• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

核酸の立体配座固定のための新手法の開発と応用

Research Project

Project/Area Number 10780348
Research Category

Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Bioorganic chemistry
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

南川 典昭  北海道大学, 大学院・薬学研究科, 講師 (40209820)

Project Period (FY) 1998 – 1999
Project Status Completed (Fiscal Year 1999)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 1999: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 1998: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Keywordsヌクレオシド / 3-ハロゲノ-3-デアザプリン / 立体配座固定 / ヌクレオシド2',3'環状リン酸 / RNase T_1 / 3-デアザプリンヌクレオシド / ハロゲン / pKa / NOE / コンホメーション解析
Research Abstract

本研究では,ヌクレオシドのコンホメーションを従来の方法とは異なる新しい手法で固定し、その応用を含めて検討することを目的としている。昨年度、申請者は3_デアザプリンヌクレオシドの3位に嵩高い置換基を導入した3-置換-3-デアザプリンヌクレオシド類の合成を行なった。更にコンホメーション解析により3-ヨード、プロモ、クロロ体はいずれも、グリコシル結合回りのコンホメーションがanti配座に固定された基質であることを明らかにした。本年度はその応用としてRNA分解酵素であるRNase T_1との相互作用の検討を行なった。RNaseT_1はRNA分子中のグアニル酸の3',5'-ホスホジエステル結合を極めて特異的に切断し、2',3'環状リン酸体を経由して3'末端に3'-グアニル酸をもつオリゴリボヌクレオチドを生成する酵素である。またその変換の際、基質であるグアニル酸は活性中心においてsyn配座で結合し酵素作用を受けると考えられている。そこでanti配座に固定された3-クロロ-3-デアザグアノシンの2',3'環状リン酸体1を合成し、RNase T_1との相互作用の検討を行なった。また本来の基質であるグアノシンの2',3'環状リン酸体2ならびに3-デアザグアノシンの2',3'環状リン酸体3も併せて合成し速度論的解析を行なった。その結果、化合物3は化合物2と同様にRNase T_1によって加水分解を受けるのに対して、化合物1は全く化合分解を受けないことが明らかとなった。また化合物3のRNase T_1による加水分解反応における化合物1のKi値を求めたところ2.6mMであった。以上の結果は、化合物1がRNase T_1に結合するがsyn配座にコンホメーションが変化しないために加水分解を受けない化合物であることを強く支持しており、デアザプリン塩基部3位にハロゲンを導入することによって、極めて天然気質に近い状態でのコンホメーションの固定が実現できた。

Report

(2 results)
  • 1999 Annual Research Report
  • 1998 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All Other

All Publications (10 results)

  • [Publications] Noriaki Minakawa: "Synthesis and Conformational Investigation of Anti-Fixed 3-Deaza-3-halopurine Ribonucleosides"J.Org.Chem.. Vol64,No19. 7158-7172 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Takashi Naka: "Investigation of the Stereoselective Coupling of Thymine with meso-Thiolone-3,4-diol-1-oxide Derivatives via Pummere Reaction"Tetrahedron Lett.. Vol40. 6297-6300 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Noriaki Minakawa: "Mechanism-Based Design of IMPDH Inhibitors : Synthesis and Biological Activities of EICAR and its Derivatives"Current Medicinal Chemistry. Vol6. 615-628 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Noriaki Minakawa: "Ring-expanded Purine Nucleosides. The Synthesis and Cytotoxicity of Imidazo〔4,5-c〕azepine Nucleosides"Tetrahedron. Vol54. 13517-13528 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Akira Matsuda: "9-(6,7-Dideoxy-B-D-allo-hept-5-ynofuranosyl)adenine : A Selective and Potent Ligand for P_3 Purinoceptor-like protein"J.Med.Chem.. Vol41. 2676-2678 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Takashi Naka: "Stereoselective Synthesis of 4'-thioribonucleosides utilizing Pummere reaction"Nucleic Acids Symp.Ser.. Vol39. 21-22 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] N.Minakawa et.al.: "Ring-expanded Purine Nucleosides. The Synthesis and Cytotoxicity of Imidazo〔4.5-C〕azepine Nucleosides" Tetrahedron. 54. 13517-13528 (1998)

    • Related Report
      1998 Annual Research Report
  • [Publications] A.Matsuda et.al.: "9-(6.7-Dideoxy-β-D-allo-hept-5-ynofuranosyl)adenine: A Selective and Potent Ligand for P_2 Purinoceptor-like Protein" J.Med.Chem.41. 2676-2678 (1998)

    • Related Report
      1998 Annual Research Report
  • [Publications] T.Naka et al.: "Stereoselective synthesis of 4'-thioribonucleosides utilizing pummere reaction" Nucleic Acid Symp.Ser.39. 21-22 (1998)

    • Related Report
      1998 Annual Research Report
  • [Publications] N.Minakawa et al.: "Mechanism-based Design of Inosine 5'-Monophosphate Delydrogenase Inhibitors Synthesis and Biological Activities of EICAR and Its Derivatives" Current Medicinal Chemistry. (in press). (1999)

    • Related Report
      1998 Annual Research Report

URL: 

Published: 1998-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi