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細胞内構造の分子形態学的解析から探る非光合成原生生物における植物型遺伝子の起源

Research Project

Project/Area Number 08J09894
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Morphology/Structure
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

丸山 真一朗  東京大学, 大学院・理学系研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2008 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2010: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2009: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2008: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords植物 / 葉緑体 / 原生生物 / 分子系統解析 / ゲノム / 細胞内共生 / スーパーコンピューター / シアノバクテリア / スーパーコンピュータ
Research Abstract

本研究では、植物の誕生、即ちシアノバクテリア様生物の細胞内共生によって葉緑体(色素体)が獲得されて以来、共生体から宿主の真核生物のゲノム中へと移行してきた「植物型遺伝子」というものに注目し、藻類・非光合成原生生物においてそれらの遺伝子の進化的・機能的保存性を解明することを目的に解析を進めた。
昨年度の成果を基にして解析対象と規模を拡充させると共に、光合成を行う藻類にも解析の重点を移し、「光合成をする/しない」、「葉緑体を持つ/持たない」の境界にあるような真核生物群を対象としてゲノム規模での進化生物学的解析を行った。その結果、現在葉緑体を持つ生物でも太古の地球では別の系統の藻類と遺伝子の伝達交換をしていた可能性が示唆され、地球環境において最も重要な生物的エネルギー転換である光合成の進化という点でも、ゲノムのモザイク的な進化が大きな役割を果たしていることが示された(Yang et al. submitted、 Maruyama et al. editorially accepted)。また、二次共生による色素体の獲得過程において痕跡化した、ヌクレオモルフという共生体核において、これまで核ゲノム中には存在しないと考えられていた、遺伝子が、遺伝子構造の前半と後半が逆順にコードされた「逆順tRNA遺伝子」としてゲノム中に存在し、実際に転写され、タンパク質翻訳に寄与していることを示唆した(Maruyama et al. 2010 Mol Biol Evol)。さらに、共生体と宿主という枠を超え、寄生植物(ストライガ)と宿主植物という共生関係にある真核生物間においても、進化的時間軸で見た場合に比較的「最近」起こった遺伝子の水平伝達により寄生生物のゲノム進化が進んで来たことを示した(Yoshida et al. 2010 Science)。こうした解析により、真核生物ゲノムの複雑性が生物間の遺伝子交流・水平伝達・細胞内共生的伝達によってもたらされるというゲノム進化の基本原理とも言うべき進化過程を明らかにすることができた。

Report

(3 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (9 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Permuted tRNA genes in the nuclear and nucleomorph genomes of photosynthetic eukaryc2010

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, et al.
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 27 Pages: 1070-1076

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Division of cell nuclei, mitochondria, plastids, and microbodies mediated by mitotic spindle poles in the primitive red alga Cyanidioschyzon merolae.2010

    • Author(s)
      Yuuta Imoto, et al.
    • Journal Title

      Protoplasma

      Volume: 241 Pages: 63-74

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nitrate assimilatory genes and their transcriptional regulation in a unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae : genetic evidence for nitrite reduction by a sulfite reductase-like enzyme.2010

    • Author(s)
      Sousuke Imamura, et al.
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: 51 Pages: 707-717

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nuclear horizontal gene transfer by the parasitic plant Striga hermonthica.2010

    • Author(s)
      Satoko Yoshida, et al.
    • Journal Title

      Science

      Volume: 328 Pages: 1128-1128

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cyanobacterial contribution to the genomes of the plastid-lacking protists.2009

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, et al.
    • Journal Title

      BMC Evolutionary Biology

      Volume: 9 Pages: 197-197

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetic positions of Glaucophyta, green plants(Archaeplastida) and Haptophyta (Chromalveolata) as deduced from slowly evolving nuclear genes.2009

    • Author(s)
      Hisayoshi Nozaki, et al.
    • Journal Title

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      Volume: 53 Pages: 872-880

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      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Origins of a cyanobacterial 6-phosphogluconate dehydrogenase in plastid-lacking eukaryotes2008

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, et al.
    • Journal Title

      BMC Evolutionary Biology 8

      Pages: 151-151

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      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Duplication, rearrangement and invention of novel tRNA genes in the nuclear and nucleomorph genomes of Photosynthetic eukaryotes.2010

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, Junichi Sugahara, John M.Archibald, Akio Kanai, Hisayoshi Nozaki
    • Organizer
      SMBE 2010-Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Ev
    • Place of Presentation
      リヨン、フランス
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 下等植物および原生生物におけるゲノム進化と葉緑体の起源2010

    • Author(s)
      丸山真一朗
    • Organizer
      日本植物学会第74回大会、若手奨励賞受賞講演
    • Place of Presentation
      中部大学、春日井
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Impact of endosymbiosis on the nuclear genomes of Euglena and other tiny eukary2010

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama
    • Organizer
      Sokendai International Seminar : Origin and Evolution of Environmental Adaptation -Symbiosis, Cell, Individual, Population and Society.
    • Place of Presentation
      湘南国際村センター、葉山
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] ミドリムシはかつて紅かった?緑色系二次共生藻における紅色系色素体型遺伝の起2009

    • Author(s)
      丸山真一朗、野崎久義
    • Organizer
      日本進化原生生物研究会(JSEP) 4th conference
    • Place of Presentation
      宮城教育大学、仙台
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Cyanobacterial contribution to the genomes of the plastid-lacking protists2009

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, Motomichi Matsuzaki, Kazuharu Misawa, Hisayoshi Nozaki
    • Organizer
      The 9th International Phycological Congress (IPC9)
    • Place of Presentation
      国立オリンピック記念青少年総合センター、東京
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑色二次共生藻で見つかった紅色系遺伝子の起源と「ミドリムシはかつて紅かった」説の検2009

    • Author(s)
      丸山真一朗、野崎久義
    • Organizer
      日本植物学会第73回大会
    • Place of Presentation
      山形大学、山形
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Cyanobacterial contribution to plastid-lacking protist genomes2008

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama, et al.
    • Organizer
      PROTIST 2008 - International Society of Protistologists (ISOP), 59th Annual Meeting/International Society for Evolutionary Protistology (ISEP), 17th Meeting (ISEP XVII)
    • Place of Presentation
      ダルハウジー大学(ハリファクス、カナダ)
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 色素体を持たない原生生物における植物型遺伝子の起源:水平伝達か?葉緑体の痕跡か?2008

    • Author(s)
      丸山真一朗, 他
    • Organizer
      日本植物学会第72回大会
    • Place of Presentation
      高知大学(高知県高知市)
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Origins of cyanobacterial genes in the genomes of plastid-lacking protists2008

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama
    • Organizer
      International Symposium "Bacteria made Organelles made Eukaryotic Cells"
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/tayousei/lab.html

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/tayousei/lab.html

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biol.s.u-tokyo.ac.jp/users/tayousei/lab.html

    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2008-04-01   Modified: 2024-03-26  

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