バラ科果樹におけるSSR遺伝子座の分布と選抜マーカーとしての応用に関する研究

Research Project

Project/Area Number	15780017
Research Category	Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Allocation Type	Single-year Grants
Research Field	Horticulture/Landscape architecture
Research Institution	Ibaraki University
Principal Investigator	井上栄一茨城大学, 農学部, 助教授 (90292482)
Project Period (FY)	2003 – 2004
Project Status	Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help	¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000) Fiscal Year 2004: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000) Fiscal Year 2003: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Keywords	ニホンナシ / セイヨウナシ / SSRマーカー / 遺伝的連鎖地図 / バラ科果樹 / マイクロサテライト / Simple Sequence Repeat / 遺伝子マーカー
Research Abstract	本年度は,バラ科に属する果樹および樹木で報告されているSSRプライマーおよび演者らが前年度までに開発したニホンナシおよびセイヨウナシSSRプライマーをナシ属植物に適用し,検出されたSSR遺伝子座における対立遺伝子の解析と,それらのデータに基づく遺伝学的分類を行った. 本研究で供試した14種類のニホンナシSSRプライマーのうち,7遺伝子座がニホンナシF_1集団で分離を示し11遺伝子座がセイヨウナシF_1集団で分離を示した.また,7種類のセイヨウナシSSRプライマーのうち,6遺伝子座がセイヨウナシF_1集団で分離を示した.ナシ属以外で開発されたプライマーにおいては,リンゴ由来SSRプライマー122種類のうち,71種類においてSSR遺伝子座が増幅され,58遺伝子座がセイヨウナシF_1集団で分離を示した.カエデバアズキナシ(Sorbus torminalis)由来SSRプライマーでは,試験した6種類のうち4種類においてSSR遺伝子座が増幅され,3遺伝子座がセイヨウナシF_1集団で分離を示した.ニホンナシSSR遺伝子座の対立遺伝子の共有率をもとにUPGMA法を用いてナシ属の分子系統樹を作製した.14種類のニホンナシSSRプライマーを用いることによって,2組の枝変わり品種とその原品種を除きすべての遺伝子型を分類することが可能となった.以上の結果より,本研究で作製したニホンナシおよびセイヨウナシSSRプライマー,リンゴおよびカエデバアズキナシで報告されているSSRプライマーをナシ属遺伝資源の分類およびニホンナシとセイヨウナシの遺伝的連鎖地図の作製に有効利用できることが明らかになった. 本年度は上記成果を,園芸学会平成16年度秋季大会において研究発表した.