SNPを用いた顎変形症における遺伝要因のゲノム解析
Project/Area Number |
14657521
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Research Category |
Grant-in-Aid for Exploratory Research
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Field |
Surgical dentistry
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
飯塚 忠彦 京都大学, 医学研究科, 教授 (80026921)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菅井 学 京都大学, 遺伝子実験施設, 助手 (90303891)
高橋 克 京都大学, 医学研究科, 助手 (90314202)
清水 章 京都大学, 医学研究科, 教授 (00162694)
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Project Period (FY) |
2002 – 2003
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2003)
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Budget Amount *help |
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2002: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
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Keywords | 顎変形症 / ゲノム / 遺伝要因 |
Research Abstract |
顎変形症のゲノム解析については、本学の医の倫理委員会にて審査の結果、承認を受けた。 1、顎変形症患者の血液サンプルの収集 平成14年度内に京都大学医学部附属病院口腔外科において、顎矯正外科手術を受ける予定の前後的、垂直的な顎間関係に大きなバリエーションのある顎変形症患者を対象として、十分なインフォームドコンセントを行った後、同意を得られた患者より、10mlの採血を行った。各サンプルを匿名化後、5mlは冷凍保存し、5mlよりgenomic DNAを抽出している。現在までのところ、40例ほどのサンプルを冷凍保存およびgenomic DNAを抽出した。 2,候補遺伝子の探索 我々は、bHLH型転写因子(E2A等)の機能抑制因子のひとつであるId2の欠損マウスにおいて、血中IgEがコントロールの約20倍に上昇している事とともに、顎顔面の非対称を認めるというphenotypeを見い出している(unpublished data)。上記のgenomic DNAを用いて、Id2の各エクソンごとにgenomic PCRを行った。各エクソンについて、エクソンーイントロンの境界部及びエクソンの翻訳領域、調節領域に関して、センスストランドとアンチセンスストランド両方向について、ダイレクトシークエンスを行った。現在までのところ、検索した範囲内において塩基配列の挿入や欠失および、ノンセンス変異やミスセンス変異を引き起こすようなSNPなどの塩基置換は見い出されていない。今後更に症例数を増やして、現在検討しているところである。
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Report
(2 results)
Research Products
(8 results)