Project/Area Number |
09J03369
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Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 国内 |
Research Field |
Chemistry related to living body
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
林 宏典 Kyoto University, エネルギー科学研究科, 特別研究員(DC2)
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Project Period (FY) |
2009 – 2010
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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Budget Amount *help |
¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2009: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
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Keywords | 超好熱菌 / RNAとタンパク質の複合体 / 熱安定性 / 酵素 |
Research Abstract |
本研究では複合体の結晶構造及びRNAとの相互作用形式が解明されており、尚かつ80℃以上で生育可能な超好熱菌内において機能するH/ACA Box RNPを基に設計した基本骨格を用いて、望みの機能を有し熱安定性の高い機能性RNPを構築する方法論の開発を試みている。本年度は、(1)基本骨格として用いるRNA部位及びタンパク質部位の決定と、(2)超好熱菌のタンパク質の発現、精製法及び分子設計によるapADHの機能改変について学ぶ事を目的に研究を行った。 (1)RNA部位及びタンパク質部位の決定 H/ACA Box RNPを構成している1つのRNA(guide RNA)及び4つのタンパク質サブユニット(Cbf5,Nop10,L7Ae,Gar1)の内から基本骨格として用いる部位の選択を行った。タンパク質サブユニットに関しては、論文及び結晶構造を基にRNAと最も相互作用面が大きいCbf5及び最もアミノ酸数が少なくH/ACA Box RNPの構造変化に寄与すると考えられるNop10をタンパク質サブユニットとして選択した。guide RNAに関しては、論文を基にCbf5及びNop10との相互作用部位の確認を行いCbf5及びNop10との相互作用を保持した最小限のRNA単位及びランダム領域の導入箇所を決定した。 (2)超好熱菌由来のタンパク質の発現、精製法及び機能改変について 超好熱菌由来のタンパク質の発現、精製法及び機能改変について学ぶ為に超好熱菌由来のアルコールデヒドロゲナーゼ(apADH)を用いて超好熱菌由来タンパク質の発現及び精製を行い、更にモデリングソフトを用いた分子設計によりapADHを熱安定性の高いホルムアルデヒドジスムターゼ(FDM)に機能改変する事を試みた。超高熱菌の精製法の習得、8種類のapADH変異体の作製及び熱安定性の評価を行った。
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Report
(1 results)
Research Products
(3 results)
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[Journal Article] Design Strategies of Fluorescent Biosensors Based on Biological macromolecular Receptors. Tainaka,K., Sakaguchi2010
Author(s)
Tainaka,K., Sakaguchi,R., Hayashi,H., Nakano,S., Liew,F.-F., Morii,T.
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Journal Title
Sensors 10
Pages: 1355-1376
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article]2009
Author(s)
Fukuda,M., Hasegawa,T., Hayashi,H., Morii,T.
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Journal Title
Combinatorial methods for chemical and biological sensors.(Springer)
Pages: 249-269
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