ヒト白血球抗原によるＨＩＶゲノムの多様性獲得の研究

• Project/Area Number: 12J04376
• Research Category: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 国内
• Research Field: ゲノム医科学
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: 近田 貴敬 熊本大学, エイズ学研究センター, 特別研究員(PD)
• Project Period (FY): 2012-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000); Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2012: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
• Keywords: HIV-1 / HLA class I / 逃避変異 / シークエンス / HLA-C*03 / コホート / CTL / HLA-associated polymorphism

Outline of Annual Research Achievements

我々は、昨年度までのHLA-C*03サブタイプ間のHLA-associated polymorphism （HLA-AP）の解析により、ペプチド結合部位の外側（91番アミノ酸）のアミノ酸の違いが、ペプチドとの結合またはT細胞レセプター（TCR）やNK細胞レセプター（KIR）との相互作用に寄与している可能性を示唆し、さらに特定のHLA-C*03拘束性HIV-1エピトープペプチドに対する親和性が両サブタイプ間で異なることを明らかにした。そこで本年度の研究として、エピトープペプチドとのペプチド解離速度、TCRやKIRとの会合に与える影響を詳細に解析した。
まず、ペプチド結合能の安定性に差があるかどうかを調べた結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間でGag-YL9およびGag-KL9ペプチドの解離速度に有意な差は見られなかった。また、YL9特異的Bulk T細胞のHLA-C*03:03-YL9およびC*03:04-YL9テトラマーに対する結合親和性は、同等であることが明らかになった。さらに、YL9およびKL9特異的CTLクローンの認識能を調べた結果、YL9特異的CTLクローンではHLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差が見られたが、KL9特異的CTLクローンではその認識能に差が見られなかった。また、YL9特異的CTLクローンおよびNK細胞によるHIV-1に対するウイルス増殖抑制能を比較した結果、HLA-C*03:03およびC*03:04の間で有意な差は見られなかった。
これまでのHLA-C*03サブタイプの詳細な解析により、ペプチド結合部位の外側のわずかな立体構造の変化によってペプチド結合能に差が生じることで、異なるHIV-1アミノ酸変異が選択されている可能性が示唆された。本研究は、HIV-1のアミノ酸変異選択および多様性獲得の複雑なメカニズムの一端を解明するために、非常に重要であると考えられる。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Host-Specific Adaptation of HIV-1 Subtype Bin the Japanese Population (2014)
  • Author(s): Takayuki Chikata, Jonathan M. Carlson, Yoshiko Tamura, Mohamed Ali Borghan, Takuya Naruto, Masao Hashimoto, Hayato Murakoshi, Anh Q. Le, Simon Mallal, Mina John, Hiroyuki Gatanaga, Shinichi Oka, Zabrina L. Brumme, Masafumi Takiguchi
  • Journal Title: Journal of Virology Volume: 88巻 Issue: 9 Pages: 4764-4775
  • DOI: 10.1128/jvi.00147-14
  • Peer Reviewed
• [Presentation] The impact of amino-acid substitution at a position outside the peptide binding groove of HLA-C subtypes in HIV-1-specific T cell recognition (2014)
  • Author(s): 近田 貴敬, 村越 勇人, 小柳円, 赤星智寛, 岡 慎一, 滝口 雅文
  • Organizer: 15th Kumamoto AIDS Seminar
  • Place of Presentation: 熊本県熊本市
  • Year and Date: 2014-10-01 – 2014-10-03
• [Presentation] 日本人HIV-1慢性感染者におけるHLAに関連したHIV-1多型の解析と非アジア人コホートとの比較解析 (2014)
  • Author(s): 近田 貴敬, Jonathan M Carlson, 田村 美子, Mohamed Ali Borghan, 成戸 卓也, 端本 昌夫, 村越 勇人, Anh Q. Le, Simon Mallal, Mina John, 潟永 博之, 岡 慎一, Zabrina L Brumme, 滝口 雅文
  • Organizer: 第16回白馬シンポジウム
  • Place of Presentation: 熊本県熊本市
  • Year and Date: 2014-06-13 – 2014-06-14
• [Presentation] HIV-1 Polymorphisms Associated with 4-Digit HLA Alleles in Japanese Individuals Chronically Infected with the Clade B Virus (2013)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: AIDS Vaccine 2013
  • Place of Presentation: International Convention Center(バルセロナ・スペイン)
• [Presentation] Host-Specific Adaptation of HIV-1 Subtype B in the Japanese Population (2013)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: 第14回熊本エイズセミナー
  • Place of Presentation: 阿蘇リゾートグランヴィリオホテル(熊本市)
• [Presentation] 日本人慢性HIV-1感染者におけるHLA-Associated Polymorphismの解析 (2013)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: 第23回日本エイズ学会学術集会
  • Place of Presentation: 市民会館崇城大学ホール(熊本市)
• [Presentation] 日本人慢性HIV-1感染者におけるHLA-Associated Polymorphismの解析 (2012)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • Place of Presentation: グランキューブ大阪(大阪市)
  • Year and Date: 2012-11-15
• [Presentation] HLA-Associated Viral Polymorphism in Chronically HIV-1-Infected Japanese Cohort: Analysis of Four-Digit HLA Allele Level (2012)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: 第13回熊本エイズセミナー・エイズGCOE国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 阿蘇リゾートグランヴィリオホテル(熊本市)
  • Year and Date: 2012-10-25
• [Presentation] HLA-Associated Viral Polymorphism in Chronically HIV-1-Infected Japanese Cohort: Analysis of Four-Digit HLA Allele Level (2012)
  • Author(s): 近田 貴敬
  • Organizer: AIDS Vaccine 2012
  • Place of Presentation: ボストン・コンベンション&エキシビションセンター(ボストン・米国)
  • Year and Date: 2012-09-10
• [Remarks]
  • URL: http://www.caids.kumamoto-u.ac.jp/data/takiguchi/viral/gyouseki/insei/insei-gyouseki-chikata.htm
• [Remarks]
  • URL: http://www.caids.kumamoto-u.ac.jp/data/takiguchi/viral/gyouseki/insei/insei-gyouseki-chikata.htm