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生体分子系の光化学反応の電子的メカニズム解明のための大規模電子状態計算法の開発

Research Project

Project/Area Number 08J05589
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Physical chemistry
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

赤間 知子  Waseda University, 理工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2008 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2008: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Keywords光化学反応 / 大規模電子状態ダイナミクス / 実時間発展(RT)TDHF / TDDFT / 電子ダイナミクス / 短時間フーリエ変換 / 内殻励起 / ガウス型基底 / Divide-and-conquer(DC)法 / 大規模電子状態計算法 / 自己無撞着場(SCF)収束性 / 電子温度 / 励起状態計算
Research Abstract

生体分子において重要な光化学反応の電子的メカニズム解明のためには、大規模系の電子状態ダイナミクスを記述できる理論的手法の開発が必要である。報告者はこれまで、分割統治法を用いた大規模系のための高速化法の開発と、実時間発展形式の時間依存Hartree-Fockおよび時間依存密度汎関数理論(RT-TDHF/TDDFT)による電子ダイナミクスの記述に関する研究を行ってきた。今年度は、大規模電子状態ダイナミクスシミュレーションの実現に向けて、電子ダイナミクスに関する下記のような研究を行った。
以前の報告者の研究において、ホルムアルデヒド二量体のRT-TDHF/TDDFT計算に対して短時間フーリエ変換解析を適用することにより、光誘起された分極が分子間で伝播する様子を追跡できることがわかっている。今年度はさらに研究を進め、分子間で起こる伝播の周期は分子間相互作用により生じた2つの擬縮退励起状態のエネルギー差に対応しており、励起状態と関連付けた電子ダイナミクスの解析が可能であることを明らかにした。さらに、伝播周期の距離依存性を検証することにより、分子間相互作用の主要な成分を解析した。(J.Chem.Phys.132,054104)
また、これまでのRT-TDHF/TDDFT計算では主に数値グリッド基底や平面波基底が用いられており、取り扱われるエネルギー領域は価電子励起のみに限られていた。報告者は、ガウス型基底を用いたRT-TDHF/TDDFT計算のフーリエ変換解析によって、価電子励起だけでなく内殻励起に対しても周波数領域のTDHF/TDDFTの結果を再現できることを確認した。(J.Chem.Phys.132,054104)さらに、周波数領域のTDDFTで価電子励起・内殻励起ともに高精度に記述するために開発されたCV-B3LYP汎関数をRT-TDDFT計算に適用し、RT-TDDFT計算においても内殻励起を高精度に記述することに成功した(Chem.Lett.39,407)

Report

(2 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Short-time Fourier transform analysis of real-time time-dependent Hartree-Fock and time-dependent density functional theory calculations with Gaussian basis functions2010

    • Author(s)
      T.Akama, H.Nakai
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics 132

      Pages: 0541041-11

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Application of Real-Time Time-Dependent Density Functional Theory with the CV-B3LYP Functional to Core Excitations2010

    • Author(s)
      T.Akama, Y.Imamura, H.Nakai
    • Journal Title

      Chemistry Letters 39

      Pages: 407-409

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electronic Temperature in Divide-and-Conquer Electronic Structure Calculation Revisited : Assessment and Improvement of Self-Consistent Field Convergence2009

    • Author(s)
      T.Akama, M.Kobayashi, H.Nakai
    • Journal Title

      International Journal of Quantum Chemistry 109

      Pages: 2706-2713

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Implementation of Divide-and-Conquer (DC) Electronic Structure Code to GAMESS Program Package2009

    • Author(s)
      M. Kobayashi, T. Akama, H. Nakai
    • Journal Title

      The Journal of Computer Chemistry, Japan 8

      Pages: 1-12

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Linear Scaling Techniques Based on Divide-and-Conquer Method2008

    • Author(s)
      H. Nakai, T. Akama, M. Kobayashi
    • Journal Title

      Bulletin of the Society for Discrete Variational Xα 21

      Pages: 47-57

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Core Excitations by Real-time Propagation Time-dependent Density Functional Theory2010

    • Author(s)
      Y.Imamura, T.Akama, H.Nakai
    • Organizer
      International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2010-01-07
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Real-time Propagation Time-dependent Density Functional Theory on Core Excitations2009

    • Author(s)
      Y.Imamura, T.Akama, H.Nakai
    • Organizer
      The 4th Asian Pacific Conference on Theoretical & Computational Chemistry(APCTCC-4)
    • Place of Presentation
      Port Dickson, Malaysia
    • Year and Date
      2009-12-21
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Gauss型基底関数を用いた実時間発展TDHF/TDDFT計算2009

    • Author(s)
      赤間知子、平塚暁裕、中井浩巳
    • Organizer
      第12回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-05-29
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 分割統治(DC)電子状態計算法のGAMESSへの実装と応用(吉田賞(論文賞)受賞講演)2009

    • Author(s)
      小林正人、赤間知子、中井浩巳
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2009春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2009-05-22
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 電子の振動伝播の実時間発展TDHF/TDDFTによる追跡2009

    • Author(s)
      赤間知子, 中井浩巳
    • Organizer
      スーパーコンピューターワークショップ2009
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2009-01-19
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 大規模系を取り扱う分割統治電子状態計算法の開発と応用2008

    • Author(s)
      藤井厚彦, 小林正人, 赤間知子, 中井浩巳
    • Organizer
      第7回早慶ワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-20
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 実時間追跡によるTDHF/TDDFT計算2008

    • Author(s)
      赤間知子, 中井浩巳
    • Organizer
      第14回理論化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      沼津
    • Year and Date
      2008-07-29
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 分割統治(DC)電子状態計算プログラムのGAMESSへの実装2008

    • Author(s)
      赤間知子, 小林正人, 佐倉大輔, 藤井厚彦, 中井浩巳
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会2008春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-05-23
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2024-03-26  

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