. 3(羊土社)
Pages: 411-414
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[Presentation] AMSHファミリーによるK63結合型ポリユビキチン鎖特異的な切断活性の構造的基盤2008
Author(s)
佐藤裕介, 吉川梓, 山形敦史, 三村久敏, 山下雅美, 大方香代子, 濡木理, 岩井和弘, 駒田雅之, 深井周也
Organizer
第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会, 合同大会
Place of Presentation
神戸ポートアイランド
Year and Date
2008-12-12
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