Uncovering roles of PML bodies in transcription
| Project/Area Number |
15H05586
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Molecular biology
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| Research Institution | Center for Novel Science Initatives, National Institutes of Natural Sciences (2017-2018)
Okazaki Research Facilities, National Institutes of Natural Sciences (2015-2016) |
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Principal Investigator |
Miyanari Yusuke 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 特任准教授 (60469608)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2018)
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| Budget Amount *help |
¥23,530,000 (Direct Cost: ¥18,100,000、Indirect Cost: ¥5,430,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2017: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2016: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Fiscal Year 2015: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
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| Keywords | クロマチン / 核内構造体 / PML body / 転写制御 / PML / クロマチン構造 / 遺伝学 |
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| Outline of Final Research Achievements |
Promyelocytic leukemia (PML) bodies are spherical nuclear structures of 0.1-.0 um in diameter, which are involved in various biological processes including cellular senescence, tumor suppression, and DNA replication and repair. To understand functional mechanism to regulate gene expression by PML, we developed a new technology called ALAP-seq, which allows us to profile genomic region interacting with nuclear bodies. We found that PML body associates with transcriptionally active gene loci and regulates their expression positively. Furthermore, some clustered genes on Y chromosome are coordinately regulated by PML body, which accompanied with epigenetic regulation including Histone modifications and DNA methylation. This study shed light into a novel mechanism to regulate clustered gene loci.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
PML bodyはがん化や老化などに関与することが知られていたが、その分子メカニズムは明らかになっていなかった。これまでPML bodyの生物学的意義を研究する上での大きな障壁は、PML bodyを解析する技術が限られていたことである。そこで、本研究ではALAP-seq法という新たな技術を開発することによって、これまで困難であったPML bodyと相互作用するゲノムDNAを同定することに成功した。ALAP-seq法はPML bodyだけでなく様々な核内構造体を解析することが可能であり、今後この技術を応用することによって核内での転写制御機構が詳細に明らかにすることができると考えられる。
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Report
(5 results)
Research Products
(6 results)
