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ENDOR法による光合成酸素発生における基質水分子の同定及び反応メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 14J11113
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Physical chemistry
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

長嶋 宏樹  名古屋大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2014-04-25 – 2017-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2016)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2016: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsマンガンクラスター / 磁気共鳴 / 酸素発生 / 光化学系II / 光合成 / 電子スピン共鳴 / 電子核二重共鳴 / 電子スピン共鳴(ESR,EPR) / 電子核二重共鳴(ENDOR) / 水分解酸素発生 / Mnクラスター / 水分解触媒 / 水分解メカニズム
Outline of Annual Research Achievements

酸素発生型光合成は光エネルギーを利用して、二酸化炭素を化学エネルギー源である糖に変換する反応で、水を電子源として酸素を作り出す。光合成における酸素発生は植物やシアノバクテリアのもつ葉緑体の光化学系IIタンパク質複合体内にあるMnクラスターで行われる。マンガンクラスターは酸化状態の異なる5つの状態S0-S4を持ち、光エネルギーを吸収して酸化され状態が遷移する。最も酸化されたS4状態になると酸素を作り出して最も還元されたS0状態へと戻る。近年のX線結晶構造解析の分解能向上によりマンガンクラスターの構造が明らかにされ、基質の候補と成る4つの配位水分子の位置も明らかにされたが、各S状態遷移における構造変化やプロトン放出機構は未だ明らかではない。
本研究ではさらにマンガンクラスター近傍に位置する水、アミノ酸に加えて、添加したメタノール分子のプロトンの位置について電子核二重共鳴測定により明らかにした. メタノール分子はマンガンクラスター近傍の重要な水素結合ネットワークにはおらず、間接的にマンガンクラスターと相互作用していることがわかり、また、近年計算手法により提案された水素放出機構や基質水分子の取り込みを阻害しないことがわかった。メタノールの位置解明は、プロトン放出や基質水分子の取り込み機構解明への手がかりとなる重要な成果で、The journal of physical chemistry letters誌に2017年1月に掲載された.(Nagashima and Mino, J Phys Chem Lett, 2017, 8, 621-625)

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2017 2016 2015 2014

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Location of Methanol on the S2 State Mn Cluster in Photosystem II Studied by Proton Matrix Electron Nuclear Double Resonance2017

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Hiroyuki Mino
    • Journal Title

      The journal of physical chemistry letters

      Volume: 8 Issue: 3 Pages: 621-625

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.7b00110

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Regulated Electron Tunneling of Photoinduced Primary Charge-Separated State in the Photosystem II Reaction Center2017

    • Author(s)
      M. Hasegawa, H. Nagashima, R. Minobe, T. Tachikawa, *H. Mino and *Y. Kobori
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. Lett.

      Volume: 8 Issue: 6 Pages: 11791184-11791184

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.7b00044

    • NAID

      120006305568

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hyperfine Sublevel Correlation Spectroscopy Studies of Iron-Sulfur Cluster in Rieske Protein from Green Sulfur Bacterium Chlorobaculum tepidum2017

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Hiraku Kishimoto, Risa Mutton, Naotaka Terashima, Hirozo Oh-Oka, Genji Kurisu, Hiroyuki Mino
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 121 Issue: 12 Pages: 2543-2553

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.6b12968

    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Electronic Structure of Manganese Cluster in Photosystem II Investigated by ESR2017

    • Author(s)
      Mizue Asada, Hiroki Nagashima, Hiroyuki Mino
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 57 Issue: 1 Pages: 011-014

    • DOI

      10.2142/biophys.57.011

    • NAID

      130005296470

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proton matrix ENDOR studies on Ca2+-depleted and Sr2+-substituted Mn cluster in photosystem II2015

    • Author(s)
      Nagashima,H., Nakajima, Y., Shen, J-R. and Mino, H.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem

