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mRNA分解による新規のショ糖応答制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 13J00043
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field 植物分子生物・生理学
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

鈴木 悠也  北海道大学, 生命科学院, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
KeywordsポリA鎖 / CCR4 / RNA分解 / シロイヌナズナ / mRNA分解 / Poly(A)
Outline of Annual Research Achievements

1. GBSS1 mRNAの半減期の測定: 表現型の解析により,atccr4a/4bの二重変異株がより多くのアミロースを蓄積させていることを明らかにした。さらにマイクロアレイを用いた遺伝子の網羅的な解析により,アミロース合成酵素の1つであるGBSS1の発現量が二重変異株で増加していることを明らかにし,かつLM-PAT法により二重変異株では長いポリA鎖を持つGBSS1 mRNAが蓄積していることを明らかにした。ポリA鎖はmRNAの安定性や翻訳効率に影響を与え得ることから,転写阻害剤を用い,野生型株と二重変異株でGBSS1 mRNAの安定性を測定した。その結果,二重変異株はGBSS1 mRNAが長いポリA鎖を持つにも関わらず,その安定性は野生型株と二重変異株で差が見られなかった。このことから,二重変異株におけるGBSS1のポリA鎖はmRNAの安定性ではなく,タンパク質の翻訳効率に影響を与えていることが示唆された。
2. 時計遺伝子の挙動: マイクロアレイを用いた解析により,二重変異株でmRNAの蓄積量が変化している遺伝子群に,発現が日周リズムを刻む遺伝子が有意に濃縮されていることが明らかとなった。植物の日周リズムは光シグナルや温度によって制御されており,リズム形成の中心を担うのが時計遺伝子である。そこで,二重変異株における時計遺伝子の発現パターンを解析したところ,時計遺伝子であるCCA1の発現が二重変異株において有意に遅れることを明らかにした。さらにCCA1のポリA鎖の長さをLM-PAT法により測定したところ,二重変異株では長いポリA鎖を持つCCA1が検出された。このことから,CCA1はAtCCR4による脱アデニル化反応を受ける標的遺伝子であることが明らかになった。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] AtCCR4a and AtCCR4b are involved in determining the poly(A) length of granule-bound starch synthase 1 transcript and modulating sucrose and starch metabolism in Arabidopsis thaliana2015

    • Author(s)
      Yuya Suzuki, Toshihiro Arae, Pamela J. Green, Junji Yamaguchi and Yukako Chiba
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 印刷中 Issue: 5 Pages: 863-874

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv012

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Plant deadenylases, AtCCR4a and AtCCR4b play an important role in determining the poly(A) length of CCA1 and TOC1 transcripts.2015

    • Author(s)
      鈴木悠也,平井優美,Pamela J. Green,山口淳二,千葉由佳子
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Plant dadenylases, AtCCR4a and AtCCR4b are important for determining the poly(A) length of TOC1 transcript.2014

    • Author(s)
      鈴木悠也,平井優美,Pamela J. Green,山口淳二,千葉由佳子
    • Organizer
      日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-11-07 – 2014-11-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional analysis of the putative deadenylase, AtCCR4c, which is localized in chloroplast2014

    • Author(s)
      鈴木悠也,平井優美,高橋広夫,山口淳二,千葉由佳子
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ウインクあいち(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] AtCCR4s degrade the poly(A) tail of GBSS1 mRNA which is responsible for amylose synthesis2014

    • Author(s)
      Yuya Suzuki, Pamela J. Green, Junji Yamaguchi, Yukako Chiba
    • Organizer
      Post-transcriptional gene expression regulation in plants
    • Place of Presentation
      Poznan(Poland)
    • Year and Date
      2014-06-30 – 2014-07-02
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of a chloroplast-localized RNase in Arabidopsis2014

    • Author(s)
      鈴木悠也, 平井優美, 高橋広夫, 山口淳二, 千葉由香子
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Poly(A) specific ribonucleases, AtCCR4s are important for the starch metabolism2013

    • Author(s)
      鈴木悠也, 平井優美, Pamela J. Green, 山口淳二, 千葉由香子
    • Organizer
      The 24th International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      Sydnyey Convention and Exhibition Centre (Australia)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional analysis of plant deadenylases AtCCR4s which regulate the sugar metabolism2013

    • Author(s)
      鈴木悠也, 平井優美, Pamela J. Green, 山口淳二, 千葉由香子
    • Organizer
      第15回RNAミーティング
    • Place of Presentation
      県民文化会館・ひめぎんホール(愛媛県)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 脱アデニル化酵素AtCCR4の変異株は糖代謝に異常を示す2013

    • Author(s)
      鈴木悠也, Pamela J. Green, 山口淳二, 千葉由香子
    • Organizer
      第31回日本植物細胞分子生物学会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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