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ナノ開口を用いた高濃度蛍光1分子イメージングによるRuvBの6量体形成機構解析

Research Project

Project/Area Number 13J02227
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Molecular biology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

岩佐 拓磨  京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords1分子イメージング / DNA組換え / RuvB / 蛍光1分子イメージング
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、DNAの相同組換えの進行に重要な役割を果たすRuvBタンパク質がHolliday Junction複合体を形成するメカニズムを明らかにすることである。蛍光顕微鏡と蛍光標識RuvBを用いて、Holliday Junction DNAと相互作用するRuvBをリアルタイムでイメージングし、6量体形成のメカニズムを明らかにすることにした。RuvBの6量体形成過程の観察には高濃度(>200 nM)のRuvBの存在が必須である。通常の蛍光1分子イメージングの方法では高濃度での観察ができないため、ガラス上に直径および深さが100ナノメートル程度の穴が空いた「ナノ開口基板」を用いて研究を行うことにした。昨年度はナノ開口の作製法を確立し、機能を保ったままRuvBを蛍光標識することにも成功した。本年度は、RuvAと結合させたHolliday Junction DNAをナノ開口の底部に固定し、そこに蛍光標識RuvBを加え、Holliday Junction DNAとRuvBが相互作用する様子をヌクレオチドがない条件、ADP存在下、ATPgammaS存在下、ADPとATPgammaS存在下の4つの異なるヌクレオチド条件下で観察した。その結果、ADPあるいはATPgammaS存在下でより多くのRuvBがHolliday Junction DNAと相互作用することが解った。これらの結果は、ATPが単にRuvB hexameric ring の形成だけでなく、RuvBがRuvA-Holliday junctionと安定な複合体を形成することに重要な役割を果たしていることを示唆している。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2015 2014 2013

All Presentation (6 results)

  • [Presentation] Characterization of RuvA-RuvB-Holliday junction DNA complex formation process using Single molecule fluorescence imaging technique.2015

    • Author(s)
      Yong-Woon Han, Takuma Iwasa, Ryo Hiramatsu, Hiroaki Yokota, Ryuji Yokokawa, Teruo Ono, and Yoshie Harada
    • Organizer
      The 18th iCeMS International Symposium & The 15th International Membrane Research Forum
    • Place of Presentation
      京都大学 京都
    • Year and Date
      2015-03-03
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of RuvA-RuvB-Holliday junction DNA complex formation process2015

    • Author(s)
      Yong-Woon Han, Takuma Iwasa, Ryo Hiramatsu, Hiroaki Yokota, Ryuji Yokokawa, Teruo Ono, and Yoshie Harada
    • Organizer
      Biophysical Society 59th Annual Meeting Baltimore
    • Place of Presentation
      Baltimore, Maryland, USA
    • Year and Date
      2015-02-08
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ナノ開口を用いた1分子イメージングによるRuvB 6量体形成機構解析2015

    • Author(s)
      岩佐拓磨、韓龍雲、原田慶恵
    • Organizer
      新学術領域「少数性生物学」第 8回領域 会議
    • Place of Presentation
      ルスツリゾート 北海道
    • Year and Date
      2015-01-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Characterization of RuvB hexameric ring formation Process using Zero-mode waveguides2014

    • Author(s)
      Harada Yoshie, Takuma Iwasa, Yong-Woon Han, Ryo Hiramatsu, Hiroaki Yokota, Ryuji Yokokawa, and Teruo Ono
    • Organizer
      新学術領域「少数性生物学」第 7回領域 会議
    • Place of Presentation
      琵琶湖クラブ 滋賀
    • Year and Date
      2014-06-21
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule visualization of RuvB oligomer for characterizing a AAA+ class hexameric ATPase with zero-mode waveouides.2014

    • Author(s)
      Takuma Iwasa
    • Organizer
      Biophsical Society
    • Place of Presentation
      サンフランシスコ・アメリカ
    • Year and Date
      2014-02-19
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-molecule visualization of RuvB oligomer for characterizing a AAA+ class hexameric ATPase with zero-mode waveguides2013

    • Author(s)
      岩佐 拓磨
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2013-09-29
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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