| Project/Area Number |
15770001
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Genetics/Genome dynamics
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| Research Institution | Hiroshima University |
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Principal Investigator |
彦坂 暁 広島大学, 総合科学部, 助手 (30263635)
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| Project Period (FY) |
2003 – 2004
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2004)
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| Budget Amount *help |
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2004: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2003: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
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| Keywords | MITE / Xenopus / T2-family / Transposon / Transposase / Terminal Inverted Repeat (TIR) / T2 family |
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| Research Abstract |
T2-MITE転移因子の転移に関係することが予想されるpiggyBac転移酵素遺伝子をアフリカツメガエル(Xenopus laevis)から2種類単離し、mRNAをin vitroで合成した。T2-MITEの1種であるXmixを挿入したプラスミドDNAを、この合成mRNAとともにアフリカツメガエル卵母細胞に顕微注入した。一晩培養したのち、DNAを抽出し、ベクターからのT2-MITEの切り出しが起きているかをPCR法により調べたが、切り出しは確認されなかった。そこで、(1)転移酵素が変異の蓄積によって不活性化している可能性があるので、近縁種から新たなpiggyBac転移酵素遺伝子を単離し、それらとの比較解析によってその可能性を検討する、(2)piggyBac転移酵素自身のTerminal Inverted Repeat (TIR)を単離し、これを用いて再度活性を調べる、(3)T2-MITEの転移に関連する他の転移酵素がゲノム中に存在する可能性をデータベース解析によって検討する、という3つの方向で研究を進めた。(1)については、X.tropicalisから新しいタィプの2種類のpiggyBac転移酵素遺伝子をPCRにより単離し、既知の転移酵素遺伝子との比較解析を行なった。(2)については、X.tropicalisゲノムデータベースの解析からTIRのコンセンサス配列を見いだし、これをプライマーに用いて、X.laevisとX.tropicalisからPCRによってTIRを単離した。(3)については、MITEのTIRの間に転移酵素が採まれた構造をもつ配列をデータベースから網羅的に探索するプログラムを作成し、X.tropicalisとゼブラフイッシュからT2-MITEのTIRの間にある転移酵素候補配列を見いだし、これらについてより詳しい解析を行なった。
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