結核菌感染における疾患感受性遺伝子ならびに薬剤治療有効性決定遺伝子の同定

• Project/Area Number: 13J10599
• Research Category: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 国内
• Research Field: 人類遺伝学
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 大前 陽輔 東京大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)
• Project Period (FY): 2013-04-26 – 2016-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2015)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥780,000); Fiscal Year 2015: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2014: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2013: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
• Keywords: 結核症 / ゲノムワイド関連解析 / 菌体ゲノム / 宿主ゲノム / タイ王国 / 結核 / 国際情報交換

Outline of Annual Research Achievements

本研究計画の目的は、結核菌による感染症である結核症について、病状の発症並びに薬剤治療有効性に与る宿主の遺伝的要因を、結核菌の遺伝的背景の情報と患者のゲノム情報とを統合的に解析することで、結核菌の遺伝的背景ごとに特徴的な感染メカニズムや薬剤治療応答メカニズムを明らかにすることである。
これまで、受入研究室の先行研究によるゲノムワイド関連解析（GWAS）により同定されていた若年性結核における発症関連因子MAFBに対して、結核菌の遺伝的背景の情報を加えた解析を行い、特定の遺伝系統でのみ発症関連遺伝子MAFBのリスクが有意に上昇することの再現性を得た。本成果は結核症のリスク遺伝要因を同定するうえで、病原菌である結核菌のゲノム情報も考慮することが重要であることを示しており、本年度に開催された第１３回国際人類遺伝学会にて口頭発表を行った。さらに本年度は、MAFB以外の宿主の結核発症リスク遺伝子についても解析を進め、タイ王国で収集した北京型株感染患者270例、非北京型株感染患者420例、健常者782例によるゲノムワイド関連解析の結果、1番染色体13pの領域に非北京型株感染群で老年性の結核発症とより強い関連を示すSNPを見出し、このSNPは多重検定の補正を考慮しても有意であった。対してこのSNPは北京型感染患者群では有意な関連を示さなかった。当該SNPは白血球の細胞表面抗原の一種を発現する遺伝子の近傍に位置しており、その遺伝子は先行研究で細胞への結核菌感染実験において発現量が変動する遺伝子にリストされていたが、これまでヒトにおける結核発症との関連は報告されておらず、新規の結核発症の分子機構を示唆するに至った。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Int'l Joint Research] タイ保健省医科学局/マヒドン大学(タイ)
• [Int'l Joint Research] ヤルシ大学(インドネシア)
• [Int'l Joint Research] タイ保健省医科学局/マヒドン大学(タイ)
• [Int'l Joint Research] ヤルシ大学(インドネシア)
• [Journal Article] Principles and Practice of Genome-wide Association Study (ゲノムワイド関連解析の原理と実際） (2015)
  • Author(s): 大前陽輔、徳永勝士
  • Journal Title: 特集；内分泌科医が理解しておきたい遺伝学の新しい潮流、ホルモンと臨床 Volume: ６２（２） Pages: 125-131
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Pathogen lineage based genome-wide analysis of host genetic risk factorｓ in tuberculosis (2016)
  • Author(s): 大前陽輔, Surakameth Mahasirimongkol, 豊岡理人, 野内英樹, Supalert Nedsuwan, Sukanya Wattanapokayakit, Nat Smittipat, Prasit Paliittapongarnpim, Pathom Sawanpanyalert, Nuanjun Wichukchinda, Ekawat Pasomsub, 莚田泰誠, 久保充明, 徳永勝士
  • Organizer: 第１６回生命科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 21KOMCEE(東京都目黒区）
  • Year and Date: 2016-04-23
• [Presentation] Pathogen lineage based analysis of host genetic risk factor in young onset tuberculosis (2016)
  • Author(s): Yosuke Omae, Surakameth Mahasirimongkol, Licht Toyo-oka, Hideki Yanai, Supalert Nedsuwan, Sukanya Wattanapokayakit, Nat Smittipat, Prasit Paliittapongarnpim, Pathom Sawanpanyalert, Nuanjun Wichukchinda, Ekawat Pasomsub, Taisei Mushiroda, Michiaki Kubo, and Katsushi Tokunaga.
  • Organizer: The 13th International Congress of Human Genetics (ICHG)
  • Place of Presentation: 京都国際会館（京都府京都市）
  • Year and Date: 2016-04-03
  • Int'l Joint Research
• [Remarks] 人類遺伝学教室ホームページ 結核研究について
  • URL: http://www.humgenet.m.u-tokyo.ac.jp/research/1-5.html