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メダカで発見された巨大な新規DNAトランスポゾンAlbatrossの解析

Research Project

Project/Area Number 13J09339
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Genetics/Genome dynamics
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

井上 雄介  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywordsトランスポゾン / ウイルス / ゲノム / メダカ / ヘルペスウイルス
Outline of Annual Research Achievements

トランスポゾンは生物のゲノム上を転移するDNA配列であり、あらゆる生物種に普遍的に存在する。その転移は遺伝情報を変化させるため、宿主生物種のゲノム進化に寄与していると考えられている。当研究室の先行研究により、メダカDa変異体の原因因子として少なくとも42 kb以上である大型の新規DNAトランスポゾンが見出され、Albatrossと命名された。Albatrossの挿入が原因と推定されるメダカ変異体は他にも複数報告があり、メダカゲノムにおいて転移していることが示唆されていた。しかし、その全配列は決定されておらず、サイズ、内部配列の由来、転移活性の有無などは不明であった。
昨年度までに、Albatrossはヘルペスウイルスゲノムと一体化した、長さ180 kbを上回る巨大なpiggyBac型DNAトランスポゾンであり、さらに転移活性を保持していることを示した。これより、Albatrossはトランスポゾンの転移機構を二次的に獲得して宿主ゲノム内に内在化したヘルペスウイルスである可能性が示唆された。今年度は本現象の普遍性を検証するために、他の生物種におけるAlbatross様配列の探索および系統解析を行った。
その結果、ゲノムが解読されている約60種の真骨魚類のうち16種について、Albatrossと相同性の高いヘルペスウイルス様配列が検出された。系統解析の結果、これらのAlbatross様配列は互いに近縁であり、魚類・両生類感染型ヘルペスウイルス内で一つのクラスターを形成した。さらに、いくつかの種についてはAlbatross様配列がゲノム内で複数コピー存在していることが示唆され、メダカと同様にAlbatross様配列がゲノム内で増幅している可能性が示唆された。以上より、ゲノムに内在化する性質をもった新規のヘルペスウイルスの一群が存在している可能性が示唆された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014 2013

All Presentation (7 results) (of which Invited: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Presentation] Novel active and giant DNA transposon Albatross in the medaka genome2015

    • Author(s)
      ○井上 雄介、佐賀 友則、相川 拓海、森下 真一、成瀬 清、島田 敦子、古賀 彰彦、武田 洋幸
    • Organizer
      Utokyo-NTU Biological Science Seminar 2015
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館 (東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-12-10
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ヘルペスウイルスと一体化した巨大DNAトランスポゾンAlbatross2015

    • Author(s)
      ○井上 雄介、佐賀 友則、相川 拓海、森下 真一、成瀬 清、島田 敦子、古賀 彰彦、武田 洋幸
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド (兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] The largest DNA transposon, Albatross -its evolution and application2014

    • Author(s)
      ○Yusuke Inoue, Takumi Aikawa, Mariko Kondo, Shinichi Morishita, Kiyoshi Naruse, Atsuko Shimada, Akihiko Koga, Hiroyuki Takeda
    • Organizer
      第47回日本発生生物学会
    • Place of Presentation
      愛知県産業労働センター (名古屋)
    • Year and Date
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] A novel giant DNA transposon Albatross in medaka fish2013

    • Author(s)
      Yusuke Inoue, Takumi Aikawa, Mariko kondo, Shinichi Morishita, Kiyoshi Naruse, Atsuko Shimada, Akihiko Koga, Hiroyuki Takeda
    • Organizer
      2013 Regional Meeting on Mobile Genetic Elements
    • Place of Presentation
      アメリカ・Cold Spring Harbor Laboratory
    • Year and Date
      2013-10-25
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] メダカで発見された巨大な新規DNAトランスポゾンAlbatross2013

    • Author(s)
      井上雄介、近藤真理子、森下真一、成瀬清、島田敦子、古賀章彦、武田洋幸
    • Organizer
      日本動物学会第84回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      2013-09-27
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] A novel giant DNA transposon Albatross in medaka fish2013

    • Author(s)
      Yusuke Inoue, Takumi Aikawa, Mariko kondo, Shinichi Morishita, Kiyoshi Naruse, Atsuko Shimada, Akihiko Koga, Hiroyuki Takeda
    • Organizer
      第19回小型魚類研究会
    • Place of Presentation
      仙台・仙台市情報産業プラザ(宮城県)
    • Year and Date
      2013-09-21
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] メダカで発見された巨大な新規DNAトランスポゾンAlbatross2013

    • Author(s)
      井上雄介、近藤真理子、森下真一、成瀬清、島田敦子、古賀章彦、武田洋幸
    • Organizer
      第13回生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2013-06-08
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規なトランスポゾン転移酵素2013

    • Inventor(s)
      武田洋幸、井上雄介、島田敦子
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2013-05-29
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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