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中国雲南イネ品種が有する穂ばらみ期耐冷性の解析~強度耐冷性遺伝子の単離~

Research Project

Project/Area Number 07J11012
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Breeding science
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

汐海 沙知子  Tohoku University, 大学院・農学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2007 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2009: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsイネ / 低温ストレス / QTL解析
Research Abstract

中国雲南地方の在来品種である「麗江新団黒谷」は、「コシヒカリ」や「ひとめぼれ」などの日本の強度耐冷性品種を上回る極強の耐冷性を有することが知られている(。申請者らはこれまでに「麗江新団黒谷」と「ひとめぼれ」の交配後代系統を用いてQTL解析を行ってきており、2年間の反復をとった耐冷性検定の結果から第3染色体長腕に「麗江新団黒谷」型の対立遺伝子の作用による耐冷性QTLを確認した。さらに染色体部分置換系統を作成し、候補領域内で組換えが生じている系統10系統を選抜して、2008年度および2009年度の2年間の反復をとった耐冷性検定の結果から候補領域を約1.2Mbの領域に絞り込んだ。この領域について「麗江新団黒谷」の塩基配列を決定して「日本晴」と比較したところ、ミスセシス変異を起こすSNPが6遺伝子に生じていた。これらのSNPについて、dot-blot-SNPマーカー化し、「麗江新団黒谷」と「ひとめぼれ」の遺伝子型を調べてところ、「ひとめぼれ」は全て「日本晴」型であった。また、推定遺伝子領域の上流5kb以内にSNPが存在る遺伝子について、「ひとめぼれ」及び準同質遺伝子系統の穂ばらみ期穎花からRNAを抽出して発現解析を行ったところ、両者で発現量に大きな差が見られるのはなかった。本研究では、「麗江新団黒谷」に由来する強度耐冷性の候補遺伝子を6遺伝子に絞り込むことができた。今後これらについて相補性試験等を進めることで、耐冷性遺伝子を単離できる可能性が高い。また、研究の過程で作成した準同質遺伝子系統は、実際に「ひとめぼれ」に比べて耐冷性程度が向上していることを確認しており、耐冷性育種にも貢献できると期待される。

Report

(3 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2010 2009 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Improvement of the dot-blot-SNP technique for efficient and cost-effective genotyping.2010

    • Author(s)
      Shiokai S, et al.
    • Journal Title

      Molecular Breeding 25

      Pages: 179-185

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Leaf-punch method to prepare a large number of PCR templates from plants for SNP analysis2009

    • Author(s)
      Shiokai S, et al.
    • Journal Title

      Molecular Breeding 23

      Pages: 329-336

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a simple genotyping method for a great number of rice plants.2007

    • Author(s)
      Shiokai S, et. al.
    • Journal Title

      The 2nd International Conference on Rice for the Future Proceedings

      Pages: 300-302

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 穂ばらみ期低温ストレス耐性に関するQTL解析と候補領域の絞り込み2010

    • Author(s)
      汐海沙知子, ら
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] イネ核型雄性不稔突然変異の原因遺伝子の推定.2009

    • Author(s)
      汐海沙知子, ら
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of quantitative trait loci for low temperature tolerance at booting stage in rice and narrowing the candidate genomic region.2009

    • Author(s)
      Shiokai S, et al.
    • Organizer
      9^<th> International plant molecular biology
    • Place of Presentation
      St.Louis, Missouri, USA
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 効率的・低コスト遺伝子型判定のための dot-blot-SNP法の改良2009

    • Author(s)
      汐海沙知子, ら
    • Organizer
      日本育種学会第115回講演会
    • Place of Presentation
      茨城県つくば市
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Fine mapping of the mutated gene of a genic-male-sterile mutant in rice2008

    • Author(s)
      Shiokai S, et al.
    • Organizer
      FAO/IAEA International Symposium on Induced Mutations in Plants
    • Place of Presentation
      Vienna, Austria
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 大量サンプルのSNP分析のためのPCRテンプレートの簡易調整法2008

    • Author(s)
      汐海沙知子, ら
    • Organizer
      日本育種学会第114回講演会
    • Place of Presentation
      滋賀県彦根市
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Dot-blot-SNP法の低コスト化と日本型水稲品種判別用SNPマーカーの作出.2007

    • Author(s)
      汐海 沙知子, ら
    • Organizer
      日本育種学会第112回講演会
    • Place of Presentation
      山形県鶴岡市
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of a simple genotyping method for a great number of rice plants.2007

    • Author(s)
      Shiokai S, et. al.
    • Organizer
      The 2nd International Conference on Rice for the Future
    • Place of Presentation
      Bangkok
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2024-03-26  

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