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トゲネズミ三種の比較解析によるY染色体消失過程の推定

Research Project

Project/Area Number 09J01887
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Genetics/Genome dynamics
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

村田 知慧  北海道大学, 大学院・生命科学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Project Status Completed (Fiscal Year 2010)
Budget Amount *help
¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2009: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
KeywordsTokudaia / 性染色体 / SRY / 進化 / FISH / CGH / 分子系統解析 / Zoo-FISH解析
Research Abstract

トゲネズミ属3種のうち、アマミトゲネズミとトクノシマトゲネズミは、XO/XO型の性染色体構成をもち、Y染色体だけでなく性決定遺伝子SRYを消失した極めてめずらしい哺乳類である。一方、オキナワトゲネズミ(以下オキナワ)は、一般的なXX/XY型の性染色体をもつが、その性染色体は一対の常染色体の転座により大型化し、SRYは特異的なアミノ酸置換と重複により独自の進化を遂げている。トゲネズミ属のY染色体の進化過程を明らかにすることを目的とし、平成22年度はオキナワにおいて、性染色体のさらなる構造変化の有無の検出、祖先Y染色体領域の同定、SRYの機能性予測をおこなった。29のマウスのcDNAクローンを用いたFISH解析の結果、オキナワの祖先X染色体領域(Xq)および性染色体に転座した常染色体領域(Xp、Yp)は他のネズミ類の遺伝子オーダーと一致し、構造変化はみられなかった。ただし、アマミトゲネズミの性決定候補遺伝子であるCBX2が、オキナワにおいて常染色体の転座に伴い、性染色体に連鎖し、さらに他の染色体に重複していた。また、CGH解析の結果、オキナワのY染色体に性特異的な領域は検出されなかったが、単一のY連鎖遺伝子と同定されたDDX3YとUTYのcDNAクローンを用いたFISHの結果、両遺伝子はYpの動原体付近に存在し、祖先Y染色体領域がYp動原体付近に保持されていることをつきとめた。さらに、SOX9の精巣特異的エンハンサー領域にあるSRY結合配列の保存性を、マウス、ラット、ヒト、オキナワにおいて比較した結果、結合サイトの一つにオキナワ特異的な置換がみられ、保存性が失われていた。今回の結果から、トゲネズミ共通祖先はY染色体にいくつかのY連鎖遺伝子を保持していたことが明らかとなったが、SRYの機能はトゲネズミ共通祖先において、すでに低下もしくは消失していた可能性が考えられた。トゲネズミ属のY染色体進化を解明するために、オキナワは鍵となる重要な種であることが本研究によって強く示された。

Report

(2 results)
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2011 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] A primer set to determine sex in the small Indian mongoose, Herpestes auropunctatus.2011

    • Author(s)
      Chie Murata, Go Ogura, Asato Kuroiwa
    • Journal Title

      Molecular Ecology Resources

      Volume: VOL.11 Pages: 386-388

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple copies of SRY genes on the large Y chromosome of the Okinawa spiny rat, Tokudaia muenninki.2010

    • Author(s)
      Chie Murata, Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Yoichi Matsuda, Asato Kuroiwa
    • Journal Title

      Chromosome Research

      Volume: VOL.18 Pages: 623-634

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Rediscovery after thirty years since the last capture of the critically endangered Okinawa spiny rat Tokudaia muenninki in the northern part of Okinawa Island.2010

    • Author(s)
      Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Katsushi Nakata, Shintaro Abe, Nobuhiko Kotaka, Atsushi Takashima, Chie Murata, Asato Kuroiwa
    • Journal Title

      Mammal Study

      Volume: VOL.35 Pages: 243-255

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Y染色体の運命-オキナワトゲネズミにおける新たな性染色体領域の獲得とSRY遺伝子の機能性-2010

    • Author(s)
      村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸市 神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-07
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] トゲネズミのY染色体進化-Y染色体の消失と存続-2010

    • Author(s)
      村田知慧, 黒岩麻里
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      北海道札幌市 北海道大学(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-20
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] トゲネズミの染色体進化と遺伝的多様性2010

    • Author(s)
      村田知慧, 黒岩麻里
    • Organizer
      第16回野生生物保護学会・日本哺乳類学会2010年度合同大会
    • Place of Presentation
      岐阜県岐阜市 岐阜大学(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-18
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] オキナワトゲネズミのSRYの機能性と新たな性染色体領域の構造2010

    • Author(s)
      村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里
    • Organizer
      第12回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京都目黒区 東京工業大学
    • Year and Date
      2010-08-03
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Y染色体の運命~トゲネズミにみられるY染色体消失と存続~2009

    • Author(s)
      村田知慧
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-12-11
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] オキナワトゲネズミの性染色体の大型化2009

    • Author(s)
      村田知慧
    • Organizer
      染色体学会第60回年会
    • Place of Presentation
      くにびきメッセ
    • Year and Date
      2009-11-13
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体進化2009

    • Author(s)
      村田知慧
    • Organizer
      沖縄生物学会第46回大会
    • Place of Presentation
      名桜大学
    • Year and Date
      2009-05-30
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体とSRY遺伝子の進化2009

    • Author(s)
      村田知慧
    • Organizer
      第11回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] オキナワトゲネズミのXおよびY染色体が大型したメカニズムの解明2009

    • Author(s)
      村田知慧
    • Organizer
      日本哺乳類学会2009年度台北大会
    • Place of Presentation
      台湾大学 台湾
    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2024-03-26  

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