ホウ素に対する特徴的な応答を示す微生物の検索と解析

• Project/Area Number: 12F02397
• Research Category: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 外国
• Research Field: Plant nutrition/Soil science
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 藤原 徹 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80242163)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): AHMED Iftikhar 東京大学, 農学生命科学研究科, 外国人特別研究員 ; AHAMAD Iftikhar 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 外国人特別研究員
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000); Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2013: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000); Fiscal Year 2012: ¥400,000 (Direct Cost: ¥400,000)
• Keywords: ホウ素 / 細菌 / ゲノム配列 / 変異

Outline of Annual Research Achievements

本研究はホウ素過剰に耐性の微生物のホウ素耐性機構を明らかにするとともに、ホウ素耐性微生物を新たに検索することを目的とし進めて来た。これまでのAhmed博士の研究によって、複数のホウ素過剰性を示す新種細菌が同定されており、これを基にして、二つの柱で研究を進めてきた。一つ目はこれまでにAhmed氏が同定した飽和濃度のホウ酸に耐性かつホウ素要求性の細菌のゲノム配列解析と、変異株の解析を通じて、超高濃度のホウ素に耐性を示す仕組みやホウ素要求性となる仕組みを分子レベルで明らかにすることであり、これについては、ゲノム配列解析結果を論文発表するとともに、微生物のプロテオーム解析を行い、ホウ素に応じて蓄積の変化するタンパク質を見いだした。またパキスタン等の土壌から新たな微生物を同定し論文報告した。これらの研究によって細菌とホウ素の関係の一端を明らかにすることができた。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Kushneria pakistanensis sp. nov., a novel moderately halophilic bacterium isolated from rhizosphere of a plant (Saccharum spontaneum) growing in salt mines of the Karak area in Pakistan (2015)
  • Author(s): A Bangash, I Ahmed, S Abbas, T Kudo, A Shahzad, T Fujiwara, O. Moriya
  • Journal Title: Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology Volume: 07(4) Issue: 4 Pages: 991-1000
  • DOI: 10.1007/s10482-015-0391-9
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Draft Genome Sequence of Boron-Tolerant and Moderately Halotolerant Bacterium Gracilibacillus boraciitolerans JCM 21714T (2014)
  • Author(s): Ahmad, I., Oshima, K., Suda, W., Kitamura, K., Iida, T.,Ohmori,Y., Fujiwara, T., Hattori, M. and Ohkuma, M.
  • Journal Title: Genome Announcements Volume: 2(1) Issue: 1
  • DOI: 10.1128/genomea.00097-14
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Cellulomonas pakistanensis sp. nov., a novel moderately halotolerant Actinobacteria (2014)
  • Author(s): Ahmed, I., Kudo, T., Abbas, S., Ehsan, M., Iino,T., Fujiwara, T. and Ohkuma, M.
  • Journal Title: IJSEM Volume: 64 Issue: Pt_7 Pages: 2305-2311
  • DOI: 10.1099/ijs.0.059063-0
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] Cellulomonas pakistanensis sp. nov. A Moderately Halotolerant Novel Plant Growth Promoting Actinobacteria (2013)
  • Author(s): Iftikhar AHMED, Takuji Kudo, Saira Abbas, Muhammad Ehsan, Takao Iino, Toru Fujiwara and Moriya
  • Organizer: 13th International Conference on Culture Collections (ICCC13)
  • Place of Presentation: 北京(中国)
  • Year and Date: 2013-09-23
• [Presentation] Whole Genome Dissection of Boron-tolerant Bacteria (2013)
  • Author(s): Iftikhar Ahmed, Toshiya Iida, Moriya Ohkuma, Toru Fujiwara
  • Organizer: KVII INTERNATIONAL PLANT NUTRITION COLLOQUIUI
  • Place of Presentation: イスタンブール(トルコ)
  • Year and Date: 2013-08-19