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Development of drug leads targeting fungal glycans

Research Project

Project/Area Number 15H04496
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Bioorganic chemistry
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

Nakagawa Yu  名古屋大学, 生命農学研究科, 准教授 (90452284)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 竹腰 清乃理  京都大学, 理学研究科, 教授 (10206964)
相田 美砂子  広島大学, 理学研究科, 教授 (90175159)
Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) OJIKA Makoto  名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 教授 (50152492)
Project Period (FY) 2015-04-01 – 2018-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2017)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2017: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2015: ¥7,540,000 (Direct Cost: ¥5,800,000、Indirect Cost: ¥1,740,000)
Keywords抗生物質 / 糖鎖 / pradimicin / 分子認識 / 有機化学 / 生理活性
Outline of Final Research Achievements

This study uncovered the molecular basis of D-mannose (Man) recognition of Pradimicin A (PRM-A) by a combination of X-ray crystallography and solid-state NMR spectroscopy. It is also suggested by binding studies using synthetic oligomannoses that PRM-A could recognize regions in fungal mannans where Man residues at the non-reducing ends are densely located. Based on these findings, we developed two derivatives of PRM-A, PRM-Amide with a less aggregative property and PRM-Azide capable of fluorescently staining fungal mannans.

Report

(4 results)
  • 2017 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2016 Annual Research Report
  • 2015 Annual Research Report
  • Research Products

    (31 results)

All 2018 2017 2016 2015

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (27 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Quinocidin, a cytotoxic antibiotic with an unusual 3,4-dihydroquinolizinium ring and Michael acceptor reactivity toward thiols2017

    • Author(s)
      Nakagawa, Y.; Sawaki, Y.; Kimura, T.; Tomura, T.; Igarashi, Y.; Ojika, M
    • Journal Title

      Chem. Eur. J.

      Volume: 23 Issue: 71 Pages: 17894-17897

    • DOI

      10.1002/chem.201704729

    • NAID

      120006473510

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      Doi, T., Nakagawa, Y., Takegoshi, K.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 56 Issue: 3 Pages: 468-472

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.6b01300

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    • Author(s)
      Nakagawa, Y., Watanabe, Y., Igarashi, Y., Ito, Y. and Ojika, M.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 25 Issue: 15 Pages: 2963-2966

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2015.05.021

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    • Author(s)
      Nakagawa, Y. Ito, Y.
    • Total Pages
      458
    • Publisher
      Royal Society of Chemistry
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Published: 2015-04-16   Modified: 2019-03-29  

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