      Volume: 290 Issue: 47 Pages: 28166-28174

    • DOI

      10.1074/jbc.m115.675496

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 光合成酸素発生中心マンガンクラスター近傍のメタノールの結合サイト2017

    • Author(s)
      長嶋宏樹、三野広幸
    • Organizer
      生物物理中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2017-03-06
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Chemical properties of terminal water ligands of the Mn cluster investigated ENDOR2016

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Hiroyuki Mino
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 酸素発生複合体近傍の水素結合ネットワーク構造と役割2016

    • Author(s)
      長嶋宏樹、三野広幸
    • Organizer
      第54回電子スピンサイエンス学会年会
    • Place of Presentation
      大阪市立大学
    • Year and Date
      2016-11-10
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Substrate water sites of the water oxidation studies by ENDOR on the Mn cluster modified by ammonia and deuteron2016

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Hiroyuki Mino
    • Organizer
      The 17th International Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      MECC Maastricht, Maastricht, The Netherlands,
    • Year and Date
      2016-08-07
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 電子核二重共鳴法によるアンモニアの結合したMnクラスター近傍の水素結合構造の解明2016

    • Author(s)
      長嶋宏樹、三野広幸
    • Organizer
      ESRフォーラム研究会
    • Place of Presentation
      神戸大学
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] 電子核二重共鳴法による酸素発生複合体へのアンモニアの結合サイトの同定2016

    • Author(s)
      長嶋宏樹、三野広幸
    • Organizer
      生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2016-06-24
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] Proton matrix ENDOR study on the structure of Ca2+-depleted and NH3-binding Mn cluster in photosystem II2016

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Hiroyuki Mino
    • Organizer
      The 4th Awaji International workshop on Electron Spin Science and Technology
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai, Japan
    • Year and Date
      2016-06-19
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 酸素発生複合体近傍の水素結合ネットワーク構造と役割2016

    • Author(s)
      長嶋宏樹、三野広幸
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京理科大学
    • Year and Date
      2016-05-27
    • Related Report
      2016 Annual Research Report
  • [Presentation] ENDOR Studies on the Hydrogen-Bonding Network Surrounding Mn Cluster2015

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima and Hiroyuki Mino
    • Organizer
      Riken Symposium series: “Metals in Biology
    • Place of Presentation
      RIKEN Wako Campus
    • Year and Date
      2015-06-16
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Proton matrix ENDOR studies on hydrogen-bond structure of S2 state Mn cluster in photosystem II2015

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima, Yoshiki Nakajima, Jian-Ren Shen and Hiroyuki Mino
    • Organizer
      The 3rd Awaji International workshop on Electron Spin Science and Technology
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台
    • Year and Date
      2015-06-14
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ENDOR studies on the role of Ca ion in the water splitting2015

    • Author(s)
      長嶋宏樹
    • Organizer
      第56回植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学
    • Year and Date
      2015-03-16
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ENDOR studies on relationship between the hydrogen bonding network and Ca2+ of Mn cluster in photosystem II2014

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima
    • Organizer
      APES-IES-SEST2014
    • Place of Presentation
      東大寺文化センター
    • Year and Date
      2014-11-12
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ENDOR studies on Ca depleted and Sr substituted Mn cluster in photosystem II2014

    • Author(s)
      長嶋宏樹
    • Organizer
      第18回 日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Proton matrix ENDOR studies on the role of Ca ion in the Mn cluster in photosystem II,2014

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima
    • Organizer
      The 56th annual Rocky mountain conference on Magnetic resonance
    • Place of Presentation
      Copper conference center, USA
    • Year and Date
      2014-07-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ENDOR studies on structural effects induced by Ca2+-depletion and Sr2+-substitution of the Mn cluster in photosystem II2014

    • Author(s)
      Hiroki Nagashima
    • Organizer
      2nd AWEST 2014
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台
    • Year and Date
      2014-06-15
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2015-01-22   Modified: 2024-03-26  

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