高頻度ゲノム変異がもたらす歯周病原細菌の病原性変換メカニズム
| Project/Area Number |
14J02840
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 国内 |
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| Research Field |
Morphological basic dentistry
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| Research Institution | The University of Tokyo (2015)
Tokyo Medical and Dental University (2014) |
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Principal Investigator |
渡辺 孝康 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任助教
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| Project Period (FY) |
2014-04-25 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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| Keywords | 口腔細菌学 / 歯周病原細菌 / ゲノム解析 / CRISPR |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1) P. gingivalisおよびP. gulae の多株ドラフトゲノム配列データからCRISPR領域を同定し、その型別分布を調べたところ、2つの細菌種に共通な型が同定された一方で、種特異的な型も同定された。また、両細菌種が属するPorphyromonas属において入手可能な細菌種ゲノム配列にて同様の解析を行った結果、種を超えてCRISPR型別の類似性がみられるパターンがあった。
2) Porphyromonas属のゲノム配列からアミノ酸配列に基づいて作成した系統樹において、P. gingivalisとP. gulaeが極めて近縁であったことと、両者の枝長の違いから、P. gulaeがP. gingivalisの進化的祖先であるものと仮定し、系統樹における年代推定や現在より時間的に離れた時点でのゲノムデータ取得によるマッピング解析の実施を試みている。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(2 results)
Research Products
(11 results)
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[Book] NIH NCBI Bookshelf2015
Author(s)
Maruyama F, Watanabe T, Nakagawa I
Publisher
Group A Streptococcus Genome.”Streptococcus pyogenes, Basic Biology to Clinical Manifestations
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