認知機能におけるエピジェネティクスの役割とその臨床応用性
| Project/Area Number |
12F02422
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 外国 |
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| Research Field |
Human genetics
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| Research Institution | Kobe University |
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Principal Investigator |
戸田 達史 神戸大学, 医学研究科, 教授 (30262025)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
CHA Pei Chieng 神戸大学, 医学研究科, 外国人特別研究員
CHA Pei Chieng 神戸大学, 大学院医学研究科, 外国人特別研究員
CHA PeiChieng 神戸大学, 大学院・医学研究科, 外国人特別研究員
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2014)
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| Budget Amount *help |
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2014: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
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| Keywords | 一般認知機能ｇ / エピジェネティック / 次世代シーケンサー / Methylation Sequencing / ＤＮＡメチル化 / Enrichment analysis / 蛋白質間相互作用データーベース / 創薬データーベース / 一般認知機能g / DNAメチル化 / 遺伝子発現の差 / 病態解明 / 候補遺伝子 / 行動解析 / 遺伝子発現解析 / 定量RT-PCR / 遺伝子ネットワーク |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、一般認知機能ｇを制御する遺伝子と遺伝子ネットワークのエピジェネティックなメカニズムを解明することを目的に行っている。これまでに、41匹の近交系マウスの行動解析および網羅的な遺伝子発現解析やネットワーク解析より、一般認知機能ｇを制御すると考えられる遺伝子ネットワークを同定した。さらに、それらの遺伝子と遺伝子ネットワークのエピジェネティックな発現メカニズムを解明するために、次世代シーケンサーを使ったMethylation sequencingでマウスの脳全体のDNAメチル化の検討を行った。
現在、メチル化DNA領域のシーケンス解析を行って、認知機能の高いマウスと低いマウスそれぞれに特異的なメチル化DNA領域を同定し、さらにそのメチル化パターンの違いによる遺伝子発現の差が一般認知機能gにどのような影響を与えるのかを検討している。
一方、一般認知機能gを制御するとして同定した遺伝子が、認知機能に異常を示す疾患の病態に関係しているかどうかを検討するために、その中から一般認知機能gと関連の強いトップ100遺伝子を選んだ。蛋白質間相互作用データベース (PINA PPI network) に基づいて、トップ100遺伝子と既知の認知機能関連遺伝子、または認知機能に異常を示す疾患（精神遅滞、自閉症、パーキンソン病、アルツハイマー型認知症、レット症候群、統合失調症）の関連候補遺伝子との、蛋白質間相互作用を介したつながりをEnrichment analysis (Nature 506:376-81) によって網羅的に検討した。その結果、トップ100遺伝子とそれらに関連することが知られている蛋白質には、既知の認知機能関連遺伝子、精神遅滞、自閉症、パーキンソン病とアルツハイマー型認知症の関連候補遺伝子が有意に多く含まれていることがわかった。
Enrichment analysisにより、一般認知機能gと上記疾患との共通候補遺伝子および経路が示唆された。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(3 results)
Research Products
(18 results)
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[Journal Article] A de novo mutation of the MYH7 gene in a large Chinese family with autosomal dominant myopathy2015
Author(s)
Oda T, Xiong H, Kobayashi K, Wang S, Satake W, Jiao H, Yang Y, Cha PC, Hayashi Y, Nishino I, Suzuki Y, Sugano S, Wu X, Toda T.
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Journal Title
Human Genome Variation
Volume: 2
Issue: 1
Pages: 15022-15022
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] A de novo mutation of the MYH7 gene in a large Chinese family with autosomal dominant myopathy.2014
Author(s)
Toda T, Xiong H, Oda T, Kobayashi K, Wang S, Satake W, Jiao H, Yang Y, Suzuki Y, Sugano S, Wu X.
Organizer
The 19th International Congress of the World Muscle Society.
Place of Presentation
Berlin, Germany.
Year and Date
2014-10-07 – 2014-10-11
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