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AAAスーパーファミリータンパク質によるタンパク質リモデリングの分子機構の解明

Research Project

Project/Area Number 08J01771
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied biochemistry
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

杉本 真也  Kumamoto University, 発生医学研究所, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2008 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Fiscal Year 2009: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2008: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
KeywordsAAAスーパーファミリータンパク質 / 細胞骨格タンパク質 / 重合・脱重合 / タンパク質分解 / 分子シャペロン / 高速原子間力顕微鏡 / アミロイド様タンパク質 / プロテオーム解析 / AAAタンパク質 / 高速AFM / ATP / 脱凝集 / 脱会合 / 細胞分裂
Research Abstract

1.AAA^+シャペロンClpXによる細菌の細胞骨格タンパク質FtsZの動態制御
GTP依存的に重合したFtsZの構造および動態を高速AFMで観察したところ、直線状の線維や湾曲した線維、およびそれらが重なりあった太い線維が多数観察された。さらに直線状の線維が時間とともに湾曲し、分断・再結合を繰り返す様子を秒単位の時間分解能で直接可視化できた。次にClpXがFtsZのポリマー形成に与える影響を調べたところ、ClpXはATP非依存的にFtsZの重合を阻害し、ClpXのN末端ドメインがFtsZの認識に重要であることが分かった。一方、ClpXPがFtsZを分解する活性は極めて低いことから、分解の促進ではなく重合の阻害によりFtsZの動態を制御していることが示された。さらに、FtsZポリマーの脱重合をClpXが促進することや、ClpXを過剰発現させた大腸菌ではZリングの形成が異常になることなども明らかにした。
2.細菌のアミロイド様タンパク質の発見とAAAスーパーファミリータンパク質による品質管理
大腸菌をモデルとし、可溶性タンパク質の中からアミロイド様凝集体を形成するタンパク質および条件を探索した。その結果、ADPの添加により線維状凝集体を形成するタンパク質が存在することを発見した。高感度質量分析機器を用いたプロテオーム解析の結果、polynucleotide nucleotidyltransferase(PNPase)がADP依存的に線維状凝集体を形成することを明らかにした。また、各種変異体PNPaseタンパク質を用いた解析の結果、ADPの結合ではなくADPを加水分解してpoly(A)を合成するPNPaseの活性が、アミロイド様凝集体の形成に重要であることを見出した。さらに、細胞内においてPNPaseがAAA型プロテアーゼにより分解される可能性を示唆する結果を得た。

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] AAA^+ chaperone C1pX regulates dynamics of prokaryotic cytoskeletal protein FtsZ2010

    • Author(s)
      Shinya Sugimoto
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 285

      Pages: 6648-6657

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of Escherichia coli dnaK-deletion mutant infected by lambdaDE3 for overexpression and purification of recombinant GrpE proteins2008

    • Author(s)
      Shinya Suginmoto
    • Journal Title

      Protein Expression and Purification 60

      Pages: 31-36

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The proper ratio of GrpE to DnaK is important for protein-quality control by DnaK-DnaJ-GrpE chaperone system and for cell division2008

    • Author(s)
      Shinya Sugimoto
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1876-1885

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular chaperones in lactic acid bacteria : Physiological consequences and biochemical properties2008

    • Author(s)
      Shinya Sugimoto
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 106

      Pages: 324-336

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌AAA^+シャペロンC1pXによる細胞分裂関連タンパク質FtsZのリモデリング2009

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学年会
    • Place of Presentation
      ホテルニュースカイ・熊本
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Remodeling of cell division protein FtsZ by AAA^+ chaperone C1pX from E.coli2009

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      8^<th> International Conference on AAA Proteins
    • Place of Presentation
      トロント・カナダ
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule analysis of dynamics of bacterial cytoskeletal protein FtsZ by high-speed AFM2009

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      JST/CREST International Symposium Watching Biomolecules in Action ; Single Molecule Biology Symposium 2^<nd> Kanazawa Bio-AFM Workshop
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター・大阪
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌の分子シャペロン GrpE の過剰発現は DnaK シャペロンシステムの機能を阻害し、異常な細胞分裂を引き起こす2008

    • Author(s)
      杉本真也
    • Organizer
      特定領域研究「タンパク質社会」若手ワークショップ
    • Place of Presentation
      東京大学・検見川セミナーハウス
    • Year and Date
      2008-10-25
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp/newpress/np39.html

    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2024-03-26  

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